Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07176
• Subject: XM_005259209.3
• Aligned Length: 1478
• Identities: 1188
• Gaps: 130

Alignment

Query    1  ATGA-CCATGTC--------------------------CA-AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGG  46
            |||| |.|| ||                          || ||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct    1  ATGATCGAT-TCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA  73

Query   47  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAAC  120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct   74  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC  147

Query  121  TTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTT  194
            ||||||||||||||.||||||                                                     
Sbjct  148  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTG-----------------------------------------------------  168

Query  195  TTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTC  268
                                                    |||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  169  ----------------------------------------GGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTC  202

Query  269  CAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCT  342
            |||||||||||.|||||||||..|..||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  203  CAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCT  276

Query  343  CAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATC  416
            |||||..|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.|.|||...||.|||||||.||.|.|.|.||.||||
Sbjct  277  CAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATC  350

Query  417  TATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTG  490
            ||.|.|.||||||.||.|.|||||||.|.|..|||..||.||||||||.|.||||||||||.|.|||.||||||
Sbjct  351  TACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTG  424

Query  491  ATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  564
            |||||||||||||..||...||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  ATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  498

Query  565  TCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATT  638
            |||||.|||||||||||||||||.||||||.||||||.||||..||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  499  TCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATT  572

Query  639  CAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTG  712
            .||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  573  TAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTG  646

Query  713  GGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGT  786
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  647  GGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGT  720

Query  787  GAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCC  860
            |||..||||||||.|||.|||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  721  GAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCC  794

Query  861  ATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAG  934
            ||||||||||||.||||||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||
Sbjct  795  ATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAG  868

Query  935  GAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCA  1004
            .|.||||||    ||||    .|||...|.|||||||.|||.||||||..||||||.||||||..|||||||||
Sbjct  869  CAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCA  938

Query 1005  GACGATCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTT  1078
            ||.|||.||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||
Sbjct  939  GATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTT  1012

Query 1079  TGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAG  1152
            ||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1013  TGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAG  1086

Query 1153  TCAGGTCTTGACTTGCACCACAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTT  1226
            ||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 1087  TCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTT  1160

Query 1227  TAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTG  1300
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1161  TAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTG  1234

Query 1301  GAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGT  1374
            ||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1235  GAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGT  1308

Query 1375  GAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1309  GAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1380