Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07117
• Subject: NM_011673.3
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1088
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCTGGATCTGGCCTTGGAGGGAATGGCCGTCTTCGGGTTCGTCCTCTTCTTGGTGCTGTGGCTGAT  74
            ||||||||||||||.||||||..|||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCTGCTGGACCTGGCCCAGGAGGGAATGGCCTTGTTCGGCTTCGTGCTCTTCGTGGTGCTGTGGCTGAT  74

Query   75  GCATTTCATGGCTATCATCTACACCCGATTACACCTCAACAAGAAGGCAACTGACAAACAGCCTTATAGCAAGC  148
            ||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  GCATTTCATGTCCATCATCTACACCCGGTTACACCTCAACAAGAAGGCAACAGACAAACAGCCGTATAGCAAGC  148

Query  149  TCCCAGGTGTCTCTCTTCTGAAACCACTGAAAGGGGTAGATCCTAACTTAATCAACAACCTGGAAACATTCTTT  222
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  149  TCCCTGGTGTCTCTCTTCTGAAGCCACTGAAGGGGGTGGATCCTAACCTAATCAACAACTTGGAGACATTCTTT  222

Query  223  GAATTGGATTATCCCAAATATGAAGTGCTCCTTTGTGTACAAGATCATGATGATCCAGCCATTGATGTATGTAA  296
            |||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACTGGATTATCCCAAATATGAAGTACTCCTTTGTGTACAAGATCATGATGATCCAGCCATTGATGTATGTAA  296

Query  297  GAAGCTTCTTGGAAAATATCCAAATGTTGATGCTAGATTGTTTATAGGTGGCAAAAAAGTTGGCATTAATCCTA  370
            |||..|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  297  GAAATTGCTTGGAAAATACCCAAATGTCGATGCTAGATTATTTATAGGTGGCAAAAAGGTTGGCATTAACCCTA  370

Query  371  AAATTAATAATTTAATGCCAGGATATGAAGTTGCAAAGTATGATCTTATATGGATTTGTGATAGTGGAATAAGA  444
            |||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAATTAATAATTTGATGCCAGCATATGAAGTTGCAAAATATGATCTCATATGGATTTGTGATAGTGGAATAAGA  444

Query  445  GTAATTCCAGATACACTTACTGACATGGTGAATCAAATGACAGAAAAAGTAGGCTTGGTTCACGGGCTGCCTTA  518
            ||.||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GTCATCCCAGACACATTAACTGACATGGTGAATCAGATGACAGAGAAAGTGGGGTTGGTCCACGGGCTGCCGTA  518

Query  519  CGTAGCAGACAGACAGGGCTTTGCTGCCACCTTAGAGCAGGTATATTTTGGAACTTCACATCCAAGATACTATA  592
            .|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  519  TGTAGCCGACAGACAAGGCTTTGCTGCCACCTTAGAGCAGGTATATTTTGGAACTTCACACCCAAGATCCTATA  592

Query  593  TCTCTGCCAATGTAACTGGTTTCAAATGTGTGACAGGAATGTCTTGTTTAATGAGAAAAGATGTGTTGGATCAA  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||.|.|||||.
Sbjct  593  TCTCTGCCAATGTAACTGGCTTCAAATGTGTGACGGGGATGTCTTGTTTGATGAGGAAGGATGTGCTAGATCAG  666

Query  667  GCAGGAGGACTTATAGCTTTTGCTCAGTACATTGCCGAAGATTACTTTATGGCCAAAGCGATAGCTGACCGAGG  740
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  667  GCAGGAGGGCTCATAGCCTTTGCTCAGTACATTGCTGAAGATTACTTTATGGCCAAAGCAATAGCCGACCGAGG  740

Query  741  TTGGAGGTTTGCAATGTCCACTCAAGTTGCAATGCAAAACTCTGGCTCATATTCAATTTCTCAGTTTCAATCCA  814
            ||||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTGGAGGTTTTCAATGTCTACTCAAGTTGCCATGCAAAACTCTGGTTCGTACTCAATTTCTCAGTTTCAATCCA  814

Query  815  GAATGATCAGGTGGACCAAACTACGAATTAACATGCTTCCTGCTACAATAATTTGTGAGCCAATTTCAGAATGC  888
            ||||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAATGATCAGGTGGACCAAATTGAGAATTAACATGCTTCCTGCTACAATAATTTGTGAGCCAATTTCAGAATGC  888

Query  889  TTTGTTGCCAGTTTAATTATTGGATGGGCAGCCCACCATGTGTTCAGATGGGATATTATGGTATTTTTCATGTG  962
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  889  TTTGTTGCCAGTTTAATTATTGGGTGGGCAGCCCACCATGTATTCAGATGGGATATCATGGTCTTCTTCATGTG  962

Query  963  TCATTGCCTGGCATGGTTTATATTTGACTACATTCAACTCAGGGGTGTCCAGGGTGGCACACTGTGTTTTTCAA  1036
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACTGCCTGGCATGGTTTATATTTGACTACATTCAACTCAGGGGTGTCCAGGGTGGCACACTGTGTTTTTCAA  1036

Query 1037  AACTTGATTATGCAGTCGCCTGGTTCATCCGCGAATCCATGACAATATACATTTTTTTGTCTGCATTATGGGAC  1110
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||||
Sbjct 1037  AACTTGATTATGCTGTGGCCTGGTTCATCCGTGAATCCATGACAATCTACATTTTCCTGTCGGCATTATGGGAC  1110

Query 1111  CCAACTATAAGCTGGAGAACTGGTCGCTACAGATTACGCTGTGGGGGTACAGCAGAGGAAATCCTAGATGTA  1182
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1111  CCGACTATAAGCTGGAGAACTGGTCGCTACAGGTTACGCTGTGGGGGGACAGCAGAGGAGATCCTGGATGTG  1182