Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09677
- Subject:
- XM_011510721.3
- Aligned Length:
- 1188
- Identities:
- 1105
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT 74
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGCAGCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT 74
Query 75 TCCAAATTTTAACACAATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCAAATTTTAACACAATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAA 148
Query 149 AGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTAC 222
Query 223 AAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAA 296
Query 297 GGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATC-------- 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAGAGCA 370
Query 363 -------------------------------------------------------------------------A 363
|
Sbjct 371 CTGCCTTGAATTGGACATTCCTTATTTCAGCAAACGTATTGCTCACCTATGGCTTTCTGTACATTGGGCATAAA 444
Query 364 GAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAA 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 445 GAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTCTCCTCAA 518
Query 438 ATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTG 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTG 592
Query 512 TTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTG 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTG 666
Query 586 TCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAAT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAAT 740
Query 660 TAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGA 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGA 814
Query 734 CATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGG 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGG 888
Query 808 CATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAG 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAG 962
Query 882 TATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTC 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTC 1036
Query 956 TCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCA 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCA 1110
Query 1030 GCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCC 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCC 1184
Query 1104 GTAC 1107
||||
Sbjct 1185 GTAC 1188