Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07155
- Subject:
- XM_017019920.1
- Aligned Length:
- 1726
- Identities:
- 1590
- Gaps:
- 128
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGACTCACCCAGAAGTCCACTCACTGCCTCTTCCCCTGGGGTCTCCCTCCCTGCAGGTAGTGCTGCTGAG 74
Query 1 -------------ATGGCCACCAGT------TTCCGGACAGCTTC---GTG----------------------- 29
|||..|.|.||| |||.||| |.|||| |||
Sbjct 75 GAGGAGCCTGCTAATGAGCTCAAGTGTCAAGTTCGGGA-ATCTTCTGGGTGTTCCTTGGGCCCAGGGAAACAGT 147
Query 30 ---CTG-----GGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCAGCTACTGGA 95
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GCCCTGCCTGAGGGATTATTGTCATTCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCAGCTACTGGA 221
Query 96 TTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATCATG 169
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTGATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATCATG 295
Query 170 GTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGG 243
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGGAGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGG 369
Query 244 CAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTA 317
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAGAGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATCAAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTA 443
Query 318 TGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAAGACAGAGACTCTATAACACAC 391
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 TGCTTGTAGTGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCTTCAAGACAGAGACTCTATAACACAC 517
Query 392 GTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAATCCTGATAAGTTTCATGGT 465
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GTGGAAAAAGTTTGACACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAATCCTGATAAGTTTCATGGT 591
Query 466 TATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAACTGTGTGTGTAGTGAATGTGG 539
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 TATGAAGAACCATATTTTCTTAAGCATCAAAGAGCTCATAGCATAGAAAAAAACTGTGTGTGTAGTGAATGTGG 665
Query 540 GAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAGGAGAGAGACCTTATGAATGCA 613
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GAAAGCTTTTCGTTGTAAGTCACAGCTCATTGTACATCTCAGAATTCATACAGGAGAGAGACCTTATGAATGCA 739
Query 614 GTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAACCC 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 GTAAATGTGAAAGAGCCTTCAGTGCCAAGTCAAACCTTAATGCTCATCAGAGAGTTCATACAGGAGAAAAACCC 813
Query 688 TACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGTCCATCAGGAAATTCACACAGG 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TACTCATGTAGTGAGTGCGAGAAGGTCTTCTCTTTCAGGTCACAGCTCATTGTCCATCAGGAAATTCACACAGG 887
Query 762 AGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAA 835
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGGAAACCCTATGGCTGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTACAGTTGGAAATCACAGCTTCTTTTACACCAGAGAA 961
Query 836 GTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTTGAAGTCTCCATTCGTTGTA 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTCACACAGGAGTGAAACCGTATGAATGCAGCGAATGTGGGAAAGCCTTTAGTTTGAAGTCTCCATTCGTTGTA 1035
Query 910 CACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTAGGAGTAAGTCCTA 983
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CACCAGAGAACTCATACAGGAGTGAAACCCCATAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTAGGAGTAAGTCCTA 1109
Query 984 TCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTGATTGTGGGAAAGCCTTCAATA 1057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TCTCCTTGTTCACATCCGAATGCATACAGGAGAAAAACCCTATCAATGCAGTGATTGTGGGAAAGCCTTCAATA 1183
Query 1058 TGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTATCAATGCGGCGAATGTGGGAAA 1131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1184 TGAAGACACAACTCATTGTACATCAGGGAGTTCACACAGGAAATAATCCTTATCAATGCGGTGAATGTGGGAAA 1257
Query 1132 GCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAGTGA 1205
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GCCTTTGGTAGGAAGGAACAGCTCACTGCACATCTGAGAGCTCATGCAGGAGAGAAGCCCTATGGATGCAGTGA 1331
Query 1206 ATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACACACACCGGAGAGAGACCCTATG 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 ATGTGGGAAGGCTTTCAGCAGCAAGTCATACCTTGTTATACATAGGAGAACACACACCGGAGAGAGACCCTATG 1405
Query 1280 AATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACATCAGAGAACTCATTCAACTGAG 1353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 AATGTAGTTTGTGTGAGAGAGCCTTTTGTGGAAAATCACAGCTGATTATACATCAGAGAACTCATTCAACTGAG 1479
Query 1354 AAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACTTCAGATACACCAGAAAACTCA 1427
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AAGCCCTATGAATGCAATGAATGTGAAAAAGCCTACCCTAGGAAGGCATCACTTCAGATACACCAGAAAACTCA 1553
Query 1428 TTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGAAGTCATCTCTCAGTGAACATC 1501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 TTCGGGAGAGAAACCTTTTAAATGCAGTGAATGTGGAAAAGCCTTCACTCAGAAGTCATCTCTCAGTGAACATC 1627
Query 1502 AGAGAGTTCACACTGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCCTTCTGTTGGAATTCAGGGCTT 1575
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AGAGAGTTCACACCGGAGAGAAACCATGGAAATGCTCTGAATGTGGGAAATCCTTCTGTTGGAATTCAGGGCTT 1701
Query 1576 CGTATACATCGGAAGACTCATAAA 1599
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 CGTATACATCGGAAGACTCATAAA 1725