Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09518
• Subject: XM_017028577.1
• Aligned Length: 984
• Identities: 826
• Gaps: 156

Alignment

Query   1  ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGCCCTGTTTCCAAAAACGCGTACAGGCTCATCTTGGCAGCCAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGCCCTGTTTCCAAAAACGCGTACAGGCTCATCTTGGCAGCCAA  74

Query  75  CAGGGATGAATTCTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAGGGATGAATTCTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGC  148

Query 149  TGGACATGGAGGAAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGGACATGGAGGAAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACC  222

Query 223  AACTACCTGCAGCCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AACTACCTGCAGCCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGA  296

Query 297  CGTGGACAGCTTGTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CGTGGACAGCTTGTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAG  370

Query 371  CCAACCTGAGCACAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTG  444
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  CCGACCTGAGCACAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTG  444

Query 445  ACGCCAGGCACCTACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ACGCCAGGCACCTACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCT  518

Query 519  CTTCCTGGAGGCTGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CTTCCTGGAGGCTGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCA  592

Query 593  ACAATAAAGAGGCGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGC  666
           |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ACAATGAAGAGGCGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGC  666

Query 667  AAGTACGCGGCTGTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCA-------------------------------  709
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 667  AAGTACGCGGCTGTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGGTATTGCAGCACCGTGGGTGCGCCACCTCC  740

Query 710  --------------------------------------------------------------------------  709
                                                                                     
Sbjct 741  TATCCCATGTCCCACCTCCCACGCTAGAGGGCCGGCAAAGAAGCCAAGTGCCCATAGCCAGAGCCAGGCTTCTT  814

Query 710  ---------------------------------------------------GAACCAACACTATCATCCTGGTA  732
                                                              |||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  CCTCGCCTGAGTGGATTCCAGAGCTTCTGCCCTGTCCAGACGCAGCTGCAGGAACCAACACTATCATCCTGGTA  888

Query 733  GATGCGGACGGCCACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAAC  806
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  GATGCGGACGGCCACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAAC  962

Query 807  CTATGAGTTCACACTGCAGAGC  828
           ||||||||||||||||||||||
Sbjct 963  CTATGAGTTCACACTGCAGAGC  984