Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_10208
- Subject:
- XM_017005562.1
- Aligned Length:
- 1815
- Identities:
- 1397
- Gaps:
- 417
Alignment
Query 1 ---ATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGAACAAGCTTTACATCGGGAACCTGAGCCCCGCCGTCACCGCCGACGACCTCCGGCAGCTCTTTGGGGA 74
Query 72 CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGAAGCTGCCCCTGGCGGGACAGGTCCTGCTGAAGTCCGGCTACGCCTTCGTGGACTACCCCGACCAGAACT 148
Query 146 GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGCCATCCGCGCCATCGAGACCCTCTCGGGTAAAGTGGAATTGCATGGGAAAATCATGGAAGTTGATTACTCA 222
Query 220 GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCTCTAAAAAGCTAAGGAGCAGGAAAATTCAGATTCGAAACATCCCTCCTCACCTGCAGTGGGAGGTGTTGGA 296
Query 294 TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACA------------------AGTCAACACAGACA 349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 297 TGGACTTTTGGCTCAATATGGGACAGTGGAGAATGTGGAACAAGTTTTTGCCTTTTCCCTAGTCAACACAGACA 370
Query 350 CAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGG 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGAAACCGCCGTTGTCAACGTCACATATGCAACAAGAGAAGAAGCAAAAATAGCCATGGAGAAGCTAAGCGGG 444
Query 424 CATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCA 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATCAGTTTGAGAACTACTCCTTCAAGATTTCCTACATCCCGGATGAAGAGGTGAGCTCCCCTTCGCCCCCTCA 518
Query 498 GCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCGAGCCCAGCGTGGGGACCACTCTTCCCGGGAGCAAGGCCACGCCCCTGGGGGCACTTCTCAGGCCAGACAGA 592
Query 572 TTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGATTTCCCGCTGCGGATCCTGGTCCCCACCCAGTTTGTTGGTGCCATCATCGGAAAGGAGGGCTTGACCATA 666
Query 646 AAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCC 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAGAACATCACTAAGCAGACCCAGTCCCGGGTAGATATCCATAGAAAAGAGAACTCTGGAGCTGCAGAGAAGCC 740
Query 720 TGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGG 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGTCACCATCCATGCCACCCCAGAGGGGACTTCTGAAGCATGCCGCATGATTCTTGAAATCATGCAGAAAGAGG 814
Query 794 CAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATT 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGATGAGACCAAACTAGCCGAAGAGATTCCTCTGAAAATCTTGGCACACAATGGCTTGGTTGGAAGACTGATT 888
Query 868 GGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGA 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGAAAAGAAGGCAGAAATTTGAAGAAAATTGAACATGAAACAGGGACCAAGATAACAATCTCATCTTTGCAGGA 962
Query 942 TTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAG 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTTGAGCATATACAACCCGGAAAGAACCATCACTGTGAAGGGCACAGTTGAGGCCTGTGCCAGTGCTGAGATAG 1036
Query 1016 AGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCA 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATTATGAAGAAGCTGCGTGAGGCCTTTGAAAATGATATGCTGGCTGTTAACCAACAAGCCAATCTGATCCCA 1110
Query 1090 GGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGG 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGTTGAACCTCAGCGCACTTGGCATCTTTTCAACAGGACTGTCCGTGCTATCTCCACCAGCAGGGCCCCGCGG 1184
Query 1164 AGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACC 1237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCTCCCCCCGCTGCCCCCTACCACCCCTTCACTACCCACTCCGGATACTTCTCCAGCCTGTACCCCCATCACC 1258
Query 1238 AGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCT 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTTTGGCCCGTTCCCGCATCATCACTCTTATCCAGAGCAGGAGATTGTGAATCTCTTCATCCCAACCCAGGCT 1332
Query 1312 GTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGAT 1385
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGGGCGCCATCATCGGGAAGAAGGGGGCACACATCAAACAGCTGGCGAGATTCGCCGGAGCCTCTATCAAGA- 1405
Query 1386 TGCCCCTGCGGAAGGCCCAGACGTCAGCGAAAGGATGGTCATCATCACCGGGCCACCGGAAGCCCAGTTCAAGG 1459
|.||| ||||| ||||
Sbjct 1406 -------GTGGA-----CAGAC---------AGGA--------------------------------------- 1419
Query 1460 CCCAGGGACGGATCTTTGGGAAACTGAAAGAGGAAAACTTCTTTAACCCCAAAGAAGAAGTGAAGCTGGAAGCG 1533
Sbjct 1420 -------------------------------------------------------------------------- 1419
Query 1534 CATATCAGAGTGCCCTCTTCCACAGCTGGCCGGGTGATTGGCAAAGGTGGCAAGACCGTGAACGAACTGCAGAA 1607
Sbjct 1420 -------------------------------------------------------------------------- 1419
Query 1608 CTTAACCAGTGCAGAAGTCATCGTGCCTCGTGACCAAACGCCAGATGAAAATGAGGAAGTGATCGTCAGAATTA 1681
Sbjct 1420 -------------------------------------------------------------------------- 1419
Query 1682 TCGGGCACTTCTTTGCTAGCCAGACTGCACAGCGCAAGATCAGGGAAATTGTACAACAGGTGAAGCAGCAGGAG 1755
Sbjct 1420 -------------------------------------------------------------------------- 1419
Query 1756 CAGAAATACCCTCAGGGAGTCGCCTCACAGCGCAGCAAG 1794
Sbjct 1420 --------------------------------------- 1419