Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_06931
- Subject:
- XM_017313226.1
- Aligned Length:
- 2529
- Identities:
- 1989
- Gaps:
- 243
Alignment
Query 1 ATGCTTGTCGCCGGTCTTC-TTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCC-ACCCAGGAC 72
||||||||| .|.|.|||| |.||||||||||||||.||||||||||||||||| |.||.|||| |.|||||||
Sbjct 1 ATGCTTGTC-ACTGCCTTCATCCTCTGGGCTTCCCTGCTGACCGGGGCCTGGCC-TGCTACCCCTATCCAGGAC 72
Query 73 CACCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAA 146
||.||.||.|||||.||..|.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 73 CAGCTTCCAGCCACACCTAGAGTCCGACTGTCATTCAAAGAACTTAAGGCCACCGGTACCGCCCACTTCTTCAA 146
Query 147 CTTCCTGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCA 220
|||.|||||||||||.||.||||||.|||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 147 CTTTCTGCTCAACACTACAGACTACAGAATCCTGCTCAAGGATGAGGACCATGACCGCATGTATGTGGGCAGCA 220
Query 221 AGGACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCA 294
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 221 AGGACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCATGACATCAACCGAGAGCCCCTTATTATCCATTGGGCAGCCTCCCCG 294
Query 295 CAGCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCA 368
||||||||.|||||.|||.|.||.|||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct 295 CAGCGCATTGAGGAGTGCATACTGTCAGGCAAGGATGGCAATGGAGAGTGTGGTAACTTCGTCCGGCTCATCCA 368
Query 369 GCCCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCG 442
|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 369 GCCTTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGTGGGACCGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGTG 442
Query 443 GACGCCGCGCCCAGGCCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGT 516
|.||.|||||.||||||..|||.||||||||||..||||.||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 443 GCCGTCGCGCACAGGCCCTACCGTGGACCCAGATGCAGGTGGTCAGAGGCCGAGGCAGCAGGGCCACCGATGGT 516
Query 517 GCCCTCCGCCCGATGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGG 590
|||..||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||||||
Sbjct 517 GCCGACCGCCCGACGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGAAACTGGAGTCAGG 590
Query 591 GAAGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTG 664
.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 591 AAAAGGCAAATGTCCCTATGACCCCAAGCTGGACACAGCCTCAGCCCTCATCAATGAGGAACTCTATGCAGGAG 664
Query 665 TGTACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGAT 738
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 665 TGTACATCGATTTTATGGGTACCGATGCAGCCATTTTCCGCACGCTGGGGAAGCAGACAGCCATGCGCACAGAT 738
Query 739 CAGTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAA 812
||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 739 CAGTACAACTCCCGGTGGCTCAATGATCCTTCCTTCATACATGCTGAGCTCATCCCTGACAGTGCAGAGCGCAA 812
Query 813 TGATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCA 886
|||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.|||.||.|||||.|||||||
Sbjct 813 TGACGATAAACTCTACTTCTTCTTCCGAGAGCGCTCGGCAGAGGCGCCACAGAACCCTGCTGTGTATGCCCGCA 886
Query 887 TCGGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCG 960
||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 887 TCGGGCGCATCTGCCTCAACGATGACGGTGGCCATTGCTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCT 960
Query 961 CGGCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCA 1034
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 961 CGGCTCGTCTGCTCCGTGCCAGGCGAGGATGGTATTGAGACCCACTTCGACGAACTCCAGGATGTGTTTGTCCA 1034
Query 1035 GCAGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTG 1108
|||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1035 GCAGACCCAGGACGTCAGGAACCCAGTCATTTATGCTGTCTTTACCTCTTCAGGCTCTGTGTTCCGAGGGTCTG 1108
Query 1109 CCGTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAAC 1182
|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1109 CAGTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATCCGCATGGTCTTCAATGGGCCTTTTGCTCACAAGGAGGGCCCCAAC 1182
Query 1183 TACCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCC 1256
||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TATCAATGGATGCCCTTCTCAGGAAAGATGCCCTATCCTCGGCCTGGCACATGCCCTGGTGGAACCTTCACGCC 1256
Query 1257 ATCTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGG 1330
.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||||
Sbjct 1257 CTCGATGAAGTCCACTAAGGACTACCCTGATGAAGTGATCAACTTCATGCGCACTCATCCGCTCATGTACCAGG 1330
Query 1331 CCGTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTG 1404
||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||
Sbjct 1331 CCGTCTACCCGCTCCAGCGGCGACCCCTGGTGGTCCGTACAGGCGCTCCCTACCGCCTCACCACTGTCGCTGTG 1404
Query 1405 GACCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGT 1478
|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405 GACCAGGTGGATGCAGCTGATGGACGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGT 1478
Query 1479 CATTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGATGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAG 1552
|||.||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1479 CATCGTGCTGCCCAAGGACGACCAGGAGGTGGAAGAGCTGATGCTAGAGGAAGTGGAGGTCTTCAAGGAACCAG 1552
Query 1553 CACCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACAC 1626
||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CACCTGTTAAGACCATGACCATCTCTTCCAAGAGGCAACAACTGTATGTGGCCTCAGCCGTGGGTGTCACACAC 1626
Query 1627 CTGAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGC 1700
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1627 CTGAGCCTGCACCGCTGCCAGGCCTATGGAGCTGCCTGTGCCGACTGCTGCCTTGCCCGCGATCCCTACTGTGC 1700
Query 1701 CTGGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACG 1774
|||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1701 CTGGGATGGCCAGGCCTGCTCTCGCTACACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGTCGCCGGCAAGATGTCCGCCACG 1774
Query 1775 GAAACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGC 1848
|.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1775 GGAACCCTATCAGACAGTGCCGTGGTTTCAATTCCAATGCAAACAAGAATGCCGTAGAGTCTGTGCAGTACGGA 1848
Query 1849 GTGGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCG 1922
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1849 GTGGCCGGCAGCGCAGCTTTCCTTGAGTGTCAGCCCCGCTCACCTCAAGCCACTGTCAAGTGGCTGTTCCAGCG 1922
Query 1923 AGATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTG------------------------- 1971
||||||..||||.||||||||.|||.| ||| ||||||
Sbjct 1923 AGATCCCAGTGATCGGCGCCGTGAGGT-------GAG------TTCCTGTGTCCTTTCCCCACCCCCCACCCCC 1983
Query 1972 -CGCACAGAGCAGGGCT-TGTTGCTCCGTGCACT---GCAGCT------CAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGC 2034
|.|.||| ||||| ||.|||.|||||.| | |.||.| ||||| ||| |.||||
Sbjct 1984 ACCCCCAG----GGGCTATGCTGCACCGTGGA-TATGGGAGTTCTTTTACAGCG---GTG------AGTCCT-- 2041
Query 2035 ACAGCCACTGAGA-ACAACTTTA--AGCACGTCGTCACACGAGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGC--- 2102
||||| |.||.|.|| || .||.|.||..|..|.||||| |..|.|||| ||||.||
Sbjct 2042 --------TGAGAGAGAAATGTACTAG--TGTGGCCAGCCTGGGGCAGC--CCAGCACTG----GGGAGGCAAA 2099
Query 2103 CGTCCATGCTGCCCTCTT---------CCCA-------CCACTG-------TCCATGAGCGCCCCGCCA----C 2149
.| ||.||.|..||||| .||| |.||.| ||||.||||.||||.||| .
Sbjct 2100 GG--CAGGCGGATCTCTTGAGTTCAAGGCCAGTCTGGTCTACAGAGCAAGTTCCAGGAGCACCCCACCAGGGCT 2171
Query 2150 CCCCAGGCGCAGGCCCCCCAA--------------CGCCTCCTTAC-----CAGGAGTTAGCCCAGCT--GCTG 2202
.||||| ||...|||.|| ||..||..||| | ||.||||..||..|| ..||
Sbjct 2172 ACCCAG----AGAAACCCAAAAGAACAAAAAATTCCGTATCTGTACTCTGTC-GGGGTTATACCTTCTTGTTTG 2240
Query 2203 GCCCAGCCAGAAGTGGGCCTCATCCACCAGTA----------CTGCCAGGG----TTACTGG-------CGCCA 2255
|..||.| |.||||| |.| .|.|||||| ||| .|| ||.|||| |.||.
Sbjct 2241 GAACATC---ACGTGGG--TGA-GCTCCAGTATATGGAAATTCTG---TGGATATTTTCTGGGAAAGCCCTCCC 2305
Query 2256 TGTGCCCCCCAGCCCCAGG-GAGGCTCCA---GGG----GCACCCCGGTCTCC--------------------- 2300
.|||..||.|..|||..|| .|.||| | ||| |||....|||.|.|
Sbjct 2306 CGTGTTCCTCTTCCCGTGGAAATGCT--ATGCGGGTGTCGCAATTGGGTATTCTCATTAAATGGAAATTCTGTG 2377
Query 2301 TGAGCCCCA----------------GGACCAGAAA--AAGCCCCGGAACCGCCGGC---ACC---ACCCTCCGG 2350
||.||.||| .|..|||||| |.|||| ||||||..| ||| ||||.|.||
Sbjct 2378 TGCGCTCCAAAATTTTCTCATTCATTGTTCAGAAACCACGCCC----ACCGCCCCCCCAACCCCAACCCCCGGG 2447
Query 2351 ACA-CA------- 2355
.|| ||
Sbjct 2448 TCATCATCCTTCC 2460