Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07408
Subject:
NM_001328646.2
Aligned Length:
868
Identities:
806
Gaps:
52

Alignment

Query   1  MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGPATFTATKQLQRHLG  74
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Sbjct   1  MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGPATFTATKQLQRHLG  74

Query  75  FKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAATFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTI  148
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Sbjct  75  FKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAATFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTI  148

Query 149  QMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFLCLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFL  222
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Sbjct 149  QMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFLCLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFL  222

Query 223  LAGPGGLGMFATVAGISQRAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGR  296
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Sbjct 223  LAGPGGLGMFATVAGISQRAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGR  296

Query 297  VIVATSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQFAQLQFLEAK  370
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Sbjct 297  VIVATSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQFAQLQFLEAK  370

Query 371  ELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGY  444
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Sbjct 371  ELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGY  444

Query 445  KEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQ  518
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Sbjct 445  KEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQ  518

Query 519  DSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEELVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVK  592
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Sbjct 519  DSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEELVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVK  592

Query 593  YLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLP  666
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Sbjct 593  YLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLP  666

Query 667  MESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYLHAGPTAHELAVAAVDL  740
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Sbjct 667  MESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYLHAGPTAHELAVAAVDL  740

Query 741  LNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHARRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKL--------K  806
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...        .
Sbjct 741  LNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHARRTMQVALGLARSENLIYTYDKTGIAGRGTADAR  814

Query 807  GSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVHTHCAASRHTNPSSSSPGTRT  860
           |||....|..                                            
Sbjct 815  GSSRENGDGT--------------------------------------------  824