Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08333
• Subject: NM_001318499.2
• Aligned Length: 759
• Identities: 634
• Gaps: 123

Alignment

Query   1  ATGAGCGGAACCTTGGGAAAGGTGCTGTGCCTGAGGAACAATACCATTTTTAAGCAAGCCTTTTCTCTCTTAAG  74
           ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAGCGGAACCTTGGAAAAGGTGCTGTGCCTGAGGAACAATACCATTTTTAAGCAAGCCTTTTCTCTCTTAAG  74

Query  75  GTTTAGAACTTCAGGAGAGAAGCCCATCTATTCTGT--------------------------------------  110
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  75  GTTTAGAACTTCAGGAGAGAAGCCCATCTATTCTGTAGAGAGACGGTCTTGCTTGTGGCCCAGGCTTGAGTACA  148

Query 111  --------------------------------------------------------------------------  110
                                                                                     
Sbjct 149  GTGGCATGATCATAGCTCCCTGCAGCCTCGAACTCCTGGGTTCAAGCAATCCTCCTGCCTCAGCCTCTGGAGTA  222

Query 111  -----------AGGTGGAATTCTACTAAGTATCAGTCGGCCCTACAAGACAAAGCCCACCCACGGCATTGGAAA  173
                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GCTGGGATTACAGGTGGAATTCTACTAAGTATCAGTCGGCCCTACAAGACAAAGCCCACCCACGGCATTGGAAA  296

Query 174  GTACAAGCACTTAATTAAAGCAGAAGAGCCCAAGAAGAAGAAGGGAAAAGTGGAAGTGAGAGCCATTAATTTGG  247
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  GTACAAGCACTTAATTAAAGCAGAAGAGCCCAAGAAGAAGAAGGGAAAAGTGGAAGTGAGAGCCATTAATTTGG  370

Query 248  GGACAGATTATGAATATGGGGTTTTAAATATTCATCTGACTGCATATGATATGACCCTGGCAGAGAGTTATGCC  321
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GGACAGATTATGAATATGGGGTTTTAAATATTCATCTGACTGCATATGATATGACCCTGGCAGAGAGTTATGCC  444

Query 322  CAGTATGTTCACAACCTCTGCAACTCTCTCTCCATTAAAGTCGAGGAAAGTTATGCAATGCCAACCAAAACCAT  395
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CAGTATGTTCACAACCTCTGCAACTCTCTCTCCATTAAAGTCGAGGAAAGTTATGCAATGCCAACCAAAACCAT  518

Query 396  AGAAGTGTTGCAGTTGCAGGACCAAGGCAGCAAAATGCTCCTGGACTCAGTGCTTACCACCCATGAGCGAGTGG  469
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AGAAGTGTTGCAGTTGCAGGACCAAGGCAGCAAAATGCTCCTGGACTCAGTGCTTACCACCCATGAGCGAGTGG  592

Query 470  TTCAGATCAGCGGTTTGAGTGCTACGTTTGCAGAAATTTTCTTGGAAATAATCCAAAGCAGTCTTCCTGAAGGA  543
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  TTCAGATCAGCGGTTTGAGTGCTACGTTTGCAGAAATTTTCTTGGAAATAATCCAAAGCAGTCTTCCTGAAGGA  666

Query 544  GTCAGACTGTCAGTGAAGGAGCACACTGAAGAAGACTTCAAGGGACGATTCAAAGCTCGACCAGAACTGGAAGC  617
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 667  GTCAGACTGTCAGTGAAGGAGCACACTGAAGAAGACTTCAAGGGACGATTCAAAGCTCGACCAGAACTGGAAGA  740

Query 618  ACTGTTGGCCAAGTTGAAG  636
           |||||||||||||||||||
Sbjct 741  ACTGTTGGCCAAGTTGAAG  759