Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07754
• Subject: NM_201230.5
• Aligned Length: 1141
• Identities: 981
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74
            |||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74

Query   75  GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA  148
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA  148

Query  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG  222
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG  222

Query  223  GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG  296
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG  296

Query  297  CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370
            ||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370

Query  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA  444

Query  445  CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA  518
            ||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct  445  CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA  518

Query  519  GAAGGCCAATGATGAGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTC  592
            ||||.|.|....||||.|||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  GAAGACTAGCAGTGAGACCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAGCCTGC  592

Query  593  ACTTACTGTCCCATGAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGC--TG  664
            |||.||||.|||||||.||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.||||  |||  ||
Sbjct  593  ACTCACTGGCCCATGAGACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AGCAGTG  664

Query  665  GCCTTTGTCCAGATGAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACT  738
            .||||||||||||||..||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct  665  CCCTTTGTCCAGATGGGGATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAAAAACC  738

Query  739  TACGGTTTGAGGAATGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCTTAAAA  810
            ||.||||.|||...|||||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.||  ||  ||||.|||||..
Sbjct  739  TATGGTTGGAGAGCTGAACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACTTAAGG  810

Query  811  AGTGGACTCAGCTCCCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAA  884
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||..||||
Sbjct  811  AGCGGTCTCAGCTCCCTGGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTCCTGAA  884

Query  885  AGATCTGAAATTGATCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATG  958
            .||||||||||||.|..||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  885  GGATCTGAAATTGGTTGGTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGCTGATG  958

Query  959  ATTTTAATAGTACCAGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCT  1032
            |||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  959  ATTTTAATAGTGCTAGCCATCGCTCAGAAAAAAGTGAGCTAAGTATTGGTGAAGAGATTGAAGAAGACCTTTCC  1032

Query 1033  GTGGAAATAGATGACATCAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAG  1106
            .|||.|.||||.|||...||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1033  ATGGGAGTAGAGGACGGGAACACCAGTGATAAACTCGATGACCTCACACAAGACCTGACTGTTTCCCAGCTCAG  1106

Query 1107  TGATGTTGCGGATTATCTGGAAGATGTTGCA  1137
            |||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1107  TGATGTTGCTGACTATCTGGAAGATGTTGCA  1137