Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_06931
• Subject: XR_940487.2
• Aligned Length: 2490
• Identities: 2223
• Gaps: 266

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGGCCGCTAGCGCGGACCGGCCCAACGGGAGCCGCTCCGTGCCGCCGCCGCCGCCCGGGCGCCCAGGCCCCGC  74

Query    1  -------------------------------------------------------------ATGCTTGTCGCCG  13
                                                                         |||||||||||||
Sbjct   75  CGCTGCGGAAGAGGTTTCTAGAGAGTGGAGCCTGCTTCCTGGGCCCTAGGCCCCTCCCACAATGCTTGTCGCCG  148

Query   14  GTCTTCTTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCCACCCAGGACCACCTCCCGGCCACG  87
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTCTTCTTCTCTGGGCTTCCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCCACCCAGGACCACCTCCCGGCCACG  222

Query   88  CCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAACTTCCTGCTCAACAC  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAAGAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAACTTCCTGCTCAACAC  296

Query  162  AACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCAAGGACTACGTGCTGT  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGAGGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCAAGGACTACGTGCTGT  370

Query  236  CCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCACAGCGCATCGAGGAA  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCATTATACACTGGGCAGCCTCCCCACAGCGCATCGAGGAA  444

Query  310  TGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCAGCCCTGGAACCGAAC  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAACTTCGTCAGGCTCATCCAGCCCTGGAACCGAAC  518

Query  384  ACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCGGACGCCGCGCCCAGG  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACACCTGTATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTATGTGAACCGCGGACGCCGCGCCCAGG  592

Query  458  CCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGTGCCCTCCGCCCGATG  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACACCATGGACCCAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGGATGGTGCCCTCCGCCCGATG  666

Query  532  CCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGGAAGGGCAAGTGTCC  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCACAGCCCCACGCCAGGATTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGGAAGGGCAAGTGTCC  740

Query  606  GTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTGTACATCGATTTTA  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACGATCCCAAGCTGGACACAGCATCGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTGTACATCGATTTTA  814

Query  680  TGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGATCAGTACAACTCCCGG  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGCACTGATGCAGCCATCTTCCGCACACTTGGAAAGCAGACAGCCATGCGCACGGATCAGTACAACTCCCGG  888

Query  754  TGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAATGATGATAAGCTTTA  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGCTGAACGACCCGTCGTTCATCCATGCTGAGCTCATTCCTGACAGTGCGGAGCGCAATGATGATAAGCTTTA  962

Query  828  CTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCATCGGGCGCATTTGCC  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTCTTCTTCCGTGAGCGGTCGGCAGAGGCGCCGCAGAGCCCCGCGGTGTACGCCCGCATCGGGCGCATTTGCC  1036

Query  902  TGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCGCGGCTCGTCTGCTCT  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAACGATGACGGTGGTCACTGTTGCCTGGTCAACAAGTGGAGCACATTCCTGAAGGCGCGGCTCGTCTGCTCT  1110

Query  976  GTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCAGCAGACCCAGGACGT  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCCCGGGCGAGGATGGCATTGAGACTCACTTTGATGAGCTCCAGGACGTGTTTGTCCAGCAGACCCAGGACGT  1184

Query 1050  GAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTGCCGTGTGTGTCTACT  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGAACCCTGTCATTTACGCTGTCTTTACCTCCTCTGGCTCCGTGTTCCGAGGCTCTGCCGTGTGTGTCTACT  1258

Query 1124  CCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAACTACCAGTGGATGCCC  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCATGGCTGATATTCGCATGGTCTTCAACGGGCCCTTTGCCCACAAAGAGGGGCCCAACTACCAGTGGATGCCC  1332

Query 1198  TTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCCATCTATGAAGTCCAC  1271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCTCAGGGAAGATGCCCTACCCACGGCCGGGCACGTGCCCTGGTGGAACCTTCACGCCATCTATGAAGTCCAC  1406

Query 1272  CAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGGCCGTGTACCCTCTGC  1345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGGATTATCCTGATGAGGTGATCAACTTCATGCGCAGCCACCCACTCATGTACCAGGCCGTGTACCCTCTGC  1480

Query 1346  AGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTGGACCAGGTGGATGCA  1419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCGGCGGCCCCTGGTAGTCCGCACAGGTGCTCCCTACCGCCTTACCACTATTGCCGTGGACCAGGTGGATGCA  1554

Query 1420  GCCGACGGGCGCTATGAGGTGCTTTTCCTGGGCACAGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGTCATTGTGCTGCCCAA  1493
            ||||||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCGACGGGCGCTATG-------------------AGACCGCGGGACAGTGCAGAAGGTCATTGTGCTGCCCAA  1609

Query 1494  GGATGACCAGGAGATGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAGCACCCGTCAAGACCA  1567
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  GGATGACCAGGAGTTGGAGGAGCTCATGCTGGAGGAGGTGGAGGTCTTCAAGGATCCAGCACCCGTCAAGACCA  1683

Query 1568  TGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACACCTGAGCCTGCACCGC  1641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  TGACCATCTCTTCTAAGAGGCAACAACTCTACGTGGCGTCAGCCGTGGGTGTCACACACCTGAGCCTGCACCGC  1757

Query 1642  TGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGCCTGGGATGGCCAGGC  1715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758  TGCCAGGCGTATGGGGCTGCCTGTGCTGACTGCTGCCTTGCCCGGGACCCTTACTGTGCCTGGGATGGCCAGGC  1831

Query 1716  CTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACGGAAACCCCATCAGGC  1789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832  CTGCTCCCGCTATACAGCATCCTCCAAGAGGCGGAGCCGCCGGCAGGACGTCCGGCACGGAAACCCCATCAGGC  1905

Query 1790  AGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGCGTGGCCGGCAGCGCA  1863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906  AGTGCCGTGGGTTCAACTCCAATGCCAACAAGAATGCCGTGGAGTCTGTGCAGTATGGCGTGGCCGGCAGCGCA  1979

Query 1864  GCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCGAGATCCTGGTGACCG  1937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980  GCCTTCCTTGAGTGCCAGCCCCGCTCGCCCCAAGCCACTGTTAAGTGGCTGTTCCAGCGAGATCCTGGTGACCG  2053

Query 1938  GCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCCGTGCACTGCAGCTCA  2011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054  GCGCCGAGAGATTCGTGCAGAGGACCGCTTCCTGCGCACAGAGCAGGGCTTGTTGCTCCGTGCACTGCAGCTCA  2127

Query 2012  GCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACACGAGTGCAGCTGCAT  2085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128  GCGATCGTGGCCTCTACTCCTGCACAGCCACTGAGAACAACTTTAAGCACGTCGTCACACGAGTGCAGCTGCAT  2201

Query 2086  GTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCCGCCACCCCCAGGCGC  2159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202  GTACTGGGCCGGGACGCCGTCCATGCTGCCCTCTTCCCACCACTGTCCATGAGCGCCCCGCCACCCCCAGGCGC  2275

Query 2160  AGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGGGCCTCATCCACCAGT  2233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276  AGGCCCCCCAACGCCTCCTTACCAGGAGTTAGCCCAGCTGCTGGCCCAGCCAGAAGTGGGCCTCATCCACCAGT  2349

Query 2234  ACTGCCAGGGTTACTGGCGCCATGTGCCCCCCAGCCCCAGGGAGGCTCCAGGGGCACCCCGGTCTCCTGAGCCC  2307
            ||||||||||                                                                
Sbjct 2350  ACTGCCAGGG----------------------------------------------------------------  2359

Query 2308  CAGGACCAGAAAAAGCCCCGGAACCGCCGGCACCACCCTCCGGACACA  2355
                                                            
Sbjct 2360  ------------------------------------------------  2359