Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09518
• Subject: NM_001322141.1
• Aligned Length: 1120
• Identities: 802
• Gaps: 305

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCACCCAAGCTGCTGTGTGCAGGAAGGTGTGTGGGCCAGGACGGGGCTGCACAGGCCTGGCACTGCCCTCC  74

Query    1  -----------------------ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGC------------CCTG--  37
                                   |||           ||.|.||..||  ||||.|            ||.|  
Sbjct   75  AGGACAGGGTCACTCAGTGTGGGATG-----------CTGTCAGAATG--CCTCTCGGGGCGGGGACTCCAGTC  135

Query   38  --TTTCCAAAAACGCG-----------------------TACAGGCTCATCTTGGCAGCCAACAGGGATGAATT  86
              |.|.||||.|||.|                       .||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  AATGTACAAAGACGTGAAGACTCAGCCACAGAAGGCAGCCACAGGCTCATCTTGGCAGCCAACAGGGATGAATT  209

Query   87  CTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGCTGGACATGGAGG  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  CTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGCTGGACATGGAGG  283

Query  161  AAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACCAACTACCTGCAG  234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  AAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACCAACTACCTGCAG  357

Query  235  CCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGACGTGGACAGCTT  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  CCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGACGTGGACAGCTT  431

Query  309  GTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAGCCAACCTGAGCA  382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  432  GTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAGCCGACCTGAGCA  505

Query  383  CAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTGACGCCAGGCACC  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  506  CAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTGACGCCAGGCACC  579

Query  457  TACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCTCTTCCTGGAGGC  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  TACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCTCTTCCTGGAGGC  653

Query  531  TGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCAACAATAAAGAGG  604
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  654  TGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCAACAATGAAGAGG  727

Query  605  CGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGCAAGTACGCGGCT  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  CGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGCAAGTACGCGGCT  801

Query  679  GTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCA-------------------------------------------  709
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct  802  GTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGGTATTGCAGCACCGTGGGTGCGCCACCTCCTATCCCATGTCC  875

Query  710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                      
Sbjct  876  CACCTCCCACGCTAGAGGGCCGGCAAAGAAGCCAAGTGCCCATAGCCAGAGCCAGGCTTCTTCCTCGCCTGAGT  949

Query  710  ---------------------------------------GAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGCGGACGGC  744
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  GGATTCCAGAGCTTCTGCCCTGTCCAGACGCAGCTGCAGGAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGCGGACGGC  1023

Query  745  CACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAACCTATGAGTTCAC  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  CACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAACCTATGAGTTCAC  1097

Query  819  ACTGCAGAGC  828
            ||||||||||
Sbjct 1098  ACTGCAGAGC  1107