Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07670
- Subject:
- XM_017011687.1
- Aligned Length:
- 3715
- Identities:
- 3496
- Gaps:
- 215
Alignment
Query 1 ATGTCTTCCCCGTTGCAAAGAGCTGTGGGAGATACCAAGAGGGCCTTTTCTGCATCTTCTAGTTCCTCTGCCAG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTTCCCCGTTGCAAAGAGCTGTGGGAGATACCAAGAGGGCCTTGTCTGCATCTTCTAGTTCCTCTGCCAG 74
Query 75 TCTACCCTTTGATGACAGGGACTCAAACCATCCCTCAGAGGGGAATGGCGACTCTTTGTTAGCTGATGAAGACA 148
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTACCCTTTGATGACAGGGACTCAAACCATACCTCAGAGGGGAATGGCGACTCTTTGTTAGCTGATGAAGACA 148
Query 149 CTGACTTTGAAGACAGCTTGAATCGCAATGTGAAGAAGAGAGCAGCAAAACGACCACCGAAAACAACACCGGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGACTTTGAAGACAGCTTGAATCGCAATGTGAAGAAGAGAGCAGCAAAACGACCACCGAAAACAACACCGGTG 222
Query 223 GCAAAACATCCAAAGAAAGGGTCCCGAGTGGTACATCGTCATAGCCGGAAACAGTCAGAGCCACCAGCCAATGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCAAAACATCCAAAGAAAGGGTCCCGAGTGGTACATCGTCATAGCCGGAAACAGTCAGAGCCACCAGCCAATGA 296
Query 297 TCTTTTCAATGCTGTGAAAGCCGCCAAAAGTGACATGCAGTCTTTGGTAGATGAGTGGCTGGATAGCTACAAGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCTTTTCAATGCTGTGAAAGCCGCCAAAAGTGACATGC------------------------------------ 334
Query 371 AAGACCAGGATGCAGGATTTCTGGAGCTTGTTAACTTTTTCATCCAATCTTGCGGATGTAAAGGCATTGTGACC 444
Sbjct 335 -------------------------------------------------------------------------- 334
Query 445 CCTGAGATGTTCAAGAAGATGTCCAACTCAGAGATCATCCAGCACCTAACAGAGCAGTTTAATGAGGACTCGGG 518
||||||||||
Sbjct 335 ----------------------------------------------------------------AGGACTCGGG 344
Query 519 GGACTACCCTCTCATAGCTCCAGGTCCATCCTGGAAGAAGTTCCAGGGCAGCTTCTGTGAATTTGTGAGGACAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345 GGACTACCCTCTCATAGCTCCAGGTCCATCCTGGAAGAAGTTCCAGGGCAGCTTCTGTGAATTTGTGAGGACAT 418
Query 593 TGGTCTGTCAGTGCCAGTACAGCCTCCTCTATGATGGCTTCCCTATGGACGACCTCATCTCCCTGCTCACTGGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419 TGGTCTGTCAGTGCCAGTACAGCCTCCTCTATGATGGCTTCCCTATGGACGACCTCATCTCCCTGCTCACTGGC 492
Query 667 CTCTCAGACTCACAAGTCCGCGCCTTCCGTCACACTAGCACCCTGGCTGCTATGAAACTGATGACCTCCCTGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493 CTCTCAGACTCACAAGTCCGCGCCTTCCGTCACACTAGCACCCTGGCTGCTATGAAACTGATGACCTCCCTGGT 566
Query 741 AAAAGTTGCCCTCCAACTGAGTGTGCACCAAGATAACAATCAGCGTCAGTATGAGGCTGAAAGAAACAAGGGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567 AAAAGTTGCCCTCCAACTGAGTGTGCACCAAGATAACAATCAGCGTCAGTATGAGGCTGAAAGAAACAAGGGGC 640
Query 815 CAGGGCAGAGGGCACCTGAGCGGCTGGAGAGCCTGTTGGAGAAACGCAAAGAGCTCCAAGAGCATCAAGAGGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CAGGGCAGAGGGCACCTGAGCGGCTGGAGAGCCTGTTGGAGAAACGCAAAGAGCTCCAAGAGCATCAAGAGGAG 714
Query 889 ATTGAGGGGATGATGAATGCCCTCTTCAGGGGTGTCTTTGTTCATCGGTACAGGGATGTCCTTCCTGAGATCCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715 ATTGAGGGGATGATGAATGCCCTCTTCAGGGGTGTCTTTGTTCATCGGTACAGGGATGTCCTTCCTGAGATCCG 788
Query 963 TGCTATCTGCATTGAGGAAATTGGGTGTTGGATGCAAAGCTACAGCACGTCTTTCCTCACCGACAGCTATTTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 789 TGCTATCTGCATTGAGGAAATTGGGTGTTGGATGCAAAGCTACAGCACGTCTTTCCTCACCGACAGCTATTTAA 862
Query 1037 AATATATTGGTTGGACTCTGCATGATAAGCACCGAGAAGTCCGCCTGAAGTGTGTGAAGGCCCTGAAAGGGCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 863 AATATATTGGTTGGACTCTGCATGATAAGCACCGAGAAGTCCGCCTGAAGTGTGTGAAGGCCCTGAAAGGGCTG 936
Query 1111 TACGGTAACCGGGACCTGACCACACGCCTGGAGCTCTTCACCAGCCGCTTCAAGGACCGGATGGTTTCCATGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 937 TACGGTAACCGGGACCTGACCACACGCCTGGAGCTCTTCACCAGCCGCTTCAAGGACCGGATGGTTTCCATGGT 1010
Query 1185 CATGGACAGAGAGTATGATGTGGCAGTGGAGGCTGTCAGATTACTGATACTTATCCTTAAGAACATGGAAGGGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 CATGGACAGAGAGTATGATGTGGCAGTGGAGGCTGTCAGATTACTGATACTTATCCTTAAGAACATGGAAGGGG 1084
Query 1259 TGCTGACGGACGCGGATTGTGAGAGCGTCTACCCCGTTGTGTATGCCTCTCATCGAGGCCTGGCCTCTGCCGCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1085 TGCTGACGGACGCGGATTGTGAGAGCGTCTACCCAGTTGTGTATGCCTCTCATCGAGGCCTGGCCTCTGCCGCA 1158
Query 1333 GGCGAATTTCTGTACTGGAAACTCTTCTACCCTGAGTGCGAGATAAGAATGATGGGTGGAAGAGAGCAACGCCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GGCGAATTTCTGTACTGGAAACTCTTCTACCCTGAGTGCGAGATAAGAATGATGGGTGGAAGAGAGCAACGCCA 1232
Query 1407 GAGCCCAGGCGCCCAGAGGACTTTCTTCCAGCTTCTGCTGTCCTTCTTTGTGGAGAGCGAGCTCCATGACCACG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233 GAGCCCAGGCGCCCAGAGGACTTTCTTCCAGCTTCTGCTGTCCTTCTTTGTGGAGAGCGAGCTCCATGACCACG 1306
Query 1481 CTGCTTACTTAGTAGACAGTCTGTGGGACTGTGCAGGGGCTCGGCTGAAGGACTGGGAGGGTCTGACAAGCCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1307 CTGCTTACTTAGTAGACAGTCTGTGGGACTGTGCAGGGGCTCGGCTGAAGGACTGGGAGGGTCTGACAAGCCTG 1380
Query 1555 CTGCTGGAGAAGGACCAGAACCTGGGTGATGTGCAGGAGAGCACACTGATAGAAATCCTTGTGTCCAGTGCCCG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1381 CTGCTGGAGAAGGACCAGAACCTGGGTGATGTGCAGGAGAGCACACTGATAGAAATCCTTGTGTCCAGTGCCCG 1454
Query 1629 GCAAGCTTCAGAGGGGCACCCGCCTGTGGGCCGGGTCACTGGGAGGAAGGGCTTAACCTCTAAGGAGCGCAAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1455 GCAAGCTTCAGAGGGGCACCCGCCTGTGGGCCGGGTCACTGGGAGGAAGGGCTTAACCTCTAAGGAGCGCAAGA 1528
Query 1703 CCCAAGCCGATGACAGGGTGAAGTTGACTGAGCACCTCATCCCCCTGCTGCCCCAGCTCCTGGCCAAGTTCTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1529 CCCAAGCCGATGACAGGGTGAAGTTGACTGAGCACCTCATCCCCCTGCTGCCCCAGCTCCTGGCCAAGTTCTCA 1602
Query 1777 GCTGATGCAGAGAAGGTCACTCCCCTGCTCCAGCTTCTCAGCTGCTTTGACCTCCACATCTACTGCACTGGGCG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1603 GCTGATGCAGAGAAGGTCACTCCCCTGCTCCAGCTTCTCAGCTGCTTTGACCTCCACATCTACTGCACTGGGCG 1676
Query 1851 CTTGGAGAAGCACCTGGAGCTGTTCCTGCAGCAACTCCAGGAGGTGGTGGTGAAGCATGCAGAGCCAGCGGTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1677 CTTGGAGAAGCACCTGGAGCTGTTCCTGCAGCAACTCCAGGAGGTGGTGGTGAAGCATGCAGAGCCAGCGGTGC 1750
Query 1925 TTGAGGCTGGGGCGCATGCCCTCTACCTGCTCTGTAATCCCGAATTCACTTTCTTCAGCCGGGCGGACTTTGCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1751 TTGAGGCTGGGGCGCATGCCCTCTACCTGCTCTGTAATCCCGAATTCACTTTCTTCAGCCGGGCGGACTTTGCC 1824
Query 1999 CGCAGCCAGCTAGTAGATTTGCTGACTGACCGCTTCCAGCAGGAGCTTGAAGAGCTGTTACAGTCGTCCTTCCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1825 CGCAGCCAGCTAGTAGATTTGCTGACTGACCGCTTCCAGCAGGAGCTTGAAGAGCTGTTACAGTCGTCCTTCCT 1898
Query 2073 AGATGAGGATGAGGTATATAATCTGGCAGCCACTCTGAAACGCCTCTCTGCCTTCTACAACACTCATGACCTGA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1899 AGATGAGGATGAGGTATATAATCTGGCAGCCACTCTGAAACGCCTCTCTGCCTTCTACAACACTCATGACCTGA 1972
Query 2147 CTCGCTGGGAGCTCTATGAGCCATGTTGCCAACTCCTGCAGAAGGCTGTGGACACAGGAGAGGTTCCTCACCAG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1973 CTCGCTGGGAGCTCTATGAGCCATGTTGCCAACTCCTGCAGAAGGCTGTGGACACAGGAGAGGTTCCTCACCAG 2046
Query 2221 GTTATCCTGCCAGCCTTGACTCTTGTCTATTTTTCCATTCTCTGGACACTAACCCACATTTCTAAATCAGATGC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2047 GTTATCCTGCCAGCCTTGACTCTTGTCTATTTTTCCATTCTCTGGACACTAACCCACATTTCTAAATCAGATGC 2120
Query 2295 TTCCCAGAAGCAGCTGTCGAGTTTGAGGGACAGAATGGTGGCCTTCTGTGAACTCTGCCAGAGTTGCCTCTCAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2121 TTCCCAGAAGCAGCTGTCGAGTTTGAGGGACAGAATGGTGGCCTTCTGTGAACTCTGCCAGAGTTGCCTCTCAG 2194
Query 2369 ATGTGGATACTGAGATCCAGGAGCAGGCTTTTGTCTTATTAAGTGATCTACTTCTCATCTTTAGCCCTCAGATG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2195 ATGTGGATACTGAGATCCAGGAGCAGGCTTTTGTCTTATTAAGTGATCTACTTCTCATCTTTAGCCCTCAGATG 2268
Query 2443 ATTGTTGGGGGCCGTGATTTCCTTAGGCCACTTGTCTTTTTTCCTGAAGCTACTCTCCAGTCTGAGCTAGCCAG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2269 ATTGTTGGGGGCCGTGATTTCCTTAGGCCACTTGTCTTTTTTCCTGAAGCTACTCTCCAGTCTGAGCTAGCCAG 2342
Query 2517 CTTCCTCATGGACCACGTCTTCATCCAGCCGGGAGACCTGGGCAGTGGTGATTCCCAGGAGGATCATTTACAGA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2343 CTTCCTCATGGACCACGTCTTCATCCAGCCGGGAGACCTGGGCAGTGGTGATTCCCAGGAGGATCATTTACAGA 2416
Query 2591 TAGAGCGGCTACACCAGCGGCGCCGCCTCCTAGCCGGGTTCTGCAAGCTGTTGCTTTATGGGGTGCTGGAGATG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 TAGAGCGGCTACACCAGCGGCGCCGCCTCCTAGCCGGGTTCTGCAAGCTGTTGCTTTATGGGGTGCTGGAGATG 2490
Query 2665 GATGCAGCCTCAGATGTTTTCAAACACTACAACAAGTTCTACAATGACTATGGTGACATTATCAAGGAAACATT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 GATGCAGCCTCAGATGTTTTCAAACACTACAACAAGTTCTACAATGACTATGGTGACATTATCAAGGAAACATT 2564
Query 2739 AACTAGAGCAAGGCAGATTGACCGAAGTCATTGTTCCCGAATCCTGCTGCTGAGCCTCAAGCAGCTGTACACAG 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 AACTAGAGCAAGGCAGATTGACCGAAGTCATTGTTCCCGAATCCTGCTGCTGAGCCTCAAGCAGCTGTACACAG 2638
Query 2813 AACTGCTGCAGGAGCATGGGCCCCAGGGCCTGAATGAGCTTCCTGCCTTCATCGAGATGAGGGACCTGGCCCGG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 AACTGCTGCAGGAGCATGGGCCCCAGGGCCTGAATGAGCTTCCTGCCTTCATCGAGATGAGGGACCTGGCCCGG 2712
Query 2887 AGGTTTGCCTTGAGTTTTGGACCCCAGCAGCTGCAGAACCGTGACCTCGTGGTCATGCTACACAAGGAAGGCAT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 AGGTTTGCCTTGAGTTTTGGACCCCAGCAGCTGCAGAACCGTGACCTCGTGGTCATGCTACACAAGGAAGGCAT 2786
Query 2961 CCAGTTCTCCTTGTCTGAGCTTCCTCCAGCTGGCTCCTCCAATCAGCCTCCAAATCTGGCATTCCTGGAGCTCC 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787 CCAGTTCTCCTTGTCTGAGCTTCCTCCAGCTGGCTCCTCCAATCAGCCTCCAAATCTGGCATTCCTGGAGCTCC 2860
Query 3035 TTTCAGAGTTTTCCCCCCGACTCTTCCATCAGGACAAGCAGCTTTTACTGTCCTATCTAGAAAAGTGCCTGCAG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861 TTTCAGAGTTTTCCCCCCGACTCTTCCATCAGGACAAGCAGCTTTTACTGTCCTATCTAGAAAAGTGCCTGCAG 2934
Query 3109 CATGTCTCCCAGGCACCTGGCCATCCCTGGGGCCCAGTCACCACCTACTGCCACTCCCTCAGCCCTGTGGAGAA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 CATGTCTCCCAGGCACCTGGCCATCCCTGGGGCCCAGTCACCACCTACTGCCACTCCCTCAGCCCTGTGGAGAA 3008
Query 3183 CACAGCAGAGACCAGCCCTCAGGTCCTCCCCAGCTCCAAGAGGAGGCGCGTTGAAGGGCCTGCCAAGCCTAACA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 CACAGCAGAGACCAGCCCTCAGGTCCTCCCCAGCTCCAAGAGGAGGCGCGTTGAAGGGCCTGCCAAGCCTAACA 3082
Query 3257 GAGAGGACGTCTCCTCGTCCCAGGAAGAAAGTCTGCAGCTGAACAGCATCCCGCCCACGCCCACCCTCACCTCC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3083 GAGAGGACGTCTCCTCGTCCCAGGAAGAAAGTCTGCAGCTGAACAGCATCCCGCCCACGCCCACCCTCACCTCC 3156
Query 3331 ACAGCTGTGAAGAGCAGGCAGCCCCTGTGGGGGTTGAAAGAGATGGAGGAAGAAGATGGCTCAGAGTTGGATTT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3157 ACAGCTGTGAAGAGCAGGCAGCCCCTGTGGGGGTTGAAAGAGATGGAGGAAGAAGATGGCTCAGAGTTGGATTT 3230
Query 3405 TGCCCAGGGTCAGCCCGTCGCAGGCACCGAGAGGTCAAGGTTCTTGGGTCCACAATATTTCCAGACTCCACACA 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 TGCCCAGGGTCAGCCCGTCGCAGGCACCGAGAGGTCAAGGTTCTTGGGTCCACAATATTTCCAGACTCCACACA 3304
Query 3479 ACCCTTCAGGTCCTGGCCTGGGCAACCAGCTGATGCGACTCAGCCTTATGGAAGAGGACGAGGAAGAAGAGTTA 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3305 ACCCTTCAGGTCCTGGCCTGGGCAACCAGCTGATGCGACTCAGCCTTATGGAAGAGGACGAGGAAGAAGAGTTA 3378
Query 3553 GAAATCCAGGATGAGTCAAATGAAGAACGGCAGGATACAGACATGCAAGCAAGTAGCTACTCTTCCACCAGTGA 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3379 GAAATCCAGGATGAGTCAAATGAAGAACGGCAGGATACAGACATGCAAGCAAGTAGCTACTCTTCCACCAGTGA 3452
Query 3627 GCGCGGGCTGGACCTCTTAGATTCTACAGAGCTGGATATTGAGGATTTC------------------------- 3675
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|
Sbjct 3453 GCGCGGGCTGGACCTCTTAGATTCTACAGAGCTGGATATTGA-GATTACTGAGAGTCTTCCGTTACTAGGGCAG 3525
Query 3676 --------------- 3675
Sbjct 3526 AGGACTGCTGTTTGC 3540