Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08528
• Subject: XM_006499735.3
• Aligned Length: 1529
• Identities: 1129
• Gaps: 229

Alignment

Query    1  ATGTCTGAAAACCTTGACAAGTCCAATGTAAATGAAGCAGGAAAATCAAAATCCAATGATTCTGAGGAAGGCCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGAAGATGCTGTGGAAGGTGCTGATGAAGCCTTACAAAAAGCAATAAAGTCAGACTCCTCCAGCCCCCAAAGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCAGAGACCTCACTCTAGTCCTCCTCGCTTTGTGACAGTAGAAGAACTTCTAGAGACAGCGAGAGGCGTCACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACATGGCTCTAGCCCATGAAATTGTAGTAAATGGAGACTTTCAGATTAAACCAGTTGAATTACCAGAAAACAG  296
               ||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||..|.|||||||||.|.|||..|||
Sbjct    1  ---ATGGCTCTGGCCCATGAAATTGTAGTAACTGGAGACTTCCGGATTAACGCTGTTGAATTAGCCGAAGGCAG  71

Query  297  CTTGAAGAAGAGAGTAAAGGAGATTGTACATAAAGCGTTTTGGGATTGCTTGAGTGTGCAGCTAAGTGAAGATC  370
            ||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||.|
Sbjct   72  CTTGGAGAAGAGAGTAAAAGAGATTGTACATAAAGCATTCTGGGATTGCTTGAGTGTCCAGTTAAGTGAAGAGC  145

Query  371  CCCCAGCATATGACCATGCTATCAAACTTGTAGGAGAAATCAAAGAGACTCTCTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT  444
            |||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  146  CCCCAACATATGACCATGCCATCAAACTTGTAGGAGAGATCAAAGAGACTCTGTTATCTTTCTTGCTGCCTGGT  219

Query  445  CATACTAGACTGAGAAACCAGATAACAGAAGTCTTGGATCTGGATCTGATAAAGCAGGAAGCAGAGAATGGGGC  518
            ||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  220  CACACTAGACTAAGAAACCAGATAACGGAAGTCTTGGATCTGGAGCTGATAAAACAAGAAGCAGAGAATGGGGC  293

Query  519  GCTAGACATTTCCAGGCTGGCAGAATTCATTATTGGCATGATGGGGACACTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG  592
            .|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CCTAGACATTTCCAAGCTGGCAGAGTTCATTATTGGCATGATGGGGATATTGTGTGCACCTGCTCGAGATGAGG  367

Query  593  AAGTTAAGAAACTAAAGGACATTAAGGAAATAGTGCCCCTTTTCAGAGAAATTTTTTCTGTGTTGGACCTAATG  666
            |||||||.||||||||||.||||||||||||||||||.||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  368  AAGTTAAAAAACTAAAGGGCATTAAGGAAATAGTGCCTCTCTTCAGGGCAATATTTTCTGTGTTGGACCTAATG  441

Query  667  AAAGTGGACATGGCCAACTTTGCTATCAGTAGCATCAGGCCTCATCTCATGCAGCAGTCAGTTGAATACGAAAG  740
            |||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  442  AAAGTTGACATGGCCAACTTCGCCATCAGTAGCATTAGGCCGCACCTCATGCAGCAGTCAGTCGAGTATGAGAG  515

Query  741  GAAGAAGTTTCAAGAGATTTTGGAGAGGCAACCAAATTCCCTGGACTTTGTCACCCAGTGGCTGGAAGAAGCCT  814
            ||.|||||||||.||..|..||||||||||.||.||.|||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||.
Sbjct  516  GAGGAAGTTTCAGGAAGTGCTGGAGAGGCAGCCGAACTCCCTGGACTTTGCCACACAGTGGCTGGAAGAGGCCA  589

Query  815  CAGAGGACCTTATGACTCAGAAGTATAAACACGCCCTGCCAGTGGGGGGAATGGCTGCTGGCTCTGGGGACATG  888
            ||.|.||||||.|||.|||||||||.|||||.||||||||||..||||||...||||||||||||||||  |||
Sbjct  590  CAAATGACCTTTTGAGTCAGAAGTACAAACATGCCCTGCCAGCTGGGGGAGGCGCTGCTGGCTCTGGGG--ATG  661

Query  889  CCC--AGGCTGAGCCCTGTTGCTGTCCAGAATTACGCTTACCTGAAGCTTCTGAAGTGGGACCACCTCCAGAGG  960
            |||  ...||||.|||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.
Sbjct  662  CCCCACTCCTGACCCCTGTTTCTGTCCAGAATTTCGCCTACCTGAAGCTTCTGAAATGGGACCACTTCCAGAGA  735

Query  961  CCGTTCCCCGAAACAGTTTTAATGGACCAGTCTCGCTTCCACGAGCTCCAGTTGCAGCTGGAACAACTGACCAT  1034
            ||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||.|||.||.|
Sbjct  736  CCTTTCCCTGAGACAGTTTTGATGGACCAGTCTCGTTTCCAAGAGCTCCAGCTCCAGCTGGAGCAGCTGGCCGT  809

Query 1035  CCTGGGGGCTGTGTTGCTGGTCACCTTCAGCATGGCAGCGCCAGGAATTTCCAGCCAGGCCGACTTTGCTGAGA  1108
            ||||||.||.|||.||||||||||.|||||.|..||.||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||||
Sbjct  810  CCTGGGAGCCGTGCTGCTGGTCACGTTCAGTACCGCTGCACCGGGAATTTCTGGGCATGCCGACTTTGCCGAGA  883

Query 1109  AACTCAAGATGATTGTGAAGATTTTGCTAACAGATATGCACCTGCCCTCCTTCCATCTGAAGGACGTCCTCACT  1182
            |.|||||||||||.|||||||.|.|||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||.||||||.|||..||
Sbjct  884  AGCTCAAGATGATGGTGAAGACTCTGCTAACGGACATGCATCTGCCTTCCTTCCATCTGGAGGACGCCCTGGCT  957

Query 1183  ACCATCGGGGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGGTCCTCTCCCTTCACCACGGA  1256
            .||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.||...|.
Sbjct  958  TCCATTGGCGAGAAGGTGTGCCTGGAGGTGAGCAGCTGCCTCTCCCTGTGTGGCTCCTCCCCATTCTCCGTTGC  1031

Query 1257  CAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATCCAGGCCGTGGCCAGTCCCGATGACCCCATTCGCAGGATCATGGAAT  1330
            .||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1032  TAAGGAGACCGTGCTCAAGGGCCAGATTCAGGCCCTCGCCAGTCCCGAGGACCCCATTCGCAGGATCATGGAGT  1105

Query 1331  CTCGAATCCTGACCTTCTTAGAAACCTACCTTGCCTCGGGTCATCAGAAGCCATTGCCCACAGTCCCTGGGGGA  1404
            |.||.||..|.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||..||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1106  CCCGCATTTTCACCTTCTTGGAGACATACCTTGCCTCTGGTCATCAGAAGCCCCTGCCTACTGTGCCTGGGGGA  1179

Query 1405  CTCAGTCCAGTTCAGAGAGAGCTGGAGGAAGTTGCTATTAAATTTGCTCGCCTGGTCAACTATAACAAGATGGT  1478
            .|..||||..||||||.|||||||||.|||||||||.|.|||||||..||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  TTGGGTCCCATTCAGAAAGAGCTGGAAGAAGTTGCTGTGAAATTTGTGCGCCTGGTCAACTATAACAAGATGGT  1253

Query 1479  CTTCTGTCCATACTACGATGCAATCCTGAGTAAGATCCTCGTCCGATCC  1527
            .||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||.||||.|||
Sbjct 1254  GTTCTGTCCCTACTACGATGCAATCCTTAGTAAGCTCCTCCTCCGCTCC  1302