Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_09696
• Subject: XM_017009100.2
• Aligned Length: 1542
• Identities: 1196
• Gaps: 345

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTTGGTGATTTGGAGGAAGGGGAGAGTTGGGCAAGATGCCCTCTTCCCCAGTTTATATACTGCCTCATATG  74

Query    1  -AT------GGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATAC  67
             ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATCTTCCAGGGTGTGATAGGTATACAGCTGGTTGTTACCATGGTGATGGCCAGTGTCATGCAGAAGATTATAC  148

Query   68  CTCACTATTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAA  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCACTATTCTCTTGCTCGATGGCTACTCTGTAATGGCAGTTTGAGGTGGTATCAACATCCTACAGAAGAAGAA  222

Query  142  TTAAGAATTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAG  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTAAGAATTCTTGCAGGGAAACAACAAAAAGGGAAAACCAAAAAAGATAGGAAATATAATGGTCACATTGAAAG  296

Query  216  TAAGCCATTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAG  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAGCCATTAACCATTCCAAAGGATATTGACCTTCATCTAGAAACAAAGTCAGTTACAGAAGTGGATACTTTAG  370

Query  290  CATTGCATTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACT  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATTGCATTACTTTCCAGAATACCAGTGGCTGGTGGATTTCACAGTGGCTGCTACAGTTGTGTATCTAGTAACT  444

Query  364  GAAGTCTACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTC  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGTCTACTACAATTTTATGAAGCCTACACAGGAAATGAATATCAGCTTAGTCTGGTGCCTACTTGTTTTGTC  518

Query  438  TTTTGCAATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTT  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTTGCAATCAAAGTTCTATTTTCATTAACTACACACTATTTTAAAGTAGAAGATGGTGGTGAAAGATCTGTTT  592

Query  512  GTGTCACCTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGTCACCTTTGGATTTTTTTTCTTTGTCAAAGCAATGGCAGTGTTGATTGTAACAGAAAATTATCTGGAATTT  666

Query  586  GGACTTGAAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACTTGAAACAGGGTTTACAAATTTTTCAGACAGTGCGATGCAGTTTCTTGAAAAGCAAGGTTTAGAATCTCA  740

Query  660  GAGTCCTGTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACAT  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGTCCTGTTTCAAAACTTACTTTCAAATTTTTCCTGGCTATTTTCTGTTCATTCATTGGGGCTTTTTTGACAT  814

Query  734  TTCCTGGATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTA  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCCTGGATTACGACTGGCTCAAATGCATCTGGATGCCCTGAATTTGGCAACAGAAAAAATTACACAAACTTTA  888

Query  808  CTTCATATCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTTTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTAT  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTCATATCAACTTCTTGGCACCTTTATTTATGGTTCTGCTCTGGGTAAAACCAATCACCAAAGACTACATTAT  962

Query  882  GAACCCACCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAACCCACCACTGGGCAAAGAAAGTATCCCTTTAATGACAGAAGCCACATTCGATACTCTGCGACTCTGGTTAA  1036

Query  956  TAATCCTGCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAA  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TAATCCTGCTGTGTGCTTTGCGGTTGGCCATGATGCGTAGTCACCTGCAAGCTTATTTAAATTTAGCCCAAAAA  1110

Query 1030  TGTGTGGATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAATGGTGGCTCGAGTCTT  1103
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1111  TGTGTGGATCAGATGAAGAAAGAAGCGGGGCGAATAAGCACGGTTGAGCTACAGAAAAT---------------  1169

Query 1104  TTATTATCTTTGTGTCATTGCACTGCAGTATGTGGCGCCTCTGGTAATGCTGCTTCACACAACTCTGCTTTTGA  1177
                                                                                      
Sbjct 1170  --------------------------------------------------------------------------  1169

Query 1178  AAACACTAGGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTG  1251
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170  --------GGTAATCATTCCTGGGGTATTTATCCAGAATCTATCTCTACCTTACCAGTGGATAATAGTCTACTG  1235

Query 1252  TCCAATTCTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAATGAAGGTAACTGTTACACAAATAACAGTGGC  1325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1236  TCCAATTCTGTTTACTCTGAATTACCATCAGCTGAAGGGAAAA-------------------------------  1278

Query 1326  ACTGAGCAGCTTAAAAAATATTTTTACTCCTCTTCTTTTTCGAGGACTTCTGTCTTTTCTGACCTGGTGGATTG  1399
                                                                                      
Sbjct 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278

Query 1400  CTGCTTGCCTCTTTTCTACAAGCCTTTTTGGGCTTTTCTATCACCAGTATCTGACTGTGGCA  1461
                                                                          
Sbjct 1279  --------------------------------------------------------------  1278