Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07805
Subject:
NM_001286194.1
Aligned Length:
1316
Identities:
1270
Gaps:
45

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQI  29
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPQPLLPALPPLSSPSGAGSCGPSGGECSGRRLFRRRARGLRSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQI  74

Query   30  TKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCP  103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIVRQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCP  148

Query  104  GDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDP  177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVTPVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDP  222

Query  178  WVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLT  251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  WVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQPSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLT  296

Query  252  PLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNISIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQP  325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVSESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQP  370

Query  326  QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSR  399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  QKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSIDIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSR  444

Query  400  SRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLS  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  SRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKRKSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLS  518

Query  474  VCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIA  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  VCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGCAYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIA  592

Query  548  WALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPV  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  WALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGGMIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPV  666

Query  622  EKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPP  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  EKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVSMPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPP  740

Query  696  PVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEK  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  PVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLVIPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEK  814

Query  770  VPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAA  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  VPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNSGILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAA  888

Query  844  QPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQR  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  QPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVGVQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQR  962

Query  918  MPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  MPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVLDSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSV  1036

Query  992  DNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPV  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  DNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPPVDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPV  1110

Query 1066  DIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNR  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  DIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRVLPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNR  1184

Query 1140  GFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQ  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGRDRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQ  1258

Query 1214  VNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT  1271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  VNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTVADIESEPVVESTETEGT  1316