Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_09864
Subject:
NM_001282734.1
Aligned Length:
691
Identities:
557
Gaps:
134

Alignment

Query   1  MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNHSRSLIKTLLEKTGC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  PRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLYYIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLL  148
                                                                       ||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------------MSNKEYKFYLHSLL  14

Query 149  SLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQSQCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCL  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  15  SLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQSQCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCL  88

Query 223  GQGNLPSPDYFTEYIFSSLNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSME  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  89  GQGNLPSPDYFTEYIFSSLNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSME  162

Query 297  KESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLPPTTLEKYGYS  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 163  KESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLPPTTLEKYGYS  236

Query 371  TVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGH  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 237  TVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGH  310

Query 445  IWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLVNGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQ  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 311  IWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLVNGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQ  384

Query 519  AAEMPIGSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVL  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 385  AAEMPIGSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVL  458

Query 593  LSSGLSMKTAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQRPWMMFL  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 459  LSSGLSMKTAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQRPWMMFL  532

Query 667  LQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI  691
           |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 533  LQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI  557