Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07663
• Subject: XM_006505517.3
• Aligned Length: 1741
• Identities: 1476
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  ATGAACAAACTGTATATCGGAAACCTCAGCGAGAACGCCGCCCCCTC----GGACCTAGAAAGTATCTTCAAGG  70
                                                               ||||| ||||||       ||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------ATGTGGACC-AGAAAG-------AAGG  19

Query   71  ACGCCAAGATCCCGGTGTCGGGACCCTTCCTGGTGAAGACTGGCTACGCGTTCGTGGACTGCCCGGACGAGAGC  144
            .||               ||.|.|||  |.|||      |.||||    |||.||                   
Sbjct   20  CCG---------------CGCGCCCC--CATGG------CAGGCT----GTTTGT-------------------  47

Query  145  TGGGCCCTCAAGGCCATCGAGGCGCTTTCAGGTAAAATAGAACTGCACGGGAAACCCATAGAAGTTGAGCACTC  218
            ||||                          ||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct   48  TGGG--------------------------GGTAAAATGGAACTACATGGGAAACCGATGGAAGTTGAGCACTC  95

Query  219  GGTCCCAAAAAGGCAAAGGATTCGGAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCTCATTTACAGTGGGAGGTGCTGG  292
            ||||||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   96  GGTCCCTAAACGGCAGAGGATTCGTAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCCCACTTACAATGGGAGGTGCTGG  169

Query  293  ATAGTTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACTGACTCGGAAACTGCAGTTGTA  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  170  ATAGTTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACGGATTCGGAAACGGCAGTTGTA  243

Query  367  AATGTAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCACTAGACAAACTGAATGGATTTCAGTTAGAGAATTT  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  244  AATGTAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCCTTAGACAAACTGAATGGATTCCAGTTAGAGAACTT  317

Query  441  CACCTTGAAAGTAGCCTATATCCCTGATGAAATGGCCGCCCAGCAAAACCCCTTGCAGCAGCCCCGAGGTCGCC  514
            |||||||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||||||||.||||.||..||||.|||.||.||||
Sbjct  318  CACCTTGAAGGTTGCCTACATCCCAGATGAAACTGCTGCCCAGCAAAATCCCTCGCCACAGCTCCGGGGGCGCC  391

Query  515  GGGGGCTTGGGCAGAGGGGCTCCTCAAGGCAGGGGTCTCCAGGATCCGTATCCAAGCAGAAACCATGTGATTTG  588
            ||||||..||||||.|||||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||
Sbjct  392  GGGGGCCAGGGCAGCGGGGCTCATCCAGGCAGGCGTCTCCAGGATCGGTGTCCAAGCAGAAACCCTGTGACCTG  465

Query  589  CCTCTGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAATTTGTTGGAGCCATCATAGGAAAAGAAGGTGCCACCATTCGGAACAT  662
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  466  CCACTGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAGTTTGTTGGAGCCATTATAGGAAAAGAAGGTGCTACCATTCGCAACAT  539

Query  663  CACCAAACAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCACCGTAAAGAAAATGCGGGGGCTGCTGAGAAGTCGATTACTA  736
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  540  CACAAAGCAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCATCGTAAGGAGAATACAGGGGCCGCGGAGAAGTCCATTACTA  613

Query  737  TCCTCTCTACTCCTGAAGGCACCTCTGCGGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGAT  810
            ||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  TCCTCTCTACCCCTGAAGGCACCTCTGCAGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGAT  687

Query  811  ATAAAATTCACAGAAGAGATCCCCTTGAAGATTTTAGCTCATAATAACTTTGTTGGACGTCTTATTGGTAAAGA  884
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  688  ATAAAATTCACAGAGGAGATTCCCTTGAAGATCTTAGCTCACAATAACTTTGTAGGCCGTCTCATTGGTAAAGA  761

Query  885  AGGAAGAAATCTTAAAAAAATTGAGCAAGACACAGACACTAAAATCACGATATCTCCATTGCAGGAATTGACGC  958
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  762  AGGAAGAAACCTTAAAAAAATCGAGCAAGACACGGACACTAAAATCACAATATCTCCATTGCAGGAACTGACGC  835

Query  959  TGTATAATCCAGAACGCACTATTACAGTTAAAGGCAATGTTGAGACATGTGCCAAAGCTGAGGAGGAGATCATG  1032
            ||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  836  TGTACAATCCGGAACGCACCATTACAGTGAAAGGCAGTGTTGAGACGTGTGCCAAGGCGGAGGAGGAAATAATG  909

Query 1033  AAGAAAATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCTATGAATCTTCAAGCACATTTAATTCCTGGATTAAA  1106
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  910  AAGAAGATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCCATGAATCTTCAAGCACATTTAATCCCTGGATTAAA  983

Query 1107  TCTGAACGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACTTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAGCCATGA  1180
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  984  TCTGAATGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACGTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAACCCTGA  1057

Query 1181  CTCCTCCCTACCCGCAGTTTGAGCAATCAGAAACGGAGACTGTTCATCTGTTTATCCCAGCTCTATCAGTCGGT  1254
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.
Sbjct 1058  CTCCTCCCTACCCACAATTTGAGCAATCAGAGACGGAGACTGTGCATCTGTTTATTCCCGCCCTGTCCGTTGGC  1131

Query 1255  GCCATCATCGGCAAGCAGGGCCAGCACATCAAGCAGCTTTCTCGCTTTGCTGGAGCTTCAATTAAGATTGCTCC  1328
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1132  GCCATCATTGGCAAGCAGGGCCAACACATCAAACAGCTTTCTCGCTTTGCGGGAGCTTCGATTAAGATCGCTCC  1205

Query 1329  AGCAGAAGCACCAGATGCTAAAGTGAGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGG  1402
            |||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206  AGCCGAAGCACCAGATGCTAAAGTGCGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGG  1279

Query 1403  GAAGAATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCATATC  1476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1280  GAAGAATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCACATC  1353

Query 1477  AGAGTGCCATCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGAAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAACTTCAGAATTTGTC  1550
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||
Sbjct 1354  AGAGTGCCGTCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGGAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAGCTCCAGAGTTTATC  1427

Query 1551  AAGTGCAGAAGTTGTTGTCCCTCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGACCAAGTGGTTGTCAAAATAACTGGTC  1624
            ||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1428  AAGTGCTGAAGTTGTCGTCCCCCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGATCAAGTAGTTGTCAAAATAACTGGCC  1501

Query 1625  ACTTCTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGAAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAACAACAG  1698
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1502  ACTTCTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGGAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAGCAGCAG  1575

Query 1699  AAGGCTCTGCAAAGTGGACCACCTCAGTCAAGACGGAAG  1737
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1576  AAAGCTCTGCAGAGTGGACCACCTCAGTCAAGGCGGAAG  1614