Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07805
- Subject:
- NM_001286194.1
- Aligned Length:
- 3948
- Identities:
- 3811
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCGCAGCCGCTGCTGCCAGCGCTTCCTCCTCTGTCTTCGCCGAGCGGGGCTGGTTCCTGCGGCCCGAGCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------ATGGAGGCCGTGA 13
|||||||||||||
Sbjct 75 CGGGGAGTGCAGTGGCCGCCGCCTCTTCCGCCGCCGGGCTCGGGGCCTCCGCAGCGACAACATGGAGGCCGTGA 148
Query 14 AGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATT 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGACCTTCAATAGCGAGTTGTATTCCCTGAATGACTATAAACCACCCATTTCGAAAGCGAAAATGACCCAAATT 222
Query 88 ACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATG 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTAAGGCAGCCATCAAAGCTATTAAGTTCTATAAACATGTGGTACAGAGTGTTGAGAAGTTTATTCAGAAATG 296
Query 162 TAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGACATCAGTTTGGTC 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAAACCAGAATACAAAGTACCTGGACTTTATGTTATTGACTCCATTGTGCGACAATCCCGACATCAGTTTGGTC 370
Query 236 AAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCT 309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGAAAAGGATGTGTTTGCACCCAGATTTAGTAATAACATCATTAGCACTTTCCAGAATTTATATCGTTGCCCT 444
Query 310 GGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTAAGAGTGAGATTAT 383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGGATGACAAGAGTAAAATAGTGAGAGTACTAAACTTATGGCAGAAGAATAATGTATTTAAGAGTGAGATTAT 518
Query 384 TCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTG 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGCCCCTTTTGGATATGGCAGCCGGGATTCCGCCTCCAGTTGTCACACCTGTTTTGGCCAGCACTACCACTG 592
Query 458 CTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCG 531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTATGAGCAATACTCCAGGAACTCCTGTGACACCTGTTACTCCGGCCAATGTGGTCCAAGGCTTACCTGATCCG 666
Query 532 TGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCA 605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGGGTATCTCAGATAACAAATACAGATACACTTGCGGCTGTAGCTCAGATCTTGCAAAGTCCTCAAGGCCAGCA 740
Query 606 GCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATG 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTTCAACAATTAATACAAACCTTACAGATACAACAACAGAAGCCCCAGCCTTCCATTCTGCAGGCCCTAGATG 814
Query 680 CTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACT 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGGTCTTGTTGTTCAGTTGCAAGCTCTTACGGCACAACTTACAGCTGCAGCTGCAGCTGCCAACACTCTTACT 888
Query 754 CCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAG 827
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCTTAGAACAGGGAGTCTCCTTTAACAAGAAGTTGATGGATAGGTTTGATTTTGGGGAAGACTCTGAGCATAG 962
Query 828 TGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAACATTTCCATTTTTC 901
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 963 TGAAGAACCCAAAAAGGAAATTCCAGCTTCACAACTTTCTCACGTTTCAGAATCTGTGAACAATTCCATTTTTC 1036
Query 902 ATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCT 975
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATCAGATAGCAGAACAACTACAACAGCAAAACCTAGAACATCTCAGACAGCAGCTCTTGGAGCAGCAACAGCCT 1110
Query 976 CAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAG 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAAAAGGCCACTCCTCAGGATAGTCAGGAAGGAACCTTTGGGTCAGAGCATTCAGCGTCACCATCACAAGGGAG 1184
Query 1050 TAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAACAGGATATGGATA 1123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGTCAGCAGCATTTTCTTGAACCTGAAGTCAATTTGGATGATTCCATAGATATTCAGCAACAGGATATGGATA 1258
Query 1124 TAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGA 1197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TAGATGAAGGGCAAGATGGAGTGGAAGAGGAGGTCTTTGAACAAGAAGCTAAGAAAGTGGCGGTTCGCTCAAGA 1332
Query 1198 TCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAA 1271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCAAGAACACATTCACGATCTCGTTCAAGATCACCAAGAAAACGAAGGTCTAGGTCACGGTCTGGCTCTAGAAA 1406
Query 1272 GCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGGTCGTATTCAAGTG 1345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCGTAAACACAGAAAGCGATCACGCTCCCGCTCAAGAGAAAGAAAGAGGAAATCATCACGGTCGTATTCAAGTG 1480
Query 1346 AAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATCTAAAACACTAAGT 1419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAAGGAGAGCCAGAGAAAGGGAGAAAGAACGACAGAAAAAGGGATTACCTCCAATTAGATCTAAAACACTAAGT 1554
Query 1420 GTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGA 1493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTATGTAGTACTACTCTCTGGGTTGGGCAAGTGGACAAGAAGGCAACACAGCAAGACTTAACCAACCTGTTTGA 1628
Query 1494 AGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGCATGGTTCATCGAC 1567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAGTTTGGACAGATTGAATCCATTAATATGATTCCTCCCCGGGGCTGTGCTTATGTCTGCATGGTTCATCGAC 1702
Query 1568 AAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCT 1641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGATGCATTTCGAGCTCTTCAGAAACTCAGTTCTGGATCATATAAAATTGGGTCCAAGGTCATTAAGATCGCT 1776
Query 1642 TGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAGTTACATATATACC 1715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGGGCTTTAAACAAAGGTGTAAAAACAGAATACAAACAATTCTGGGATGTGGATCTTGGAGTTACATATATACC 1850
Query 1716 ATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAGGAGACTGTAAATA 1789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ATGGGAAAAAGTTAAAGTGGATGACTTGGAAGGTTTTGCAGAAGGAGGCATGATTGATCAGGAGACTGTAAATA 1924
Query 1790 CTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTT 1863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTGAGTGGGAAACTGTGAAAAGCTCAGAACCTGTTAAAGAGACGGTCCAGACAACTCAGAGCCCAACTCCAGTT 1998
Query 1864 GAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGC 1937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAAAAGGAGACAGTGGTCACAACCCAGGCAGAGGTTTTCCCTCCTCCTGTTGCTATGTTGCAGATTCCAGTGGC 2072
Query 1938 GCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCA 2011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCCAGCCGTGCCTACAGTTAGTTTAGTCCCACCAGCATTTCCTGTGTCGATGCCGGTTCCTCCTCCTGGATTCA 2146
Query 2012 GTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCT 2085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTCCAATCCCTCCACCTCCTTTTTTAAGAGCAAGTTTTAACCCTTCACAACCACCACCTGGTTTCATGCCGCCT 2220
Query 2086 CCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATT 2159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CCAGTTCCCCCACCTGTTGTGCCACCCCCTACGATTCCACCAGTAGTACCAACATCTTTAGTGCAGCCGTCATT 2294
Query 2160 ATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCA 2233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ATCCATGACACCGGAAACTGTGAAAGATGTTGGATTTGGTAGCCTTGTTATACCAGGCGGTTCTGTTGCCAGCA 2368
Query 2234 ATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAA 2307
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ATCTTGCTACTTCCGCTCTGCCAGCTGGAAATGTTTTTAATGCTCCAACTAAACAGGCAGAGCCTGAAGAAAAA 2442
Query 2308 GTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAAATGATATTTCAAG 2381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GTACCTCATCTTATAGACCACCAGATTTCTTCTGGTGAAAACACCAGATCAGTGATTCCAAATGATATTTCAAG 2516
Query 2382 TAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAA 2455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TAATGCTGCAATTTTAGGAGGACAGCCGCCAAATGTGACAAGCAATTCTGGAATTCTGGGAGTCCAAAGACCAA 2590
Query 2456 ATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCC 2529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 ATGTATCAAGTAATTCTGAAATTCTTGGGGTCCGGCCATCTAATGTTTCCAGTAGTTCTGGGATTATTGCAGCC 2664
Query 2530 CAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACT 2603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CAACCACCAAATATTCTAAATAACTCTGGAATATTGGGAATACAGCCACCCAGTGTGTCAAATAGTTCTGGACT 2738
Query 2604 TTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCAAATGTTCCAAATA 2677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTTGGGAGTGCTACCCCCAAATATACCTAACAATTCTGGACTTGTAGGAGTACAGCCACCAAATGTTCCAAATA 2812
Query 2678 CTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGG 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CTCCTGGACTTCTGGGAACACAGCCACCAGCTGGACCTCAAAACTTACCCCCTTTAAGTATCCCTAATCAAAGG 2886
Query 2752 ATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAAT 2825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 ATGCCCACAATGCCAATGTTAGACATTCGTCCGGGACTAATACCACAGGCACCTGGGCCAAGATTCCCTTTAAT 2960
Query 2826 ACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTTCATCCACCACCCC 2899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 ACAGCCTGGAATTCCACCCCAACGGGGAATCCCACCCCCATCGGTACTTGATTCAGCTCTTCATCCACCACCCC 3034
Query 2900 GTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTA 2973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 GTGGACCTTTTCCTCCAGGAGATATTTTTAGTCAACCAGAAAGACCTTTTTTAGCTCCTGGAAGACAAAGCGTA 3108
Query 2974 GACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTA 3047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 GACAATGTTACTAACCCAGAAAAAAGGATACCACTTGGGAATGATAACATTCAACAGGAAGGAGATAGAGATTA 3182
Query 3048 TCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGC 3121
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 CCGGTTTCCTCCTATAGAAACCAGGGAAAGCATTAGTAGACCTCCCCCTGTGGATGTTAGAGATGTGGTTGGGC 3256
Query 3122 GGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTA 3195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GGCCTATAGATCCAAGAGAAGGTCCTGGACGGCCTCCACTAGATGGTAGGGATCATTTTGGAAGACCTCCTGTA 3330
Query 3196 GATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGA 3269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GATATAAGAGAGAATCTTGTGAGGCCAGGTATAGATCATCTTGGTCGAAGAGACCACTTTGGCTTTAATCCAGA 3404
Query 3270 GAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAG 3343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 GAAGCCCTGGGGGCATAGAGGAGATTTTGATGAGAGAGAGCATCGGGTTCTACCGGTCTATGGTGGTCCAAAAG 3478
Query 3344 GCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGA 3417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 GCTTACATGAAGAAAGAGGTAGATTTCGGTCTGGAAACTATCGATTTGATCCTAGAAGTGGTCCTTGGAACCGA 3552
Query 3418 GGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGA 3491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GGATTTGGACAAGAAGTTCACAGAGATTTTGATGACCGCAGAAGACCCTGGGAGAGGCAAAGGGATAGGGATGA 3626
Query 3492 CAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAAAACACTTGGGTTC 3565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 CAGAGATTTTGATTTCTGCAGAGAAATGAATGGAAATCGTCTTGGACGAGACAGAATTCAAAACACTTGGGTTC 3700
Query 3566 CCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAG 3639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3701 CCCCTCCTCATGCTCGGGTTTTTGATTATTTTGAAGGGGCCACTTCTCAACGAAAAGGTGATAATGTGCCTCAG 3774
Query 3640 GTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATCCTGAACTTTATGA 3713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3775 GTTAATGGTGAAAATACAGAGAGACATGCTCAGCCACCACCTATACCAGTACAGAATGATCCTGAACTTTATGA 3848
Query 3714 AAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGG 3787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3849 AAAACTGACATCTTCAAATGAAATAAACAAGGAGAAGAGTGACACAGTTGCTGATATAGAAAGTGAACCAGTGG 3922
Query 3788 TAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA 3813
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3923 TAGAAAGCACAGAAACTGAGGGGACA 3948