Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09677
• Subject: XM_006499462.3
• Aligned Length: 1233
• Identities: 989
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT  74
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTT  74

Query   75  TCCAAATTTTAACACA----------------------------------------------------------  90
            ||||||.|||||||||                                                          
Sbjct   75  TCCAAACTTTAACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCTACGCATACAGGAC  148

Query   91  --------------------------------------------------------------------ATGGAT  96
                                                                                |||||.
Sbjct  149  TGAGGAAGAGACCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTTCTGCCAGATGGAC  222

Query   97  CCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTG  170
            ||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAAGTTATTTCCTG  296

Query  171  TAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGA  244
            |||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGA  370

Query  245  AGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCC  318
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCC  444

Query  319  AGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAG  392
            |||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  445  AGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATAAAAGCCACCAG  518

Query  393  TTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAG  466
            ||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  519  TTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACTTGGAG  592

Query  467  CAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAA  540
            |...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGCCAAA  666

Query  541  AAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATC  614
            ||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  AAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCACAACACAGGATC  740

Query  615  TAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGAT  688
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  TAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACCTGGGTCAAGAT  814

Query  689  TAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCAT  762
            |||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  TAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCTGTGATGTTCAC  888

Query  763  GTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACT  836
            ||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  889  GTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCAGGAAAACCGCT  962

Query  837  GAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGA  910
            ||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  963  GAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCTTGCATTCCAGA  1036

Query  911  AAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCG  984
            |||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||   .|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  AAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTCTGCG  1107

Query  985  CTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGG  1058
            ||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1108  CTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGCCTGG  1181

Query 1059  GCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            .||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1182  CCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC  1230