Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10208
• Subject: NM_001291872.3
• Aligned Length: 1820
• Identities: 1588
• Gaps: 220

Alignment

Query    1  ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGACAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACTGGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGG--------AAGTTGATT  214
                                          |.||    |..||||      ||.|||        |.|||||| 
Sbjct    1  ------------------------------ATGT----TCTCATG------TCCTGGACACTACCACGTTGAT-  33

Query  215  ACTCAGTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTG  288
                 |.||.|..|||.|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   34  -----GGCTTTCTAAATCCAGGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTG  102

Query  289  TTGGATGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACA------------------AGTCAACAC  344
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||||||
Sbjct  103  TTGGATGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTTTTTGCCTTTTCCCTAGTCAACAC  176

Query  345  AGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAA  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  AGACACAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAA  250

Query  419  GCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCC  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  GCGGGCATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCC  324

Query  493  CCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAG  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  CCTCAGCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAG  398

Query  567  ACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGA  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  ACAGATTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGA  472

Query  641  CCATAAAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAG  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  CCATAAAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAG  546

Query  715  AAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAA  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  AAGCCTGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAA  620

Query  789  AGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGAC  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  AGAGGCAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGAC  694

Query  863  TGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTG  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  TGATTGGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTG  768

Query  937  CAGGATTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGA  1010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  CAGGATTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGA  842

Query 1011  GATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGA  1084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  GATAGAGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGA  916

Query 1085  TCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCC  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  TCCCAGGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCC  990

Query 1159  CGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCA  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  CGCGGAGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCA  1064

Query 1233  TCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCC  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  TCACCAGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCC  1138

Query 1307  AGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATC  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  AGGCTGTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATC  1212

Query 1381  AAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTT  1454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  AAGATTGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTT  1286

Query 1455  CAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGG  1528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  CAAGGCCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGG  1360

Query 1529  AAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTG  1602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  AAGCGCATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTG  1434

Query 1603  CAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAG  1676
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  CAGAACTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAG  1508

Query 1677  AATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGC  1750
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  AATTATCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGC  1582

Query 1751  AGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1583  AGGAGCAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG  1626