Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09677
• Subject: NM_001352810.2
• Aligned Length: 1539
• Identities: 1105
• Gaps: 432

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGGTACTCCTTAAGCCCTGACAACCATCTTGAAGATGGAATCATGAATATGGCAAATTTTCTACGGGGCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAAGAAAAGGGGATAAAGAACGACAGGCCTGAGGACCAGTTGAGCAAAGAGAAAAAGAAAATTCTTTTCTCCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TCTGTGAGGTGTGCAACATCCAGCTGAACTCTGCAGCCCAGGCTCAGGTGCATTCCAACGGCAAATCCCACCGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AAACGAGTGAAGCAGCTGAGTGATGGGCAGCCCCCACCACCCGCCCAGGCCAGCCCCAGCAGCAACAGCAGCAC  296

Query    1  -------------------------------------------------------ATGATGCATCCTTCACTGG  19
                                                                   ||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AGGCAGTACATGCCACACTACTACCCTTCCTGCTCTTGTGCGCACACCTACCCTGATGATGCAGCCTTCACTGG  370

Query   20  ATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACAATG  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACAATG  444

Query   94  GATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTC  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTC  518

Query  168  TTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCA  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCA  592

Query  242  AGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAAT  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAAT  666

Query  316  CCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATC---------------------------  362
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  667  CCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAGAGCACTGCCTTGAATTGGACATT  740

Query  363  ------------------------------------------------------AGAAGATAAAGGGAAGTTAA  382
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTTATTTCAGCAAACGTATTGCTCACCTATGGCTTTCTGTACATTGGGCATAAAGAAGATAAAGGGAAGTTAA  814

Query  383  AAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTG  456
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTG  888

Query  457  CCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGA  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGA  962

Query  531  AAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACA  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACA  1036

Query  605  ACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCT  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCT  1110

Query  679  GGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTG  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTG  1184

Query  753  TGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAG  826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAG  1258

Query  827  GGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTT  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTT  1332

Query  901  GCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGT  974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGT  1406

Query  975  GTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTC  1048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTC  1480

Query 1049  TGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1539