Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08562
• Subject: NM_153065.3
• Aligned Length: 2398
• Identities: 2020
• Gaps: 128

Alignment

Query    1  ATGGTACTTGCGCAAAGACGACGAGGAGGCTGCGAAAAGTTAAGGGCCGGACCGCAGGCTGTGCTCGCTTCCGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AAGTGGCTTCTGCGACAACATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGG  148
                               |||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------ATGCTGGCGGAGCTCGGCTTCATCCGGACCATCGGCGAGAATGACGAGGTGCCGG  55

Query  149  TGGAGCCCGAGTCTGACTCCGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGA-CAAAAAGCTTT  221
            |.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.| |.| ||.|||||.||
Sbjct   56  TTGAGCCCGAGTCGGACTCCGGAGACGAGGAGGAGGAGGGACCCATTGTGCTGGGCCG-CAAGCAGAAAGCCTT  128

Query  222  GGGGAAGAACCGCAGTGCTGATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCT  295
            |..||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||||
Sbjct  129  GCAGAAGAACCGCAGTGCTGACTTCAACCCTGACTTTGTTTTCACTGAGAAGGAGGGCATGTATGATGGCAGCT  202

Query  296  GGGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAA  369
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  203  GGGCCCTGGCTGATGTCATGAGCCAGCTCAAGAAGAAGCGGGCAGCCACTACACTAGATGAGAAGATTGAGAAA  276

Query  370  GTTCGAAAGAAAAGGAAAACAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGA  443
            ||.||.||||.||||||..|||||||.||.||||||||||||||||||.|||   ||||||||||||...|||.
Sbjct  277  GTCCGGAAGAGAAGGAAGGCAGAGGACAAGGAAGCCAAGTCTGGGAAGGTGG---AGGAGAAAGAAGGCCAGGC  347

Query  444  AGGCTCTGAACCAAAGGAGCAGGAAGACCTTCAAGAGAAT---------GATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAG  508
            ||.||||||.|..||||.||||            ||||||         |||||||.||||||..|.|||||||
Sbjct  348  AGACTCTGACCTGAAGGGGCAG------------GAGAATCCGGGTGAGGATGAGGCAGGCTCCAAGGATGAAG  409

Query  509  CCTCGGAGACTGACTACTCATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGG  582
            .|||.||||||||||||||.||.|..||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||   |
Sbjct  410  ACTCTGAGACTGACTACTCCTCTGAGGATGAGGAAATCCTCACCAAAGCAGACACACTCAAAGTGAAGGA---G  480

Query  583  AAGAAGAAGAAGAAGAAAGGACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTC  656
            |||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||.||||||||||||||..||||.||..|||.|||.||
Sbjct  481  AAGAAGAAGAAGAAGAAGGGCCAGGCAGCAGGAGGATTCTTTGAAGATGCATCCGAGTATGACAAAAGCCTGTC  554

Query  657  GTTCCAGGACATGAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGA  730
            .|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  555  CTTCCAGGACATGAACCTCTCCCGGCCCCTCCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACGCCAA  628

Query  731  TCCAGAAGGCGTGCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAA  804
            |||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  629  TCCAGAAGGCGTGTATCCCTGTGGGTCTGCTGGGGAAGGACATCTGCGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGCAAA  702

Query  805  ACTGCCGCCTTTGCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCT  878
            |||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct  703  ACTGCAGCCTTTGCACTGCCCGTCTTGGAGCGTCTGATCTACAAGCCCCGCCAGGCTGCAGTCACTCGCGTGCT  776

Query  879  GGTGCTAGTGCCCACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACA  952
            ||||||.||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||
Sbjct  777  GGTGCTGGTCCCCACGAGAGAGCTGGGCATCCAAGTGCACTCTGTCACCAAGCAGCTGGCCCAGTTCTGCAGCA  850

Query  953  TCACCACCTGCCTGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATC  1026
            ||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  851  TCACTACCTGCCTGGCTGTGGGTGGCCTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCCGCTCTTCGGGCAGCACCAGACATC  924

Query 1027  CTCATCGCCACCCCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGT  1100
            |||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  925  CTCATTGCCACACCTGGCCGGCTCATCGACCACCTCCATAACTGCCCCTCCTTCCACCTGAGCAGCATTGAAGT  998

Query 1101  GCTCATCCTGGACGAGGCTGACAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCATCCGAATGT  1174
            |||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  999  GCTCATCTTGGATGAGGCTGACAGGATGCTGGATGAGTATTTCGAGGAGCAGATGAAGGAGATTATCCGAATGT  1072

Query 1175  GTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCTTCTGTCTCC  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1073  GTTCCCACCACCGCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGATGAGGTGAAAGATCTGGCTTCGGTCTCC  1146

Query 1249  TTGAAGAATCCTGTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTCCTGCGGCAGGAGTTCATCCG  1322
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1147  TTAAAGAATCCTGTGCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTCGCTCCCTTCCTGCGGCAAGAGTTCATACG  1220

Query 1323  GATCCGGCCTAATCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCACTGACCATG  1396
            |||||||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||.|||.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 1221  GATCCGGCCTAATAGGGAAGGGGACCGGGAGGCCATTGTGGCAGCTCTGCTGATGAGAACCTTCACTGACCACG  1294

Query 1397  TGATGCTGTTCACGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGGCTGCAGGTG  1470
            |||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1295  TGATGCTCTTCACCCAGACCAAGAAGCAGGCCCATCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTGCTGGGGCTGCAGGTG  1368

Query 1471  GGTGAGCTCCATGGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGAACAGATTGA  1544
            ||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1369  GGCGAGCTCCACGGCAACTTGTCACAGACCCAGCGCCTGGAGGCCCTCCGGCGCTTTAAGGACGAACAGATTGA  1442

Query 1545  CATCCTCGTGGCCACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCAACTTCACAA  1618
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1443  CATCCTGGTGGCCACAGATGTGGCAGCCCGCGGTCTTGACATTGAAGGAGTGAAAACAGTGATCAACTTCACCA  1516

Query 1619  TGCCTAATACCATCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGGCGCTCAGTC  1692
            ||||.||.||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1517  TGCCCAACACTGTTAAACACTATGTGCACCGGGTGGGGCGGACGGCCCGTGCTGGCAGGGCTGGACGCTCTGTC  1590

Query 1693  TCTCTGGTGGGAGAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGTGAAGGCCAG  1766
            ||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||..|
Sbjct 1591  TCCCTAGTGGGAGAGGAGGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATCGTGAAGGCTGCCAAGGCGCCAGTGAAGGCTCG  1664

Query 1767  GATACTTCCCCAAGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGTATGCAGTTC  1840
            |||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1665  GATCCTTCCCCAGGATGTTATCCTCAAGTTCCGGGACAAGATTGAGAAATTGGAGAAAGATGTGTATGCAGTGC  1738

Query 1841  TGCAGCTAGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGGCTCCTGGAG  1914
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||||.||||.|||.|.|..
Sbjct 1739  TGCAGCTGGAGGCGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCGGAAGCCCAGATTGACACAGCACAGCGACTCTTAGCC  1812

Query 1915  AAGGGGAAGGAGGCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAA  1988
            ||.|||||.|||.|||..|.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813  AAAGGGAAAGAGACAGCAGACCAGGAGCCTGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAA  1886

Query 1989  AATTGCCAAAGCTCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATG  2062
            .|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1887  GATTGCTAAGGCTCTACAGGAGTTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATG  1960

Query 2063  CCAAAAAAAAGGGGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAACCCTCAAGGCGCAGATGTTTGCTGAA  2136
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1961  CCAAGAAAAAGGGGGAGATGACGGCAGAGGAGAGGTCCCAGTTTGAAATCCTCAAGGCACAGATGTTTGCAGAG  2034

Query 2137  CGGCTAGCGAAGAGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAGAGGTCCTGC  2210
            |||||.||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||   .|.|||.|||||
Sbjct 2035  CGGCTGGCCAAGAGGAATCGCAGAACCAAGCGAGCACGGGCAATGCCTGAGGACGAGCC---TACAGGCCCTGC  2105

Query 2211  CAAGAAGCAAAAGCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAAC  2284
            .||.|||||.||||||..|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2106  TAAAAAGCAGAAGCAGCAGCAGAAGTCTGTGTTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAAC  2179

Query 2285  AGTATCGAGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGAGGAAACTTT  2358
            |||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||..||..||||||.||||||  || ||||.|||||.
Sbjct 2180  AGTATCGGGCTGGCCCTTCCTTTGAAGAGAGGAAACAGTCAGGTCTGCCCCGCCAGAG--GA-GAGGGAACTTC  2250

Query 2359  AAATCTAAATCCAGATACAAGAGGAGGAAG  2388
            ||||||||.|||||.||||||||.|.||||
Sbjct 2251  AAATCTAAGTCCAGGTACAAGAGAAAGAAG  2280