Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07799
• Subject: XM_011526410.1
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1099
• Gaps: 324

Alignment

Query    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA  370
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA  58

Query  371  CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   59  CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC  132

Query  445  CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  133  CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT  206

Query  519  GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  207  GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG  280

Query  593  CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  354

Query  667  TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  355  TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC  428

Query  741  TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  429  TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG  502

Query  815  ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  503  ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG  576

Query  889  GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  650

Query  963  CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCT-----  1031
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  651  CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGGTGA  724

Query 1032  -------GAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG  1098
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  GCCCCCCGAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG  798

Query 1099  GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA  872

Query 1173  TGAGGAGATCGTGGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC  1246
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  TGAGGAGATCGTGGAGGACGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC  946

Query 1247  CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1020

Query 1321  GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA  1094

Query 1395  TCACCGCCGGGATTTCTGG  1413
            ||||||||||||.||||||
Sbjct 1095  TCACCGCCGGGACTTCTGG  1113