Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10208
• Subject: NM_001291869.3
• Aligned Length: 1815
• Identities: 1794
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ---ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA  74

Query   72  CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT  148

Query  146  GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA  222

Query  220  GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA  293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA  296

Query  294  TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACA------------------AGTCAACACAGACA  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||
Sbjct  297  TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTTTTTGCCTTTTCCCTAGTCAACACAGACA  370

Query  350  CAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGG  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGG  444

Query  424  CATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCA  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCA  518

Query  498  GCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGA  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGA  592

Query  572  TTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATA  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATA  666

Query  646  AAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCC  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCC  740

Query  720  TGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGG  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGG  814

Query  794  CAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATT  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATT  888

Query  868  GGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGA  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGA  962

Query  942  TTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAG  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAG  1036

Query 1016  AGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCA  1110

Query 1090  GGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGG  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGG  1184

Query 1164  AGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACC  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACC  1258

Query 1238  AGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCT  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCT  1332

Query 1312  GTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGAT  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGAT  1406

Query 1386  TGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGG  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGG  1480

Query 1460  CCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCG  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCG  1554

Query 1534  CATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAA  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAA  1628

Query 1608  CTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTA  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTA  1702

Query 1682  TCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAG  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAG  1776

Query 1756  CAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1794
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1815