Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08967
Subject:
NM_001363438.1
Aligned Length:
941
Identities:
873
Gaps:
66

Alignment

Query   1  MWTEEAGATAEAQESGIRNKSSSSSQIPVVGVVTEDDEAQDVFKPMDLNRVIKLLEETDKDGLEEKQLKFVKKL  74
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Sbjct   1  MWTEEAGATAEAQESGIRNKSSSSSQIPVVGVVTEDDEAQDVFKPMDLNRVIKLLEETDKDGLEEKQLKFVKKL  74

Query  75  VQCYQNGLPLRDLAQIFKILNLCSGKIKNQPRFIESAYDIIKLCGLPFLKKKVSDEITYAEDTANSIALLGDLM  148
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Sbjct  75  VQCYQNGLPLRDLAQIFKILNLCSGKIKNQPRFIESAYDIIKLCGLPFLKKKVSDEITYAEDTANSIALLGDLM  148

Query 149  KIPSSELRIQICKCIVDFYHAEPPKKHIPGYQQASSSYKIQMAEVGGLAKTMVQSMTLLENQLVEKLWVLKVLQ  222
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Sbjct 149  KIPSSELRIQICKCIVDFYHAEPPKKHIPGYQQASSSYKIQMAEVGGLAKTMVQSMTLLENQLVEKLWVLKVLQ  222

Query 223  HLSTSEVNCTIMMKAQAASGICTHLNDPDPSGQLLFRSSEILWNLLEKSSKEEVIQQLSNLECLLALKEVFKNL  296
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Sbjct 223  HLSTSEVNCTIMMKAQAASGICTHLNDPDPSGQLLFRSSEILWNLLEKSSKEEVIQQLSNLECLLALKEVFKNL  296

Query 297  FMRGFSHYDRQLRNDILVITTIIAQNPEAPMIECGFTKDLILFATFNEVKSQNLLVKGLKLSNSYEDFELKKLL  370
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Sbjct 297  FMRGFSHYDRQLRNDILVITTIIAQNPEAPMIECGFTKDLILFATFNEVKSQNLLVKGLKLSNSYEDFELKKLL  370

Query 371  FNVIVILCKDLPTVQLLIDGKVILALFTYVKKPEKQKIIDWSAAQHEELQLHAIATLSSVAPLLIEEYMSCQGN  444
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Sbjct 371  FNVIVILCKDLPTVQLLIDGKVILALFTYVKKPEKQKIIDWSAAQHEELQLHAIATLSSVAPLLIEEYMSCQGN  444

Query 445  ARVLAFLEWCESEDPFFSHGNSFHGTGGRGNKFAQMRYSLRLLRAMVYLEDETVNKDLCEKGTIQQMIGIFKNI  518
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Sbjct 445  ARVLAFLEWCESEDPFFSHGNSFHGTGGRGNKFAQMRYSLRLLRAVVYLEDETVNKDLCEKGTIQQMIGIFKNI  518

Query 519  ISKPNEKEEAIVLEIQSDILLILSGLCENHIQRKEIFGTEGVDIVLHVMKTDPRKLQSGLGYNVLLFSTLDSIW  592
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Sbjct 519  ISKPNEKEEAIVLEIQSDILLILSGLCENHIQRKEIFGTEGVDIVLHVMKTDPRKLQSGLGYNVLLFSTLDSIW  592

Query 593  CCILGCYPSEDYFLEKEGIFLLLDLLALNQKKFCNLILGIMVEFCDNPKTAAHVNAWQGKKDQTAASLLIKLWR  666
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Sbjct 593  CCILGCYPSEDYFLEKEGIFLLLDLLALNQKKFCNLILGIMVEFCDNPKTAAHVNAWQGKKDQTAASLLIKLWR  666

Query 667  KEEKELGVKRDKNGKIIDTKKPLFTSFQEEQKIIPLPANCPSIAVMDVSENIRAKIYAILGKLDFENLPGLSAE  740
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Sbjct 667  KEEKELGVKRDKNGKIIDTKKPLFTSFQEEQKIIPLPANCPSIAVMDVSENIRAKIYAILGKLDFENLPGLSAE  740

Query 741  DFVTLCIIHRYLDFKIGEIWNEIYEEIKLEKLRPVTTDKKALEAITTASENIGKMVASLQSDIIESQACQDMQN  814
           ||||||||||||||                                                            
Sbjct 741  DFVTLCIIHRYLDF------------------------------------------------------------  754

Query 815  EQKVYAKIQATHKQRELANKSWEDFLARTSNAKTLKKAKRLQEKAIEASRYHKRPQNAIFHQTHIKGLNTTVPS  888
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 755  ------KIQATHKQRELANKSWEDFLARTSNAKTLKKAKSLQEKAIEASRYHKRPQNAIFHQTHIKGLNTTVPS  822

Query 889  GGVVTVESTPARLVGGPLVDTDIALKKLPIRGGALQRVKAVKIVDAPKKSIPT  941
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Sbjct 823  GGVVTVESTPARLVGGPLVDTDIALKKLPIRGGALQRVKAVKIVDAPKKSIPT  875