Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09677
• Subject: NM_001352812.2
• Aligned Length: 1209
• Identities: 1105
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGATGCATCC  11
                                                                           ||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTTCTTGGCAGTACATGCCACACTACTACCCTTCCTGCTCTTGTGCGCACACCTACCCTGATGATGCAGCC  74

Query   12  TTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTA  85
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTA  148

Query   86  ACACA---------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAAC  120
            |||||                                       ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACACAAAAAGAAGAGGCTTATTTGAGACCAATAAATTTTGCCAGATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAAC  222

Query  121  CATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAA  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAA  296

Query  195  CTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGA  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGA  370

Query  269  AAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACA  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACA  444

Query  343  GGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGA  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGA  518

Query  417  AAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCA  490
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTGGCTCATTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCA  592

Query  491  CAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGC  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGC  666

Query  565  AAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGC  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGC  740

Query  639  TCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGG  814

Query  713  GGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAA  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAA  888

Query  787  CAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAA  962

Query  861  CAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCC  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCC  1036

Query  935  CAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCT  1110

Query 1009  GCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCC  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCC  1184

Query 1083  TGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1209