Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07882
Subject:
XM_006514235.2
Aligned Length:
1171
Identities:
1009
Gaps:
112

Alignment

Query    1  -------------------------------------MIAVSFKCRCQILRRLTKDESPYTKSASQTKPPDGAL  37
                                                 .....|           ..||||||||||||||||||
Sbjct    1  MDRFLGFVKQIRRSRRRKGKKYRPEEDYQEGYEDVYYYASEHF-----------RNESPYTKSASQTKPPDGAL  63

Query   38  AVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAK  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   64  AVRRQSIPEEFKGSTVVELMKKEGTTLGLTVSGGIDKDGKPRVSNLRQGGIAARSDQLDVGDYIKAVNGINLAK  137

Query  112  FRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSSVIFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRPVVITCV  185
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  138  FRHDEIISLLKNVGERVVLEVEYELPPVSVQGSSVMFRTVEVTLHKEGNTFGFVIRGGAHDDRNKSRPVVITCV  211

Query  186  RPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEAALLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTP  259
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  212  RPGGPADREGTIKPGDRLLSVDGIRLLGTTHAEAMSILKQCGQEATLLIEYDVSVMDSVATASGPLLVEVAKTP  285

Query  260  GASLGVALTTSMCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEIL  333
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  286  GASLGVALTTSVCCNKQVIVIDKIKSASIADRCGALHVGDHILSIDGTSMEYCTLAEATQFLANTTDQVKLEIL  359

Query  334  PHHQTRLALKGPDHA----------------------------------------------------ALVSSSF  355
            ||||||||||||||.                                                    |.|.|| 
Sbjct  360  PHHQTRLALKGPDHVKIQRSDRQHPWDAWASNQCGVHTNHHHNTYHPDHCRVPALTFPKALPPNSPPAMVPSS-  432

Query  356  SPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVT  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  SPTSMSAYSLSSLNMGTLPRSLYSTSPRGTMMRRRLKKKDFKSSLSLASSTVGLAGQVVHTETTEVVLTADPVT  506

Query  430  GFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEASQLLRDSSITSKVTL  503
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  507  GFGIQLQGSVFATETLSSPPLISYIEADSPAERCGVLQIGDRVMAINGIPTEDSTFEEANQLLRDSSITSKVTL  580

Query  504  EIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHNVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNI  577
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  581  EIEFDVAESVIPSSGTFHVKLPKKHSVELGITISSPSSRKPGDPLVISDIKKGSVAHRTGTLELGDKLLAIDNI  654

Query  578  RLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLT  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  RLDNCSMEDAVQILQQCEDLVKLKIRKDEDNSDEQESSGAIIYTVELKRYGGPLGITISGTEEPFDPIIISSLT  728

Query  652  KGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPISSHLSDLGD  725
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|..||||
Sbjct  729  KGGLAERTGAIHIGDRILAINSSSLKGKPLSEAIHLLQMAGETVTLKIKKQTDAQSASSPKKFPIPGHSGDLGD  802

Query  726  VEEDSSPAQKPGKLSDMYPSTVPSVDSAVDSWDGSAIDTSYGTEGTSFQASGYNFNTYDWRSPKQRGSLSPVTK  799
            .|||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||.|||..|..||.||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  803  GEEDPSPIQKPGKLSDAYPSTVPSVDSAVDSWDGSGIDASYGSQGSTFQTSGYNYNTYDWRSPKQRTSLSPVPK  876

Query  800  PRSQTYPDVGLSYEDWDRSTASGFAGAADSAETEQEENFWSQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTL  873
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  PRSQTYPDVGLSNEDWDRSTASGFVGASDSADAEQEENFWSQALEDLETCGQSGILRELEEKADRRVSLRNMTL  950

Query  874  LATIMSGSTMSLNHEAPTPRSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTP  947
            |||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  951  LATIMSGSTMSLNHEAPMARSQLGRQASFQERSSSRPHYSQTTRSNTLPSDVGRKSVTLRKMKQEIKEIMSPTP  1024

Query  948  VELHKVTLYKDSDMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDLGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAE  1021
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025  VELHKVTLYKDSGMEDFGFSVADGLLEKGVYVKNIRPAGPGDVGGLKPYDRLLQVNHVRTRDFDCCLVVPLIAE  1098

Query 1022  SGNKLDLVISRNPLASQKSIDQQSLPGDWSEQNSAFFQQPSHGGNLETREPTNTL------  1076
            ||||||||||||||||||||.|..||.|||||||||||||||||     .|..|.      
Sbjct 1099  SGNKLDLVISRNPLASQKSIEQPALPSDWSEQNSAFFQQPSHGG-----IPGDTVYFWQSL  1154