Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08967
• Subject: XM_017012636.1
• Aligned Length: 2877
• Identities: 2379
• Gaps: 495

Alignment

Query    1  ATGTGGACAGAGGAAGCCGGGGCGACCGCCGAGGCCCAGGAATCCGGCATCAGGAACAAGTCTAGCAGTTCCAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCAAATCCCGGTGGTTGGGGTGGTGACGGAGGACGATGAGGCGCAGGATGTTTTCAAGCCTATGGACCTTAATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTGTCATCAAACTCCTCGAAGAGACTGATAAAGATGGCTTGGAAGAAAAACAACTTAAATTTGTCAAGAAACTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTACAGTGTTATCAGAATGGACTTCCATTAAGGGATTTAGCACAGATATTTAAAATTCTGAATCTGTGTTCAGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  AAAAATAAAAAACCAGCCTCGTTTTATAGAATCTGCATATGATATCATAAAACTGTGTGGCTTGCCATTTTTGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AAAAGAAAGTGTCGGATGAAATAACTTATGCTGAAGATACTGCTAATTCAATTGCACTTCTGGGTGACTTAATG  444
                                                                                   |||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query  445  AAAATACCAAGTTCTGAATTGAGGATACAAATTTGTAAGTGTATTGTTGATTTTTATCATGCAGAACCACCAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    4  AAAATACCAAGTTCTGAATTGAGGATACAAATTTGTAAGTGTATTGTTGATTTTTATCATGCAGAACCACCAAA  77

Query  519  GAAGCATATTCCAGGTTACCAGCAAGCGAGTTCATCATACAAGATTCAAATGGCTGAAGTTGGAGGATTAGCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   78  GAAGCATATTCCAGGTTACCAGCAAGCGAGTTCATCATACAAGATTCAAATGGCTGAAGTTGGAGGATTAGCAA  151

Query  593  AAACAATGGTCCAGTCAATGACCTTGCTTGAAAATCAACTTGTTGAGAAACTTTGGGTACTTAAAGTTCTGCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  152  AAACAATGGTCCAGTCAATGACCTTGCTTGAAAATCAACTTGTTGAGAAACTTTGGGTACTTAAAGTTCTGCAG  225

Query  667  CATCTCTCAACTTCTGAAGTTAATTGTACTATAATGATGAAAGCACAAGCAGCCAGTGGAATCTGTACTCACCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226  CATCTCTCAACTTCTGAAGTTAATTGTACTATAATGATGAAAGCACAAGCAGCCAGTGGAATCTGTACTCACCT  299

Query  741  CAATGACCCAGATCCCTCTGGACAGCTTTTATTTCGTTCATCAGAAATACTTTGGAACTTGCTGGAAAAATCTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  CAATGACCCAGATCCCTCTGGACAGCTTTTATTTCGTTCATCAGAAATACTTTGGAACTTGCTGGAAAAATCTT  373

Query  815  CAAAAGAAGAAGTCATACAACAGCTTAGTAACTTGGAATGTTTGCTGGCTTTGAAGGAAGTATTTAAAAATCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  374  CAAAAGAAGAAGTCATACAACAGCTTAGTAACTTGGAATGTTTGCTGGCTTTGAAGGAAGTATTTAAAAATCTG  447

Query  889  TTTATGAGAGGTTTCAGTCATTATGACCGTCAGCTTAGAAATGACATATTAGTGATCACTACAATTATAGCTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  TTTATGAGAGGTTTCAGTCATTATGACCGTCAGCTTAGAAATGACATATTAGTGATCACTACAATTATAGCTCA  521

Query  963  AAATCCTGAAGCACCAATGATTGAATGTGGCTTTACCAAGGATTTGATACTGTTTGCCACCTTTAATGAAGTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  522  AAATCCTGAAGCACCAATGATTGAATGTGGCTTTACCAAGGATTTGATACTGTTTGCCACCTTTAATGAAGTTA  595

Query 1037  AAAGTCAAAATCTTTTGGTAAAAGGACTTAAGCTTTCTAATTCCTATGAAGATTTTGAGTTGAAGAAATTACTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  596  AAAGTCAAAATCTTTTGGTAAAAGGACTTAAGCTTTCTAATTCCTATGAAGATTTTGAGTTGAAGAAATTACTA  669

Query 1111  TTCAATGTAATTGTGATCTTATGTAAAGATTTACCTACTGTACAGCTATTAATTGATGGCAAAGTTATTTTGGC  1184
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  670  TTCAACGTAATTGTGATCTTATGTAAAGATTTACCTACTGTACAGCTATTAATTGATGGCAAAGTTATTTTGGC  743

Query 1185  TTTGTTTACCTATGTTAAGAAGCCTGAGAAGCAAAAAATAATTGACTGGTCTGCAGCACAGCATGAAGAATTAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  TTTGTTTACCTATGTTAAGAAGCCTGAGAAGCAAAAAATAATTGACTGGTCTGCAGCACAGCATGAAGAATTAC  817

Query 1259  AACTGCATGCAATTGCCACTTTGTCATCAGTGGCTCCTTTATTAATAGAAGAATACATGTCATGCCAGGGAAAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  818  AACTGCATGCAATTGCCACTTTGTCATCAGTGGCTCCTTTATTAATAGAAGAATACATGTCATGCCAGGGAAAT  891

Query 1333  GCTCGAGTCCTTGCATTTCTAGAATGGTGTGAGAGTGAAGATCCGTTTTTCAGTCATGGTAACAGTTTTCATGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  GCTCGAGTCCTTGCATTTCTAGAATGGTGTGAGAGTGAAGATCCGTTTTTCAGTCATGGTAACAGTTTTCATGG  965

Query 1407  TACAGGTGGCCGAGGCAACAAGTTTGCCCAGATGCGTTACAGTTTAAGACTCCTGAGAGCCATGGTCTACCTTG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  966  TACAGGTGGCCGAGGCAACAAGTTTGCCCAGATGCGTTACAGTTTAAGACTCCTGAGAGCCGTGGTCTACCTTG  1039

Query 1481  AAGATGAGACTGTAAACAAAGATCTTTGTGAAAAGGGAACAATTCAGCAAATGATAGGAATCTTTAAAAATATA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040  AAGATGAGACTGTAAACAAAGATCTTTGTGAAAAGGGAACAATTCAGCAAATGATAGGAATCTTTAAAAATATA  1113

Query 1555  ATAAGCAAGCCTAATGAAAAGGAAGAAGCCATTGTTTTGGAAATCCAGTCTGATATATTACTTATCCTATCTGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114  ATAAGCAAGCCTAATGAAAAGGAAGAAGCCATTGTTTTGGAAATCCAGTCTGATATATTACTTATCCTATCTGG  1187

Query 1629  CCTTTGTGAGAATCACATTCAAAGGAAGGAAATTTTCGGAACTGAAGGAGTAGATATCGTTCTTCATGTGATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188  CCTTTGTGAGAATCACATTCAAAGGAAGGAAATTTTCGGAACTGAAGGAGTAGATATCGTTCTTCATGTGATGA  1261

Query 1703  AAACAGACCCCAGGAAGTTACAGAGTGGCTTAGGCTATAATGTACTTCTTTTTAGTACATTGGACAGCATTTGG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262  AAACAGACCCCAGGAAGTTACAGAGTGGCTTAGGCTATAATGTACTTCTTTTTAGTACATTGGACAGCATTTGG  1335

Query 1777  TGCTGTATTTTGGGATGTTATCCCTCAGAGGATTATTTTCTTGAAAAGGAAGGCATTTTTCTCCTTTTGGATTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336  TGCTGTATTTTGGGATGTTATCCCTCAGAGGATTATTTTCTTGAAAAGGAAGGCATTTTTCTCCTTTTGGATTT  1409

Query 1851  GTTAGCATTGAACCAAAAAAAATTCTGTAATCTAATACTTGGAATAATGGTTGAATTTTGTGATAATCCCAAAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410  GTTAGCATTGAACCAAAAAAAATTCTGTAATCTAATACTTGGAATAATGGTTGAATTTTGTGATAATCCCAAAA  1483

Query 1925  CTGCAGCTCATGTCAATGCTTGGCAAGGGAAGAAGGATCAGACAGCTGCTAGTCTTTTAATTAAATTGTGGAGA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484  CTGCAGCTCATGTCAATGCTTGGCAAGGGAAGAAGGATCAGACAGCTGCTAGTCTTTTAATTAAATTGTGGAGA  1557

Query 1999  AAGGAGGAAAAAGAACTAGGAGTAAAACGTGATAAAAATGGGAAGATCATTGATACAAAAAAACCTCTATTTAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1558  AAGGAGGAAAAAGAACTAGGAGTAAAACGTGATAAAAATGGGAAGATCATTGATACAAAAAAACCTCTATTTAC  1631

Query 2073  TAGCTTTCAAGAAGAGCAAAAAATCATCCCACTGCCTGCTAACTGCCCATCTATTGCGGTTATGGATGTTTCTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1632  TAGCTTTCAAGAAGAGCAAAAAATCATCCCACTGCCTGCTAACTGCCCATCTATTGCGGTTATGGATGTTTCTG  1705

Query 2147  AGAATATTAGAGCAAAAATTTATGCTATATTGGGCAAACTAGATTTTGAAAATTTACCTGGCCTATCTGCTGAA  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1706  AGAATATTAGAGCAAAAATTTATGCTATATTGGGCAAACTAGATTTTGAAAATTTACCTGGCCTATCTGCTGAA  1779

Query 2221  GATTTTGTCACCCTTTGTATCATACATAGATATCTTGATTTTAAAATTGGAGAAATATGGAATGAAATATATGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1780  GATTTTGTCACCCTTTGTATCATACATAGATATCTTGATTTTAAAATTGGAGAAATATGGAATGAAATATATGA  1853

Query 2295  AGAAATAAAATTAGAAAAATTAAGACCAGTCACTACAGATAAAAAAGCTTTGGAAGCTATTACAACAGCATCAG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1854  AGAAATAAAATTAGAAAAATTAAGACCAGTCACTACAGATAAAAAAGCTTTGGAAGCTATTACAACAGCATCAG  1927

Query 2369  AAAATATTGGAAAGATGGTTGCTTCTCTGCAAAGTGATATAATTGAAAGCCAAGCATGCCAAGACATGCAAAAT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1928  AAAATATTGGAAAGATGGTTGCTTCTCTGCAAAGTGATATAATTGAAAGCCAAGCATGCCAAGACATGCAAAAT  2001

Query 2443  GAACAAAAAGTATATGCAAAAATACAGGCCACGCACAAGCAAAGAGAGCTGGCTAATAAATCATGGGAAGATTT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2002  GAACAAAAAGTATATGCAAAAATACAGGCCACGCACAAGCAAAGAGAGCTGGCTAATAAATCATGGGAAGATTT  2075

Query 2517  CTTGGCTAGAACATCAAACGCTAAAACGTTAAAGAAAGCAAAAAGGCTTCAAGAAAAAGCTATAGAAGCCTCCA  2590
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2076  CTTGGCTAGAACATCAAACGCTAAAACGTTAAAGAAAGCAAAAAGCCTTCAAGAAAAAGCTATAGAAGCCTCCA  2149

Query 2591  GATACCATAAACGACCACAAAATGCAATATTTCACCAAACACATATTAAAGGCCTTAACACAACGGTGCCCTCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2150  GATACCATAAACGACCACAAAATGCAATATTTCACCAAACACATATTAAAGGCCTTAACACAACGGTGCCCTCT  2223

Query 2665  GGTGGAGTAGTAACAGTGGAAAGCACTCCTGCCCGATTAGTAGGAGGACCTCTGGTTGATACGGATATTGCTCT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2224  GGTGGAGTAGTAACAGTGGAAAGCACTCCTGCCCGATTAGTAGGAGGACCTCTGGTTGATACGGATATTGCTCT  2297

Query 2739  TAAAAAACTGCCCATTCGAGGAGGAGCCTTGCAGAGGGTGAAAGCAGTTAAAATTGTGGATGCACCAAAAAAGA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2298  TAAAAAACTGCCCATTCGAGGAGGAGCCTTGCAGAGGGTGAAAGCAGTTAAAATTGTGGATGCACCAAAAAAGA  2371

Query 2813  GTATTCCTACG------------------------------------------------------  2823
            |||||||||||                                                      
Sbjct 2372  GTATTCCTACGAGCTGGTTGGAGAAGATGAACGTAGACATACATGAAGTGGCACGAAAACAAAGG  2436