Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07016
- Subject:
- XM_017023607.2
- Aligned Length:
- 1158
- Identities:
- 834
- Gaps:
- 273
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGAAGCTCCCCCACCCCCAACCCCACCCCTTCCTTCCGGAAGCAAATCTAAGTCCAGCCCCGGCTCCAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCCTCCCACAGTGGACCTAGGAAACCCTCAGCTCAGAGAACAACCCTGCATTCCCCACACAACACCCACAATC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGCCACTGCGGGCGAGGAGGGCACGAGGCCAGGTTCCCAAGAGCTCAGCTCTGGCCCCTAGTAGCAGCTCAGTT 222
Query 1 ---------------------------------------------------ATGAAGCTGATCCAGGACACCTC 23
|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCAATGGGCCGTGTTTGTCCTGGAGCCCAGATGGACTGTGGCCAGGAACATGGAGCTGATCCAGGACACCTC 296
Query 24 CCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA 97
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCGCCCGCCACTGGAGTACGTGAAGGGGGTCCCGCTCATCAAGTACTTTGCAGAGGCACTGGGGCCCCTGCAGA 370
Query 98 GCTTCCAAGCCCGACCTGATGACCTGCTCATCAACACCTACCCCAAGTCTGGCACCACCTGGGTGAGCCAGATA 171
|||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 371 GCTTCCAGGCCCGGCCTGATGACCTGCTCATCAGCACCTACCCCAAGTCCGGCACTACCTGGGTAAGCCAGATT 444
Query 172 CTGGACATGATCTACCAGGGCGGCGACCTAGAGAAGTGTAACCGGGCTCCCATCTACGTACGGGTGCCCTTCCT 245
||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||.|.|.||||||||||||||
Sbjct 445 CTGGACATGATCTACCAGGGTGGTGACCTGGAGAAGTGTCACCGAGCTCCCATCTTCATGCGGGTGCCCTTCCT 518
Query 246 TGAGGTTAATGATCCAGGGGAACCCTCAGGGCTGGAGACTCTGAAAGACACACCGCCCCCACGGCTCATCAAGT 319
||||.|.||.|..||||||...|||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|.|||.
Sbjct 519 TGAGTTCAAAGCCCCAGGGATTCCCTCAGGGATGGAGACTCTGAAAGACACACCGGCCCCACGACTCCTGAAGA 592
Query 320 CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCTCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGAAAC 393
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CACACCTGCCCCTGGCTCTGCTCCCCCAGACTCTGTTGGATCAGAAGGTCAAGGTGGTCTATGTTGCCCGCAAC 666
Query 394 CCAAAGGACGTGGCGGTCTCCTACTACCATTTCCACCGTATGGAAAAGGCGCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGA 467
.|||||||.|||||.||.|||||||||||.|||.|||..||||..||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAAAGGATGTGGCAGTTTCCTACTACCACTTCTACCACATGGCCAAGGTGCACCCTGAGCCTGGGACCTGGGA 740
Query 468 CAGCTTCCTGGAAAAGTTCATGGCTGGAGAAGTGTCCTACGGGTCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGG 541
||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGCTTCCTGGAGAAGTTCATGGTCGGAGAAGTGTCCTACGGATCCTGGTACCAGCACGTGCAGGAGTGGTGGG 814
Query 542 AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCCAAAAGGGAGATTCAA 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 AGCTGAGCCGCACCCACCCTGTTCTCTACCTCTTCTATGAAGACATGAAGGAGAACCCGAAAAGGGAGATTCAA 888
Query 616 AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACCATGGACTTCATGGTTCAGCACACGTCGTTCAA 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AAGATCCTGGAGTTTGTGGGGCGCTCCCTGCCAGAGGAGACCGTGGACTTCGTGGTTCAGCACACGTCGTTCAA 962
Query 690 GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCCCCAGGAGCTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT 763
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGATGAAGAAGAACCCTATGACCAACTACACCACCGTCCCCCAGGAGTTCATGGACCACAGCATCTCCCCCT 1036
Query 764 TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCATGAGGAAAGGCATGGCTGGGGACTGGAAGACCACCTTCACCGTGGCGCAGAATGAGCGCTTCGATGCGGAC 1110
Query 838 TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TATGCGGAGAAGATGGCAGGCTGCAGCCTCAGCTTCCGCTCTGAGCTG 1158