Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07395
- Subject:
- NM_001258354.1
- Aligned Length:
- 2916
- Identities:
- 2885
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGGATACCGACTTATATGATGAGTTTGGGAATTATATTGGACCAGAGCTTGATTCTGATGAAGATGATGATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATACCGACTTATATGATGAGTTTGGGAATTATATTGGACCAGAGCTTGATTCTGATGAAGATGATGATGA 74
Query 75 ATTGGGTAGAGAGACCAAAGATCTTGATGAGATGGATGATGATGACGACGACGATGACGTAGGAGATCATGACG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATTGGGTAGAGAGACCAAAGATCTTGATGAGATGGATGATGATGACGACGACGATGACGTAGGAGATCATGACG 148
Query 149 ATGACCACCCTGGGATGGAGGTGGTGCTGCATGAGGACAAGAAGTACTACCCAACAGCCGAGGAGGTGTATGGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATGACCACCCTGGGATGGAGGTGGTGCTGCATGAGGACAAGAAGTACTACCCAACAGCCGAGGAGGTGTATGGT 222
Query 223 CCTGAGGTGGAGACCATAGTTCAAGAGGAAGACACTCAGCCTCTCACAGAACCCATTATTAAGCCAGTGAAAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTGAGGTGGAGACCATAGTTCAAGAGGAAGACACTCAGCCTCTCACAGAACCCATTATTAAGCCAGTGAAAAC 296
Query 297 CAAGAAATTCACTCTGATGGAGCAGACATTACCTGTTACGGTGTATGAGATGGATTTCTTGGCGGATCTGATGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAGAAATTCACTCTGATGGAGCAGACATTACCTGTTACGGTGTATGAGATGGATTTCTTGGCGGATCTGATGG 370
Query 371 ATAACTCAGAGCTCATCAGAAATGTGACCCTTTGTGGACATCTCCACCATGGCAAGACATGTTTTGTGGATTGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATAACTCAGAGCTCATCAGAAATGTGACCCTTTGTGGACATCTCCACCATGGCA-------------------- 424
Query 445 TTAATTGAACAGACTCACCCGGAAATCAGAAAGCGCTATGACCAAGATCTGTGCTATACTGACATCCTCTTCAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 425 ----------AGACTCACCCGGAAATCAGAAAGCGCTATGACCAAGATCTGTGCTATACTGACATCCTCTTCAC 488
Query 519 AGAGCAAGAGAGAGGTGTAGGCATCAAAAGCACTCCTGTGACAGTGGTCTTGCCAGACACCAAAGGAAAATCTT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 AGAGCAAGAGAGAGGTGTAGGCATCAAAAGCACTCCTGTGACAGTGGTCTTGCCAGACACCAAAGGAAAATCTT 562
Query 593 ATCTCTTCAATATCATGGACACTCCAGGACATGTGAATTTCTCTGATGAGGTCACAGCTGGCTTGCGCATCTCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563 ATCTCTTCAATATCATGGACACTCCAGGACATGTGAATTTCTCTGATGAGGTCACAGCTGGCTTGCGCATCTCA 636
Query 667 GATGGAGTGGTCCTTTTCATTGATGCTGCTGAGGGGGTGATGCTGAACACAGAGCGGCTGATCAAGCATGCGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 GATGGAGTGGTCCTTTTCATTGATGCTGCTGAGGGGGTGATGCTGAACACAGAGCGGCTGATCAAGCATGCGGT 710
Query 741 GCAGGAGAGGCTGGCAGTCACTGTGTGCATCAACAAGATTGACCGGCTGATCCTGGAGCTGAAGCTGCCTCCAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 GCAGGAGAGGCTGGCAGTCACTGTGTGCATCAACAAGATTGACCGGCTGATCCTGGAGCTGAAGCTGCCTCCAA 784
Query 815 CTGATGCTTATTACAAGCTGCGCCACATTGTGGATGAGGTCAATGGATTAATAAGCATGTATTCCACTGATGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 CTGATGCTTATTACAAGCTGCGCCACATTGTGGATGAGGTCAATGGATTAATAAGCATGTATTCCACTGATGAG 858
Query 889 AACCTGATCCTTTCCCCACTCCTGGGTAACGTCTGCTTCTCCAGCTCCCAGTACAGCATCTGCTTCACGCTGGT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 859 AACCTGATCCTTTCCCCACTCCTGGGTAACGTCTGCTTCTCCAGCTCCCAGTACAGCATCTGCTTCACGCTGGG 932
Query 963 CTCCTTTGCCAAGATCTATGCCGACACCTTTGGTGACATTAATTACCAAGAATTTGCTAAAAGACTCTGGGGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 CTCCTTTGCCAAGATCTATGCCGACACCTTTGGTGACATTAATTACCAAGAATTTGCTAAAAGACTCTGGGGTG 1006
Query 1037 ACATCTACTTCAACCCTAAGACGCGAAAGTTCACCAAAAAGGCCCCAACTAGCAGCTCCCAGAGAAGTTTCGTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 ACATCTACTTCAACCCTAAGACGCGAAAGTTCACCAAAAAGGCCCCAACTAGCAGCTCCCAGAGAAGTTTCGTG 1080
Query 1111 GAGTTTATCTTGGAGCCTCTTTATAAGATCCTCGCCCAGGTTGTAGGTGACGTGGACACCAGCCTCCCACGGAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 GAGTTTATCTTGGAGCCTCTTTATAAGATCCTCGCCCAGGTTGTAGGTGACGTGGACACCAGCCTCCCACGGAC 1154
Query 1185 CCTAGACGAGCTTGGCATCCACCTGACGAAGGAGGAGCTGAAGCTGAACATCCGCCCCTTGCTCAGGCTGGTCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 CCTAGACGAGCTTGGCATCCACCTGACGAAGGAGGAGCTGAAGCTGAACATCCGCCCCTTGCTCAGGCTGGTCT 1228
Query 1259 GCAAAAAGTTCTTTGGCGAGTTCACAGGCTTTGTGGACATGTGTGTGCAGCATATCCCTTCTCCAAAGGTGGGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 GCAAAAAGTTCTTTGGCGAGTTCACAGGCTTTGTGGACATGTGTGTGCAGCATATCCCTTCTCCAAAGGTGGGC 1302
Query 1333 GCCAAGCCCAAGATTGAGCACACCTACACCGGTGGTGTGGACTCCGACCTCGGCGAGGCTATGAGTGACTGTGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 GCCAAGCCCAAGATTGAGCACACCTACACCGGTGGTGTGGACTCCGACCTCGGCGAGGCTATGAGTGACTGTGA 1376
Query 1407 CCCTGATGGCCCCCTGATGTGCCACACTACTAAGATGTACAGCACAGATGATGGAGTCCAGTTTCACGCCTTTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377 CCCTGATGGCCCCCTGATGTGCCACACTACTAAGATGTACAGCACAGATGATGGAGTCCAGTTTCACGCCTTTG 1450
Query 1481 GCCGGGTGCTGAGTGGCACCATTCATGCTGGGCAGCCTGTGAAGGTACTGGGGGAGAACTACACCCTGGAGGAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451 GCCGGGTGCTGAGTGGCACCATTCATGCTGGGCAGCCTGTGAAGGTACTGGGGGAGAACTACACCCTGGAGGAT 1524
Query 1555 GAGGAAGACTCCCAGATATGCACCGTGGGCCGCCTTTGGATCTCTGTGGCCAGGTACCACATCGAGGTGAACCG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525 GAGGAAGACTCCCAGATATGCACCGTGGGCCGCCTTTGGATCTCTGTGGCCAGGTACCACATCGAGGTGAACCG 1598
Query 1629 TGTTCCTGCTGGCAACTGGGTTCTGATTGAAGGTGTTGATCAACCAATTGTGAAGACAGCAACCATAACCGAAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599 TGTTCCTGCTGGCAACTGGGTTCTGATTGAAGGTGTTGATCAACCAATTGTGAAGACAGCAACCATAACCGAAC 1672
Query 1703 CCCGAGGCAATGAGGAGGCTCAGATTTTCCGACCCTTGAAGTTCAATACCACATCTGTTATCAAGATTGCTGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673 CCCGAGGCAATGAGGAGGCTCAGATTTTCCGACCCTTGAAGTTCAATACCACATCTGTTATCAAGATTGCTGTG 1746
Query 1777 GAGCCAGTCAACCCCTCAGAGCTGCCCAAGATGCTTGATGGCCTGCGCAAGGTCAACAAGAGCTATCCATCCCT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747 GAGCCAGTCAACCCCTCAGAGCTGCCCAAGATGCTTGATGGCCTGCGCAAGGTCAACAAGAGCTATCCATCCCT 1820
Query 1851 CACCACCAAGGTGGAGGAGTCTGGCGAGCATGTGATCCTGGGCACTGGGGAGCTCTACCTGGACTGTGTGATGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821 CACCACCAAGGTGGAGGAGTCTGGCGAGCATGTGATCCTGGGCACTGGGGAGCTCTACCTGGACTGTGTGATGC 1894
Query 1925 ATGATTTGCGGAAGATGTACTCAGAGATAGACATCAAGGTGGCTGACCCAGTTGTCACGTTTTGTGAGACGGTG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895 ATGATTTGCGGAAGATGTACTCAGAGATAGACATCAAGGTGGCTGACCCAGTTGTCACGTTTTGTGAGACGGTG 1968
Query 1999 GTGGAAACATCCTCCCTCAAGTGCTTTGCTGAAACGCCTAATAAGAAGAACAAGATCACCATGATTGCTGAGCC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969 GTGGAAACATCCTCCCTCAAGTGCTTTGCTGAAACGCCTAATAAGAAGAACAAGATCACCATGATTGCTGAGCC 2042
Query 2073 TCTTGAGAAGGGCCTGGCAGAGGACATAGAGAATGAGGTGGTCCAGATTACGTGGAACAGGAAGAAGCTGGGAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043 TCTTGAGAAGGGCCTGGCAGAGGACATAGAGAATGAGGTGGTCCAGATTACGTGGAACAGGAAGAAGCTGGGAG 2116
Query 2147 AGTTCTTCCAGACCAAGTACGATTGGGATCTGCTGGCTGCCCGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGATGCGACT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117 AGTTCTTCCAGACCAAGTACGATTGGGATCTGCTGGCTGCCCGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGATGCGACT 2190
Query 2221 GGCCCCAACATTCTGGTGGATGATACTCTGCCCTCTGAGGTGGACAAGGCTCTTCTTGGTTCAGTGAAGGACAG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191 GGCCCCAACATTCTGGTGGATGATACTCTGCCCTCTGAGGTGGACAAGGCTCTTCTTGGTTCAGTGAAGGACAG 2264
Query 2295 CATCGTTCAAGGTTTCCAGTGGGGAACCAGGGAGGGCCCCCTCTGTGATGAATTGATTCGGAATGTCAAGTTTA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265 CATCGTTCAAGGTTTCCAGTGGGGAACCAGGGAGGGCCCCCTCTGTGATGAATTGATTCGGAATGTCAAGTTTA 2338
Query 2369 AGATCCTGGATGCGGTGGTTGCCCAGGAGCCCCTGCACCGGGGCGGGGGCCAGATCATCCCCACAGCCAGGAGA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339 AGATCCTGGATGCGGTGGTTGCCCAGGAGCCCCTGCACCGGGGCGGGGGCCAGATCATCCCCACAGCCAGGAGA 2412
Query 2443 GTCGTCTACTCTGCCTTCCTCATGGCTACTCCTCGTCTGATGGAGCCTTACTACTTTGTAGAGGTCCAGGCCCC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413 GTCGTCTACTCTGCCTTCCTCATGGCTACTCCTCGTCTGATGGAGCCTTACTACTTTGTAGAGGTCCAGGCCCC 2486
Query 2517 TGCAGATTGCGTCTCTGCAGTTTATACCGTCCTGGCCAGGCGCAGGGGGCACGTGACTCAGGATGCACCCATCC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487 TGCAGATTGCGTCTCTGCAGTTTATACCGTCCTGGCCAGGCGCAGGGGGCACGTGACTCAGGATGCACCCATCC 2560
Query 2591 CAGGCTCCCCTCTGTACACCATCAAAGCTTTTATCCCGGCCATCGACTCTTTTGGCTTTGAGACTGATCTCCGG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2561 CAGGCTCCCCTCTGTACACCATCAAAGCTTTTATCCCGGCCATCGACTCTTTTGGCTTTGAGACTGATCTCCGG 2634
Query 2665 ACTCACACCCAGGGACAAGCCTTTTCTCTGTCTGTCTTCCACCACTGGCAGATTGTGCCTGGTGATCCCCTGGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635 ACTCACACCCAGGGACAAGCCTTTTCTCTGTCTGTCTTCCACCACTGGCAGATTGTGCCTGGTGATCCCCTGGA 2708
Query 2739 CAAGAGCATTGTCATCCGCCCCTTGGAGCCACAGCCAGCTCCTCACCTGGCCCGGGAATTCATGATCAAAACCC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709 CAAGAGCATTGTCATCCGCCCCTTGGAGCCACAGCCAGCTCCTCACCTGGCCCGGGAATTCATGATCAAAACCC 2782
Query 2813 GCCGTAGGAAGGGCCTCAGTGAAGATGTGAGCATCAGCAAATTCTTCGATGATCCTATGTTGCTGGAACTTGCC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783 GCCGTAGGAAGGGCCTCAGTGAAGATGTGAGCATCAGCAAATTCTTCGATGATCCTATGTTGCTGGAACTTGCC 2856
Query 2887 AAACAGGATGTTGTGCTCAATTACCCCATG 2916
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2857 AAACAGGATGTTGTGCTCAATTACCCCATG 2886