Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06818
• Subject: XM_011527183.1
• Aligned Length: 3366
• Identities: 3341
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGGCTGGGGCTGGCGGGGGCCTCGGGGTCTGGGGGAACCTGGTGCTGCTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGGGGCTGGCGGGGGCCTCGGGGTCTGGGGGAACCTGGTGCTGCTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGC  74

Query   75  CAGGGCGCCT---------------------GCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCA  127
            ||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGGCGCCTGACCTTCCTTCCCAATTCTCAGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCA  148

Query  128  CCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGT  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGT  222

Query  202  ACTGGAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGG  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGGAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGG  296

Query  276  GTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCA  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCA  370

Query  350  CAGCTCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTC  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGCTCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTC  444

Query  424  CCCGACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCG  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCCGACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCG  518

Query  498  AAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGG  571
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGCACAGCACACACTAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGG  592

Query  572  GAAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGA  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGA  666

Query  646  GTGGAGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCAC  719
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GTGGAGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGAC  740

Query  720  CTACTGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTACTGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGG  814

Query  794  ATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAG  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAG  888

Query  868  ATTGTCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGC  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGTCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGC  962

Query  942  CCTGACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTG  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTG  1036

Query 1016  GCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTG  1089
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTG  1110

Query 1090  TTTTCCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCC  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTTCCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCC  1184

Query 1164  AGTGAGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCAT  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTGAGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCAT  1258

Query 1238  ACCCTCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAAT  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCCTCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAAT  1332

Query 1312  ACCAGTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGC  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACCAGTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGC  1406

Query 1386  ACGTGGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGA  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGTGGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGA  1480

Query 1460  CCAACAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCA  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAACAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCA  1554

Query 1534  TGGGTCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGA  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGGGTCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGA  1628

Query 1608  AGCTGGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTG  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGCTGGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTG  1702

Query 1682  CAGCCACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGG  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGCCACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGG  1776

Query 1756  AAGGCCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAG  1829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGGCCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAG  1850

Query 1830  GGGGCAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCC  1903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGGGCAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCC  1924

Query 1904  TGGAACCCGGGACGCTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTC  1977
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGGAACCCGGGACGTTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTC  1998

Query 1978  TGTGCGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTT  2051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGTGCGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTT  2072

Query 2052  GATCTGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACA  2125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GATCTGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACA  2146

Query 2126  GATCTTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACC  2199
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GATCTTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACC  2220

Query 2200  ATCTGGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGC  2273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATCTGGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGC  2294

Query 2274  CTTTGTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGA  2347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CTTTGTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGA  2368

Query 2348  AGCAGCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGAC  2421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCAGCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGAC  2442

Query 2422  CACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCA  2495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCA  2516

Query 2496  CAGCCAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATG  2569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CAGCCAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATG  2590

Query 2570  ACTGGTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCC  2643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACTGGTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCC  2664

Query 2644  GGTCTCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCT  2717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGTCTCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCT  2738

Query 2718  GGTGTGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGC  2791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GGTGTGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGC  2812

Query 2792  ATTACTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATG  2865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATTACTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATG  2886

Query 2866  GAGAACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCA  2939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GAGAACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCA  2960

Query 2940  CTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGC  3013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGC  3034

Query 3014  AGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACC  3087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACC  3108

Query 3088  CTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAA  3161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAA  3182

Query 3162  GATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGT  3235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  GATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGT  3256

Query 3236  TCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAG  3309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  TCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAG  3330

Query 3310  AACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC  3345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  AACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC  3366