Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07959
- Subject:
- NM_001199812.1
- Aligned Length:
- 2886
- Identities:
- 2825
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC 74
Query 75 CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA 148
Query 149 GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT 222
Query 223 GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA 296
Query 297 TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC 370
Query 371 GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT 444
Query 445 TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC 518
Query 519 TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA 592
Query 593 TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC 666
Query 667 ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT 740
Query 741 TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG 814
Query 815 CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT 888
Query 889 GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC 962
Query 963 CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA 1036
Query 1037 AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA 1110
Query 1111 ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT 1184
Query 1185 ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG 1258
Query 1259 CCAAGGGCAGGCCCCGTCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT 1332
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCAAGGGCAGGCCCCATCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT 1332
Query 1333 GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG 1406
Query 1407 TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG 1480
Query 1481 CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA 1554
Query 1555 AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA 1628
Query 1629 AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT 1702
Query 1703 TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA 1776
Query 1777 TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA 1850
Query 1851 GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA 1924
Query 1925 AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC 1998
Query 1999 ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC 2072
Query 2073 ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG 2146
Query 2147 CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT 2220
Query 2221 GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAA 2294
Query 2295 ATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTGCAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTT 2368
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ATATACCCCTGTTTCTTATAT----------------------------------------------------- 2315
Query 2369 CTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAGCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAAT 2442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2316 -------GAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAGCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAAT 2382
Query 2443 CCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGGCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2383 CCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGGCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATC 2456
Query 2517 TAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTGAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGAC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2457 TAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTGAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGAC 2530
Query 2591 AAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGATGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2531 AAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGATGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTC 2604
Query 2665 AGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACACACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGC 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2605 AGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACACACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGC 2678
Query 2739 CAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2679 CAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGC 2752
Query 2813 AAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACAGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2753 AAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACAGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT 2826