Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06818
- Subject:
- XR_001753731.1
- Aligned Length:
- 3551
- Identities:
- 2455
- Gaps:
- 1087
Alignment
Query 1 ---------------ATGGCTGGGGCTGGCGGGG-------------------GCCTCGGGGT--CTGGG---- 34
|||| ||||||| .||||||..| |||||
Sbjct 1 ATGCAAGGGTGACTCATGG--------GGCGGGGACCAGCCGCTCCTCCCAGCCCCTCGGCCTCACTGGGCGGA 66
Query 35 GGAACCTGGT------GCTG------------------------CTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGG 78
||| .|||| |||| |.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 67 GGA--GTGGTTGAGAGGCTGACTCCGTTTTCTCTGGGTTCCCTCCAGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGG 138
Query 79 GCGCCT---------------------GCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAG 131
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 GCGCCTGACCTTCCTTCCCAATTCTCAGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAG 212
Query 132 CTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTG 205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTG 286
Query 206 GAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCA 279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 GAGACGGCGGCACAACAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCA 360
Query 280 TTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGC 353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 TTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGC 434
Query 354 TCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCG 427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TCCCAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCG 508
Query 428 ACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGC 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 ACGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGC 582
Query 502 ACAGCACACACCAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAA 575
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 ACAGCACACACTAACATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAA 656
Query 576 GAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGG 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGG 730
Query 650 AGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTAC 723
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 731 AGGCTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGACCTAC 804
Query 724 TGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGG 797
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 TGCGTTCAGTGCACTGGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGG 878
Query 798 CCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTG 871
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 CCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTG 952
Query 872 TCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTG 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 TCACTAGTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTG 1026
Query 946 ACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAG 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 ACCTGGGAGGTCCCCGATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAG 1100
Query 1020 AGCAGGGACTCGAAGCACAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTT 1093
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 AGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTT 1174
Query 1094 CCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTG 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CCGTGTGGGTGGGGAAGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTG 1248
Query 1168 AGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCC 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 AGAAACCTCCATATGGAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCC 1322
Query 1242 TCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCA 1315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 TCAGGACTACACCTACTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCA 1396
Query 1316 GTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGT 1389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 GTGTGACAGCTGAGAGACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGT 1470
Query 1390 GGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAA 1463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 GGCTCCAGGCAGAATGTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAA 1544
Query 1464 CAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGG 1537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 CAGCACCATTGCTTTGCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGG 1618
Query 1538 TCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCT 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 TCAGGGAAGGCATGACTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCT 1692
Query 1612 GGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGC 1685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 GGCAGCCTGTACCACCTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGC 1766
Query 1686 CACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGG 1759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767 CACTGCTCCCAATGAGGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGG 1840
Query 1760 CCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGG 1833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 CCCCTGGAGACCCCCACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGG 1914
Query 1834 CAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGA 1907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1915 CAAGATCCCCAAGCGAATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGA 1988
Query 1908 ACCCGGGACGCTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTG 1981
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 ACCCGGGACGTTGTACAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTG 2062
Query 1982 CGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATC 2055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 CGTCCACATACCCAGACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATC 2136
Query 2056 TGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATC 2129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 TGGTCCTGCCCCCAGGGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATC 2210
Query 2130 TTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCT 2203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 TTCATGTGGGGAGGCTGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCT 2284
Query 2204 GGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTT 2277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 GGGACGGAATGAAGGTCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTT 2358
Query 2278 GTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCA 2351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 GTGGGCATCCTCCTGTTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCA 2432
Query 2352 GCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAG----------------------------------------- 2384
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 GCAGAAACCAGAACTCAGGGATCTGGTCTTTAGACAGGGAGGCCACGACGATTTTGGAGAAAGGTGTTCCCTGG 2506
Query 2385 -------------------------------------------------------------------------- 2384
Sbjct 2507 AGTAGTGGATATAGACTCCAAGCCATGGTGATAGGATGACAGGAAGGAGAAAAAAACTGGTCTGCATGAGAAGT 2580
Query 2385 CTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTT 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 CTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGGGACAGCAACTGTGGTT 2654
Query 2459 TTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGCTTCGGCTTCAGAGAAC 2532
||||||||||||||||
Sbjct 2655 TTGCAGACGAGTACCA---------------------------------------------------------- 2670
Query 2533 AACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGAAGCCCATCCATGAGGA 2606
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 2607 GCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAGTTCATTGCAACCCAGG 2680
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 2681 GTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCACACCCTGGTCATGCTG 2754
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 2755 ACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGCAGCCCTGCACCCATGG 2828
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 2829 GCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAACTGCTGCTCCTCCAGG 2902
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 2903 TGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCACGGCGTTCCCTCCTCC 2976
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 2977 CCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGGAGGGAGGCCCACCCAT 3050
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 3051 TGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTGCTCCGGCAGCTGCAGT 3124
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 3125 CCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTTGATGGTGCAGACTGAG 3198
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 3199 GCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGGCCCCAGCCGAGAAGGA 3272
Sbjct 2671 -------------------------------------------------------------------------- 2670
Query 3273 AGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCCCACAAGTTGGAGGTC 3345
Sbjct 2671 ------------------------------------------------------------------------- 2670