Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08329
• Subject: NM_177682.3
• Aligned Length: 1450
• Identities: 1282
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGGCTGCAGCGGCGGCCGGGGCCGGGAGCGGGCCCTGGGCGGCCCAGGAGAAGCAGTTCCCGCCGGCGCTGCT  74
            |||||.|||||.|||||| ||||||||.|     |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCAGCCGCGGCC-GGGCCGGGTG-----CTTGGGCGGCCCAGGAGAAGCAGTTCCCGCCAGCGCTGCT  68

Query   75  GAGTTTCTTCATCTACAACCCGCGCTTCGGGCCGCGCGAAGGACAGGAGGAAAATAAGATTTTATTTTATCATC  148
            |||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||.||||||||.|||.|.|||||.||||
Sbjct   69  GAGCTTCTTCATCTACAACCCCCGTTTCGGGCCGCGCGAGGGAGAGGAAGAAAATAAAATTCTGTTTTACCATC  142

Query  149  CAAATGAGGTAGAAAAGAATGAGAAGATTAGAAATGTCGGATTGTGTGAAGCTATTGTACAGTTTACAAGGACA  222
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  143  CAAATGAAGTAGAAAAGAATGAAAAAATTAGAAATGTTGGATTATGTGAAGCAATTGTACAGTTTACAAGGACT  216

Query  223  TTTAGCCCATCAAAACCTGCAAAATCTTTACATACACAGAAGAACAGACAGTTCTTCAATGAACCAGAAGAAAA  296
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  TTTAGCCCATCGAAACCTGCAAAATCTTTACACACACAGAAGAACAGACAGTTCTTCAATGAACCAGAAGAAAA  290

Query  297  TTTCTGGATGGTCATGGTTGTTCGGAATCCTATAATTGAAAAACAGAGTAAAGATGGAAAACCAGTTATTGAAT  370
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||..|.||..|.||.|
Sbjct  291  TTTCTGGATGGTTATGGTTGTTCGGAATCCTATCATCGAGAAGCAAAGTAAAGATGGCAAGGCGGTAGTGGAGT  364

Query  371  ATCAAGAGGAGGAGTTGTTGGACAAGGTTTATAGCTCGGTGCTGCGGCAGTGCTACAGCATGTACAAGCTTTTT  444
            |.||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  365  ACCAAGAGGAGGAGCTGTTGGACAAGGTGTACAGCTCAGTGCTGCAGCAGTGCTACAGCATGTACAAGCTTTTC  438

Query  445  AATGGTACATTTCTGAAAGCCATGGAAGACGGAGGCGTCAAGCTTCTGAAAGAAAGATTAGAGAAATTCTTCCA  518
            |||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  439  AATGGGACGTTTCTGAAAGCCATGGAAGATGGAGGCGTCAAGCTCCTAAAGGAAAGATTAGAGAAATTCTTCCA  512

Query  519  TCGGTATTTGCAAACGCTACATTTGCAGTCATGTGACCTACTTGACATTTTTGGTGGAATCAGCTTCTTCCCGT  592
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  513  TCGGTATTTGCAGACACTACATTTGCAGTCATGTGACCTACTTGATATTTTTGGTGGAATCAGCTTCTTCCCAT  586

Query  593  TGGATAAAATGACTTATTTGAAAATCCAGTCCTTTATTAATAGAATGGAGGAAAGCCTGAATATAGTCAAATAC  666
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||.|.|.||||||||||.
Sbjct  587  TGGATAAAATGACTTACTTGAAAATCCAGTCCTTTATTAACCGAATGGAAGAAAGCCTAAGTGTAGTCAAATAT  660

Query  667  ACTGCTTTTCTCTATAACGATCAGCTCATCTGGAGTGGATTAGAACAAGATGACATGAGAATTTTATACAAATA  740
            ||.||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  661  ACAGCATTCCTCTACAATGACCAACTTATCTGGAGTGGACTAGAGCAAGATGACATGAGAATTTTGTACAAATA  734

Query  741  CCTTACCACCTCCCTTTTCCCAAGGCACATCGAACCTGAGTTAGCAGGAAGGGATTCTCCAATAAGAGCAGAAA  814
            |||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||.|.||.|||||.|
Sbjct  735  CCTCACCACCTCACTGTTCCCCAGGCACATCGAACCTGAGTTGGCGGGAAGGGACTCCCCAGTCAGGGCAGAGA  808

Query  815  TGCCAGGAAATCTTCAACACTATGGAAGATTTCTTACCGGACCCTTGAACCTCAATGATCCAGATGCAAAATGC  888
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  809  TGCCTGGGAATCTTCAGCACTATGGAAGATTTCTTACTGGACCCTTGAACCTTAATGATCCAGAAGCAAAATGC  882

Query  889  AGATTCCCCAAAATTTTTGTAAATACAGATGACACTTATGAAGAGCTCCATTTAATCGTTTATAAGGCCATGAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  883  AGATTCCCCAAAATTTTTGTAAATACAGATGACACGTATGAAGAGCTCCATTTAATTGTTTATAAGGCCATGAG  956

Query  963  TGCGGCTGTGTGCTTTATGATCGACGCCTCTGTCCAC----CCAACGTTGGATTTTTGCCGAAGACTGGACAGC  1032
            |||.||.||||||||.|||||.||||||    |||||    |..|||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  957  TGCAGCCGTGTGCTTCATGATTGACGCC----TCCACGCCGCTCACGCTGGATTTCTGCCGAAGACTGGACAGC  1026

Query 1033  ATCGTTGGGCCCCAGCTCACAGTGCTGGCCTCTGACATCTGTGAACAGTTTAACATCAACAAGAGGATGTCCGG  1106
            |||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1027  ATCGTTGGGCCCCAGCTTACGGTGCTGGCATCTGACATCTGTGAGCAGTTTAATATCAACAAGAGGATCTCTGG  1100

Query 1107  GTCTGAGAAAGAACCCCAGTTTAAGTTTATCTACTTCAACCACATGAATCTCGCCGAGAAGAGCACAGTTCACA  1180
            ||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||.|||.||||||
Sbjct 1101  GTCTGAAAAGGAGCCCCAGTTTAAGTTCATCTACTTCAACCACATGAATTTAGCAGAGAAAAGTACAATTCACA  1174

Query 1181  TGAGGAAAACGCCCAGCGTGTCGCTCACTTCCGTGCACCCGGATTTAATGAAGATTCTCGGTGACATCAACAGT  1254
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||||||||..|.||.||||||||||||
Sbjct 1175  TGAGGAAAACGCCCAGTGTGTCACTCACATCCGTCCACCCAGATCTAATGAAGATATTAGGGGACATCAACAGT  1248

Query 1255  GACTTTACCAGAGTGGATGAAGATGAGGAGATCATTGTGAAGGCCATGAGTGATTACTGGGTTGTTGGAAAGAA  1328
            |||||||||||||..|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1249  GACTTTACCAGAGCAGATGAAGATGAAGAAATCATTGTGAAGGCCATGAGCGACTACTGGGTTGTTGGGAAGAA  1322

Query 1329  GTCTGATCGGCGGGAGCTCTATGTTATTTTGAATCAAAAAAATGCAAACCTGATTGAAGTAAATGAAGAGGTCA  1402
            ||||||.|.|||||||||.||.||.|||.|.|.|||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1323  GTCTGACCAGCGGGAGCTGTACGTGATTCTCAGTCAGAAGAATGCGAACCTGATCGAGGTCAATGAAGAGGTGA  1396

Query 1403  AGAAACTTTGTGCAACGCCGTTCAACAACATCTTCTTCTTGGAT  1446
            |||||||.|||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  AGAAACTGTGTGCCACGCAGTTCAACAACATCTTCTTCTTGGAT  1440