Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_09804
- Subject:
- XM_017000579.1
- Aligned Length:
- 2081
- Identities:
- 1453
- Gaps:
- 622
Alignment
Query 1 ATGGCGACGTCGGGGGCGAACGGGCCTGGTTCGGCCACGGCCTCGGCTTCCAATCCGCGCAAATTTAGTGAGAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GATTGCGCTGCAGAAGCAGCGTCAGGCCGAGGAGACGGCGGCCTTCGAGGAGGTGATGATGGACATCGGCTCCA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CCCGGTTACAGGCCCAAAAACTGCGACTGGCATACACAAGGAGCTCTCATTATGGTGGGTCTCTGCCCAATGTT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AACCAGATTGGCTCTGGCCTGGCCGAGTTCCAGAGCCCCCTCCACTCACCTTTGGATTCATCTCGGAGCACTCG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GCACCATGGGCTGGTGGAACGGGTGCAGCGAGATCCTCGAAGAATGGTGTCCCCACTTCGCCGATACACCCGCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ACATTGACAGCTCTCCCTATAGTCCTGCCTACTTATCTCCTCCCCCAGAGTCTAGCTGGCGAAGGACGATGGCC 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TGGGGCAATTTCCCTGCAGAGAAGGGGCAGTTGTTTCGACTACCATCTGCACTTAACAGGACAAGCTCTGACTC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TGCCCTTCATACAAGTGTGATGAACCCCAGTCCCCAGGATACCTACCCAGGCCCCACACCTCCCAGCATCCTGC 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 CCAGCCGACGTGGGGGTATTCTGGATGGTGAAATGGACCCCAA--AGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTAG 664
||||.|..||..| || |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------ATGGAGCTATTTA----AAGCAGTACCTGCTATTGAGGAGAACTTGCTAG 46
Query 665 ATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGAA 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 47 ATGACAAGCATTTGCTGAAGCCATGGGATGCTAAGAAGCTATCCTCATCCTCTTCCCGACCTCGGTCCTGTGAA 120
Query 739 GTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACAC 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 121 GTCCCTGGAATTAACATCTTTCCATCTCCTGACCAGCCTGCCAATGTGCCTGTCCTCCCACCTGCCATGAACAC 194
Query 813 GGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAGA 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 195 GGGGGGCTCCCTACCTGACCTCACCAACCTGCACTTTCCCCCACCACTGCCCACCCCCCTGGACCCTGAAGAGA 268
Query 887 CAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAGC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 269 CAGCCTACCCTAGCCTGAGTGGGGGCAACAGTACCTCCAATTTGACCCACACCATGACTCACCTGGGCATCAGC 342
Query 961 AGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGTC 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 343 AGGGGCATGGGCCTGGGCCCAGGCTATGATGCACCAGGACTTCATTCACCTCTCAGCCACCCATCCCTGCAGTC 416
Query 1035 CTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCACC 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 417 CTCCCTAAGCAATCCCAACCTCCAGGCTTCCCTGAGCAGTCCTCAGCCCCAGCTTCAGGGCTCCCACAGCCACC 490
Query 1109 CCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGCT 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 491 CCTCTCTGCCTGCCTCCTCCTTGGCCCGCCATGTACTGCCCACCACCTCCCTGGGCCACCCCTCACTCAGTGCT 564
Query 1183 CCGGCTCTTTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTTC 1256
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 565 CCGGCTCTCTCCTCCTCCTCTTCCTCCTCCTCCACTTCATCTCCTGTTTTGGGCGCCCCCTCTTACCCTGCTTC 638
Query 1257 TACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGACG 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 639 TACCCCTGGGGCCTCCCCCCACCACCGCCGTGTGCCCCTCAGCCCCCTGAGTTTGCTCGCGGGCCCAGCCGACG 712
Query 1331 CCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCAG 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 713 CCAGAAGGTCCCAACAGCAGCTGCCCAAACAGTTTTCGCCAACAATGTCACCCACCTTGTCTTCCATCACTCAG 786
Query 1405 GGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTCT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 787 GGCGTCCCCCTGGATACCAGTAAACTGTCCACTGACCAGCGGTTACCCCCATACCCATACAGCTCCCCAAGTCT 860
Query 1479 GGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTGC 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 861 GGTTCTGCCTACCCAGCCCCACACCCCAAAGTCTCTACAGCAGCCAGGGCTGCCCTCTCAGTCTTGTTCAGTGC 934
Query 1553 AGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCAT 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 935 AGTCCTCAGGTGGGCAGCCCCCAGGCAGGCAGTCTCATTATGGGACACCGTACCCACCTGGGCCCAGTGGGCAT 1008
Query 1627 GGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCCC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009 GGGCAACAGTCTTACCACCGGCCAATGAGTGACTTCAACCTGGGGAATCTGGAGCAGTTCAGCATGGAGAGCCC 1082
Query 1701 ATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATGG 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083 ATCAGCCAGCCTGGTGCTGGATCCCCCTGGCTTTTCTGAAGGGCCTGGATTTTTAGGGGGTGAGGGGCCAATGG 1156
Query 1775 GTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAAC 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157 GTGGCCCCCAGGATCCCCACACCTTCAACCACCAGAACTTGACCCACTGTTCCCGCCATGGCTCAGGGCCTAAC 1230
Query 1849 ATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCTT 1922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231 ATCATCCTCACAGGGGACTCCTCTCCAGGTTTCTCTAAGGAGATTGCAGCAGCCCTGGCCGGAGTGCCTGGCTT 1304
Query 1923 TGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTGG 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305 TGAGGTGTCAGCAGCTGGATTGGAGCTAGGGCTTGGGCTAGAAGATGAGCTGCGCATGGAGCCACTGGGCCTGG 1378
Query 1997 AAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGAC 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379 AAGGGCTAAACATGCTGAGTGACCCCTGTGCCCTGCTGCCTGATCCTGCTGTGGAGGAGTCATTCCGCAGTGAC 1452
Query 2071 CGGCTCCAA 2079
|||||||||
Sbjct 1453 CGGCTCCAA 1461