Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09677
• Subject: XM_006499458.3
• Aligned Length: 1311
• Identities: 989
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTGGAGTGGACTTCCCAGCAGAGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCAC  74

Query    1  ----ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGC  70
                ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  CCTGATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGC  148

Query   71  TCTTTCCAAATTTTAACACA------------------------------------------------------  90
            ||||||||||.|||||||||                                                      
Sbjct  149  TCTTTCCAAACTTTAACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCTACGCATACA  222

Query   91  ------------------------------------------------------------------------AT  92
                                                                                    ||
Sbjct  223  GGACTGAGGAAGAGACCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTTCTGCCAGAT  296

Query   93  GGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTT  166
            |||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAAGTTATTT  370

Query  167  CTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCC  240
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCC  444

Query  241  AAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAA  314
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAA  518

Query  315  TCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCA  388
            |||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||
Sbjct  519  TCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATAAAAGCCA  592

Query  389  GCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCT  462
            .|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  593  CCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACTT  666

Query  463  GGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGC  536
            |||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGC  740

Query  537  CAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAG  610
            ||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  741  CAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCACAACACAG  814

Query  611  GATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCA  684
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  GATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACCTGGGTCA  888

Query  685  AGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGT  758
            |||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  AGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCTGTGATGT  962

Query  759  TCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAAC  832
            |||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||
Sbjct  963  TCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCAGGAAAAC  1036

Query  833  CACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTC  906
            |.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1037  CGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCTTGCATTC  1110

Query  907  CAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTC  980
            |||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||   .|||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTC  1181

Query  981  AGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGC  1054
            .|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1182  TGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGC  1255

Query 1055  CTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            ||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256  CTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC  1308