Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07395
• Subject: NM_001142605.1
• Aligned Length: 972
• Identities: 936
• Gaps: 35

Alignment

Query   1  MDTDLYDEFGNYIGPELDSDEDDDELGRETKDLDEMDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYG  74
                                              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------------MDDDDDDDDVGDHDDDHPGMEVVLHEDKKYYPTAEEVYG  39

Query  75  PEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  40  PEVETIVQEEDTQPLTEPIIKPVKTKKFTLMEQTLPVTVYEMDFLADLMDNSELIRNVTLCGHLHHGKTCFVDC  113

Query 149  LIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRIS  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 114  LIEQTHPEIRKRYDQDLCYTDILFTEQERGVGIKSTPVTVVLPDTKGKSYLFNIMDTPGHVNFSDEVTAGLRIS  187

Query 223  DGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 188  DGVVLFIDAAEGVMLNTERLIKHAVQERLAVTVCINKIDRLILELKLPPTDAYYKLRHIVDEVNGLISMYSTDE  261

Query 297  NLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLVSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFV  370
           ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 262  NLILSPLLGNVCFSSSQYSICFTLGSFAKIYADTFGDINYQEFAKRLWGDIYFNPKTRKFTKKAPTSSSQRSFV  335

Query 371  EFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 336  EFILEPLYKILAQVVGDVDTSLPRTLDELGIHLTKEELKLNIRPLLRLVCKKFFGEFTGFVDMCVQHIPSPKVG  409

Query 445  AKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLED  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 410  AKPKIEHTYTGGVDSDLGEAMSDCDPDGPLMCHTTKMYSTDDGVQFHAFGRVLSGTIHAGQPVKVLGENYTLED  483

Query 519  EEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 484  EEDSQICTVGRLWISVARYHIEVNRVPAGNWVLIEGVDQPIVKTATITEPRGNEEAQIFRPLKFNTTSVIKIAV  557

Query 593  EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETV  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 558  EPVNPSELPKMLDGLRKVNKSYPSLTTKVEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLRKMYSEIDIKVADPVVTFCETV  631

Query 667  VETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDAT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 632  VETSSLKCFAETPNKKNKITMIAEPLEKGLAEDIENEVVQITWNRKKLGEFFQTKYDWDLLAARSIWAFGPDAT  705

Query 741  GPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARR  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 706  GPNILVDDTLPSEVDKALLGSVKDSIVQGFQWGTREGPLCDELIRNVKFKILDAVVAQEPLHRGGGQIIPTARR  779

Query 815  VVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLR  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 780  VVYSAFLMATPRLMEPYYFVEVQAPADCVSAVYTVLARRRGHVTQDAPIPGSPLYTIKAFIPAIDSFGFETDLR  853

Query 889  THTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELA  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 854  THTQGQAFSLSVFHHWQIVPGDPLDKSIVIRPLEPQPAPHLAREFMIKTRRRKGLSEDVSISKFFDDPMLLELA  927

Query 963  KQDVVLNYPM  972
           ||||||||||
Sbjct 928  KQDVVLNYPM  937