Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07740
• Subject: XM_011534900.2
• Aligned Length: 1083
• Identities: 883
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCTGCACGTCGGGGCAGCGGGACAGATCCCAGGGTGCCCAGGGAGTCTCCAAGTGCCTCACTCCTCCCGC  74

Query    1  -------ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCAAACATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC  148

Query   68  CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC  222

Query  142  ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT  296

Query  216  TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA  370

Query  290  ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA  363
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  371  ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAAT---------  435

Query  364  GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC  437
                                                                                      
Sbjct  436  --------------------------------------------------------------------------  435

Query  438  CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA  511
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  -------------------------------GAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA  478

Query  512  TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC  552

Query  586  CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTAAGAAAAAT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTAAGAAAAAT  626

Query  660  TGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAATAATGAAA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  TGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAATAATGAAA  700

Query  734  CCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCAT---CAGGAAGGGGAAAGC  804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
Sbjct  701  CCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGCAGGAAGGGGAAAGC  774

Query  805  ATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCACTGCCA  878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  ATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCACTGCCA  848

Query  879  GAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTGCAGAG  952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  GAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTGCAGAG  922

Query  953  TCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  923  TCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTGGGCATGGTG  969