Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_10887
• Subject: XM_006506374.3
• Aligned Length: 1059
• Identities: 705
• Gaps: 312

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGG---------AGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGTAAGCTCTTTAT  38
                                       .|||         ||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAACTTTAGAAACTGTTCCTTTGGAGAGGAAAAAGAGAGAAAAGGAACAGTTCCGAAAGCTCTTTAT  74

Query   39  TGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGGAACTACTACGAACAATGGGGAAAGCTTACAGACT  112
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  TGGTGGCTTAAGCTTTGAAACCACAGAAGAAAGTTTGAGAAACTACTATGAGCAATGGGGAAAGCTCACAGACT  148

Query  113  GTGTGGTAATGAGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGTTTTGTAACTTTTTCATCCATGGCTGAG  186
            |||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  149  GTGTGGTTATGCGGGATCCTGCAAGCAAAAGATCAAGAGGATTTGGCTTTGTAACTTTCTCATCCATGGCCGAG  222

Query  187  GTTGATGCTGCCATGGCTGCAAGACCTCATTCAATTGATGGGAGAGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAG  260
            |||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTGACGCTGCCATGGCTGCAAGGCCCCATTCCATTGATGGCAGGGTAGTTGAGCCAAAACGTGCTGTAGCAAG  296

Query  261  AGAGGAATCTGGAAAACCAGGGGCTCATGTAACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGCGGAATTAAAGAAGATACTG  334
            ||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  297  AGAGGAGTCTGGAAAACCAGGAGCCCATGTGACTGTGAAGAAGCTGTTTGTTGGTGGAATTAAGGAAGATACTG  370

Query  335  AGGAACATCACCTTAGAGATTACTTTGAGGAATATGGAAAAATTGATACCATTGAGATAATTACTGATAGGCAG  408
            |||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  371  AGGAACACCACCTTAGAGATTACTTTGAAGAGTATGGAAAAATTGATACTATTGAAATAATTACCGATAGGCAG  444

Query  409  TCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATCGTATTGCAGAA  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  445  TCTGGAAAGAAAAGAGGCTTTGGCTTTGTTACTTTTGATGACCATGATCCTGTGGATAAAATTGTCTTGCAAAA  518

Query  483  ATACCATACCATCAATGGTCATAATGCAGAAGTAAGAAAGGCTTTGTCTAGACAAGAAATGC------------  544
            |||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||            
Sbjct  519  ATATCACACCATAAATGGTCACAATGCAGAAGTTAGAAAGGCATTGTCTAGACAAGAAATGCAGGAAGTCCAAA  592

Query  545  --------------------------------------------------------------------------  544
                                                                                      
Sbjct  593  GTTCTAGGAGTGGAAGAGGAGGAAACTTTGGTTTTGGGGATTCTCGTGGTGGCGGTGGCAATTTTGGACCAGGA  666

Query  545  --------------------------------------------------------------------------  544
                                                                                      
Sbjct  667  CCAGGAAGCAACTTTAGGGGGGGATCTGATGGATACGGAAGTGGACGTGGATTTGGGGATGGCTATAATGGGTA  740

Query  545  ---AGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCCGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTG  615
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGAGGAGGACCTGGAGGTGGCAATTTTGGAGGTAGCCCTGGTTATGGAGGAGGAAGAGGAGGATATGGTGGTG  814

Query  616  GAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGGACCTGGATATGGCAACCAGGGTGGGGGCTACGGAGGTGGTTATGACAACTATGGAGGAGGAAATTATGGA  888

Query  690  AGTGGAAATTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAACCTTCTAACTACGGTCCAA----------------  747
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||                
Sbjct  889  AGTGGAAGTTACAATGATTTTGGAAATTATAACCAGCAGCCTTCTAACTATGGTCCAATGAAGAGTGGAAACTT  962

Query  748  --------------------------------------------------------------------------  747
                                                                                      
Sbjct  963  TGGGGGTAGCAGGAACATGGGAGGACCATATGGTGGAGGGAACTATGGTCCTGGAGGAAGTGGAGGAAGTGGTG  1036

Query  748  -----------------------  747
                                   
Sbjct 1037  GCTATGGTGGAAGGAGCAGATAT  1059