Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06931
• Subject: XM_017313228.1
• Aligned Length: 2357
• Identities: 2099
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGCTTGTCGCCGGTCTTC-TTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCC-ACCCAGGAC  72
            ||||||||| .|.|.|||| |.||||||||||||||.||||||||||||||||| |.||.|||| |.|||||||
Sbjct    1  ATGCTTGTC-ACTGCCTTCATCCTCTGGGCTTCCCTGCTGACCGGGGCCTGGCC-TGCTACCCCTATCCAGGAC  72

Query   73  CACCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAA  146
            ||.||.||.|||||.||..|.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct   73  CAGCTTCCAGCCACACCTAGAGTCCGACTGTCATTCAAAGAACTTAAGGCCACCGGTACCGCCCACTTCTTCAA  146

Query  147  CTTCCTGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCA  220
            |||.|||||||||||.||.||||||.|||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  147  CTTTCTGCTCAACACTACAGACTACAGAATCCTGCTCAAGGATGAGGACCATGACCGCATGTATGTGGGCAGCA  220

Query  221  AGGACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCA  294
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  221  AGGACTACGTGCTGTCCCTGGACCTGCATGACATCAACCGAGAGCCCCTTATTATCCATTGGGCAGCCTCCCCG  294

Query  295  CAGCGCATCGAGGAATGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCA  368
            ||||||||.|||||.|||.|.||.|||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  295  CAGCGCATTGAGGAGTGCATACTGTCAGGCAAGGATGGCAATGGAGAGTGTGGTAACTTCGTCCGGCTCATCCA  368

Query  369  GCCCTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCG  442
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  369  GCCTTGGAACCGAACACACCTGTATGTGTGTGGGACCGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGTG  442

Query  443  GACGCCGCGCCCAGGCCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGT  516
            |.||.|||||.||||||..|||.||||||||||..||||.||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  443  GCCGTCGCGCACAGGCCCTACCGTGGACCCAGATGCAGGTGGTCAGAGGCCGAGGCAGCAGGGCCACCGATGGT  516

Query  517  GCCCTCCGCCCGATGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGG  590
            |||..||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.||||||||
Sbjct  517  GCCGACCGCCCGACGCCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGAAACTGGAGTCAGG  590

Query  591  GAAGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTG  664
            .||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  591  AAAAGGCAAATGTCCCTATGACCCCAAGCTGGACACAGCCTCAGCCCTCATCAATGAGGAACTCTATGCAGGAG  664

Query  665  TGTACATCGATTTTATGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGAT  738
            |||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  665  TGTACATCGATTTTATGGGTACCGATGCAGCCATTTTCCGCACGCTGGGGAAGCAGACAGCCATGCGCACAGAT  738

Query  739  CAGTACAACTCCCGGTGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAA  812
            ||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  739  CAGTACAACTCCCGGTGGCTCAATGATCCTTCCTTCATACATGCTGAGCTCATCCCTGACAGTGCAGAGCGCAA  812

Query  813  TGATGATAAGCTTTACTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCA  886
            |||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||.|||.||.|||||.|||||||
Sbjct  813  TGACGATAAACTCTACTTCTTCTTCCGAGAGCGCTCGGCAGAGGCGCCACAGAACCCTGCTGTGTATGCCCGCA  886

Query  887  TCGGGCGCATTTGCCTGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCG  960
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  887  TCGGGCGCATCTGCCTCAACGATGACGGTGGCCATTGCTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCT  960

Query  961  CGGCTCGTCTGCTCTGTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCA  1034
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  961  CGGCTCGTCTGCTCCGTGCCAGGCGAGGATGGTATTGAGACCCACTTCGACGAACTCCAGGATGTGTTTGTCCA  1034

Query 1035  GCAGACCCAGGACGTGAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTG  1108
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1035  GCAGACCCAGGACGTCAGGAACCCAGTCATTTATGCTGTCTTTACCTCTTCAGGCTCTGTGTTCCGAGGGTCTG  1108

Query 1109  CCGTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAAC  1182
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1109  CAGTGTGTGTCTACTCCATGGCTGATATCCGCATGGTCTTCAATGGGCCTTTTGCTCACAAGGAGGGCCCCAAC  1182

Query 1183  TACCAGTGGATGCCCTTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCC  1256
            ||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  TATCAATGGATGCCCTTCTCAGGAAAGATGCCCTATCCTCGGCCTGGCACATGCCCTGGTGGAACCTTCACGCC  1256

Query 1257  ATCTATGAAGTCCACCAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGG  1330
            .||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||..||.||.|||||||||||||
Sbjct 1257  CTCGATGAAGTCCACTAAGGACTACCCTGATGAAGTGATCAACTTCATGCGCACTCATCCGCTCATGTACCAGG  1330

Query 1331  CCGTGTACCCTCTGCAGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTG  1404
            ||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||.|.||.|||
Sbjct 1331  CCGTCTACCCGCTCCAGCGGCGACCCCTGGTGGTCCGTACAGGCGCTCCCTACCGCCTCACCACTGTCGCTGTG  1404

Query 1405  GACCAGGTGGATGCAGCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGT  1478
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GACCAGGTGGATGCAGCTGATGGACGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGT  1478

Query 1479  CATTGTGCTGCCCAAGGATGACCAGGAGATGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAG  1552
            |||.||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1479  CATCGTGCTGCCCAAGGACGACCAGGAGGTGGAAGAGCTGATGCTAGAGGAAGTGGAGGTCTTCAAGGAACCAG  1552

Query 1553  CACCCGTCAAGACCATGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACAC  1626
            ||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  CACCTGTTAAGACCATGACCATCTCTTCCAAGAGGCAACAACTGTATGTGGCCTCAGCCGTGGGTGTCACACAC  1626

Query 1627  CTGAGCCTGCACCGCTGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGC  1700
            |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1627  CTGAGCCTGCACCGCTGCCAGGCCTATGGAGCTGCCTGTGCCGACTGCTGCCTTGCCCGCGATCCCTACTGTGC  1700

Query 1701  CTGGGATGGCCAGGCCTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACG  1774
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1701  CTGGGATGGCCAGGCCTGCTCTCGCTACACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGTCGCCGGCAAGATGTCCGCCACG  1774

Query 1775  GAAACCCCATCAGGCAGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGC  1848
            |.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1775  GGAACCCTATCAGACAGTGCCGTGGTTTCAATTCCAATGCAAACAAGAATGCCGTAGAGTCTGTGCAGTACGGA  1848

Query 1849  GTGGCCGGCAGCGCAGCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCG  1922
            |||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1849  GTGGCCGGCAGCGCAGCTTTCCTTGAGTGTCAGCCCCGCTCACCTCAAGCCACTGTCAAGTGGCTGTTCCAGCG  1922

Query 1923  AGATCCTGGTGACCGGCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCC  1996
            ||||||..||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|
Sbjct 1923  AGATCCCAGTGATCGGCGCCGTGAGATTCGCGCAGAGGACCGCTTCCTGCGTACAGAGCAGGGGCTGTTGCTTC  1996

Query 1997  GTGCACTGCAGCTCAGCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACA  2070
            |.||.||||||||..|.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.
Sbjct 1997  GCGCCCTGCAGCTTGGTGACCGCGGCCTCTACTCCTGCACGGCCACTGAGAACAACTTCAAGCACATCGTCACG  2070

Query 2071  CGAGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCC  2144
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|..||||||.|||
Sbjct 2071  CGGGTGCAGCTGCATGTACTGGGCCGGGATGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCCCCACTGGCTGTGAGCGTCCC  2144

Query 2145  GCCACCCCCAGGCGCAGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGG  2218
            .|||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 2145  TCCACCTCCTGGCACAGGCCCTCCAACGCCTCCTTACCAGGAGCTGGCCCAGCTCCTAGCCCAGCCGGAAGTGG  2218

Query 2219  GCCTCATCCACCAGTACTGCCAGGGTTACTGGCGCCATGTGCCCCCCAGCCCCAGGGAGGCTCCAGGGGCACCC  2292
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||..
Sbjct 2219  GCCTCATCCATCAGTACTGCCAGGGTTACTGGCGCCACGTGCCCCCCAGACCCAGGGAGGCGCCAGGAGCACTT  2292

Query 2293  CGGTCTCCTGAGCCCCAGGACCAGAAAAAGCCCCGGAACCGCCGGCACCACCCTCCGGACACA  2355
            .||.|||||||.|.||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2293  AGGCCTCCTGAACTCCAGGACCAGAAAAAGCCGAGGAACCGCCGCCACCACCCTCCGGACACA  2355