Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07117
• Subject: XM_005252186.5
• Aligned Length: 1182
• Identities: 797
• Gaps: 384

Alignment

Query    1  ATGGCGCTGCTGGATCTGGCCTTGGAGGGAATGGCCGTCTTCGGGTTCGTCCTCTTCTTGGTGCTGTGGCTGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCATTTCATGGCTATCATCTACACCCGATTACACCTCAACAAGAAGGCAACTGACAAACAGCCTTATAGCAAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCCCAGGTGTCTCTCTTCTGAAACCACTGAAAGGGGTAGATCCTAACTTAATCAACAACCTGGAAACATTCTTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAATTGGATTATCCCAAATATGAAGTGCTCCTTTGTGTACAAGATCATGATGATCCAGCCATTGATGTATGTAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAAGCTTCTTGGAAAATATCCAAATGTTGATGCTAGATTGTTTATAGGTGGCAAAAAAGTTGGCATTAATCCTA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AAATTAATAATTTAATGCCAGGATATGAAGTTGCAAAGTATGATCTTATATGGATTTGTGATAGTGGAATAAGA  444
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------ATGCCAGGATATGAAGTTGCAAAGTATGATCTTATATGGATTTGTGATAGTGGAATAAGA  60

Query  445  GTAATTCCAGATACACTTACTGACATGGTGAATCAAATGACAGAAAAAGTAGGCTTGGTTCACGGGCTGCCTTA  518
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   61  GTAATTCCAGATACGCTTACTGACATGGTGAATCAAATGACAGAAAAAGTAGGCTTGGTTCACGGGCTGCCTTA  134

Query  519  CGTAGCAGACAGACAGGGCTTTGCTGCCACCTTAGAGCAGGTATATTTTGGAACTTCACATCCAAGATACTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  135  CGTAGCAGACAGACAGGGCTTTGCTGCCACCTTAGAGCAGGTATATTTTGGAACTTCACATCCAAGATACTATA  208

Query  593  TCTCTGCCAATGTAACTGGTTTCAAATGTGTGACAGGAATGTCTTGTTTAATGAGAAAAGATGTGTTGGATCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  TCTCTGCCAATGTAACTGGTTTCAAATGTGTGACAGGAATGTCTTGTTTAATGAGAAAAGATGTGTTGGATCAA  282

Query  667  GCAGGAGGACTTATAGCTTTTGCTCAGTACATTGCCGAAGATTACTTTATGGCCAAAGCGATAGCTGACCGAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  283  GCAGGAGGACTTATAGCTTTTGCTCAGTACATTGCCGAAGATTACTTTATGGCCAAAGCGATAGCTGACCGAGG  356

Query  741  TTGGAGGTTTGCAATGTCCACTCAAGTTGCAATGCAAAACTCTGGCTCATATTCAATTTCTCAGTTTCAATCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  TTGGAGGTTTGCAATGTCCACTCAAGTTGCAATGCAAAACTCTGGCTCATATTCAATTTCTCAGTTTCAATCCA  430

Query  815  GAATGATCAGGTGGACCAAACTACGAATTAACATGCTTCCTGCTACAATAATTTGTGAGCCAATTTCAGAATGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  GAATGATCAGGTGGACCAAACTACGAATTAACATGCTTCCTGCTACAATAATTTGTGAGCCAATTTCAGAATGC  504

Query  889  TTTGTTGCCAGTTTAATTATTGGATGGGCAGCCCACCATGTGTTCAGATGGGATATTATGGTATTTTTCATGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  TTTGTTGCCAGTTTAATTATTGGATGGGCAGCCCACCATGTGTTCAGATGGGATATTATGGTATTTTTCATGTG  578

Query  963  TCATTGCCTGGCATGGTTTATATTTGACTACATTCAACTCAGGGGTGTCCAGGGTGGCACACTGTGTTTTTCAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  TCATTGCCTGGCATGGTTTATATTTGACTACATTCAACTCAGGGGTGTCCAGGGTGGCACACTGTGTTTTTCAA  652

Query 1037  AACTTGATTATGCAGTCGCCTGGTTCATCCGCGAATCCATGACAATATACATTTTTTTGTCTGCATTATGGGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  AACTTGATTATGCAGTCGCCTGGTTCATCCGCGAATCCATGACAATATACATTTTTTTGTCTGCATTATGGGAC  726

Query 1111  CCAACTATAAGCTGGAGAACTGGTCGCTACAGATTACGCTGTGGGGGTACAGCAGAGGAAATCCTAGATGTA  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  CCAACTATAAGCTGGAGAACTGGTCGCTACAGATTACGCTGTGGGGGTACAGCAGAGGAAATCCTAGATGTA  798