Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_11222
• Subject: XM_011247159.2
• Aligned Length: 1869
• Identities: 1648
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCTCCAAAGGTGACTTCAGAGCTGCTTCGGCAGCTGAGACAAGCCATGAGGAACTCTGAGTATGTGACCGA  74
            |||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||||.||.||.|||.|.||
Sbjct    1  ATGGCTCCGAAGGTGACTTCAGAACTGCTTCGGCAGCTGCGACAAGCTATGAGGAACTCCGAATACGTGGCAGA  74

Query   75  ACCGATCCAGGCCTACATCATCCCATCGGGAGATGCTCATCAGAGTGAGTATATTGCTCCATGTGACTGTCGGC  148
            |||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||.
Sbjct   75  ACCCATCCAGGCCTATATCATCCCGTCAGGAGATGCCCACCAGAGCGAGTACATTGCACCCTGTGACTGTCGGA  148

Query  149  GGGCTTTTGTCTCTGGATTCGATGGCTCTGCGGGCACAGCCATCATCACAGAAGAGCATGCAGCCATGTGGACT  222
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  GGGCGTTTGTCTCTGGATTCGATGGCTCTGCAGGCACAGCCATCATCACGGAGGAGCATGCGGCCATGTGGACT  222

Query  223  GACGGGCGCTACTTTCTCCAGGCTGCCAAGCAAATGGACAGCAACTGGACACTTATGAAGATGGGTCTGAAGGA  296
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GACGGGCGCTACTTCCTCCAGGCTGCCAAACAGATGGACAACAACTGGACTCTCATGAAGATGGGTCTGAAAGA  296

Query  297  CACACCAACTCAGGAAGACTGGCTGGTGAGTGTGCTTCCTGAAGGATCCAGGGTTGGTGTGGACCCCTTGATCA  370
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  297  CACACCAACTCAGGAGGACTGGCTGGTGAGTGTGCTTCCAGAAGGATCCAGGGTTGGTGTGGACCCCCTCATCA  370

Query  371  TTCCTACAGATTATTGGAAGAAAATGGCCAAAGTTCTGAGAAGTGCCGGCCATCACCTCATTCCTGTCAAGGAG  444
            ||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||.|||||||.||.||.||||||.|.|||||.||||||
Sbjct  371  TTCCCACAGATTACTGGAAGAAGATGGCCAAGGTACTGCGAAGTGCTGGTCACCACCTCGTGCCTGTGAAGGAG  444

Query  445  AACCTCGTTGACAAAATCTGGACAGACCGTCCTGAGCGCCCTTGCAAGCCTCTCCTCACACTGGGCCTGGATTA  518
            |||||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACCTTGTGGACAAGATCTGGACAGACCGGCCGGAGCGCCCTTGCAAGCCCCTCCTCACACTGGGCCTGGATTA  518

Query  519  CACAGGCATCTCCTGGAAGGACAAGGTTGCAGACCTTCGGTTGAAAATGGCTGAGAGGAACGTCATGTGGTTTG  592
            .|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|.||..||||||||
Sbjct  519  TACAGGCATCTCGTGGAAGGAGAAGGTTGCAGACCTCCGGTTGAAAATGGCAGAGAGGAGCATCGCGTGGTTTG  592

Query  593  TGGTCACTGCCTTGGATGAGATTGCGTGGCTATTTAATCTCCGAGGATCAGATGTGGAGCACAATCCAGTATTT  666
            |.|||||.|||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct  593  TAGTCACAGCCCTAGACGAGATTGCATGGCTGTTCAATCTCCGCGGGTCAGATGTGGAACACAATCCTGTGTTT  666

Query  667  TTCTCCTACGCAATCATAGGACTAGAGACGATCATGCTCTTCATTGATGGTGACCGCATAGACGCCCCCAGTGT  740
            ||||||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.|||||.||..|.||
Sbjct  667  TTCTCCTATGCGATCGTAGGCCTAGAGACGATCATGCTCTTCATTGACGGGGACCGCGTCGACGCGCCGGGCGT  740

Query  741  GAAGGAGCACCTGCTTCTTGACTTGGGTCTGGAAGCCGAATACAGGATCCAGGTGCATCCCTACAAGTCCATCC  814
            ||||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|..||.|||||||||||||
Sbjct  741  GAAGCAGCACCTGCTGCTTGACTTGGGCCTGGAGGCGGAATACAGAATCCAGGTCCTGCCATACAAGTCCATCC  814

Query  815  TGAGCGAGCTCAAGGCCCTGTGTGCTGACCTCTCCCCAAGGGAGAAGGTGTGGGTCAGTGACAAGGCCAGCTAT  888
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  TGAGTGAGCTCAAGGCCCTGTGTGCTGACCTGTCCCCGAGGGAGAAAGTGTGGGTCAGTGACAAGGCCAGCTAC  888

Query  889  GCTGTGAGCGAGACCATCCCCAAGGACCACCGCTGCTGTATGCCTTACACCCCCATCTGCATCGCCAAAGCTGT  962
            ||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  889  GCTGTGAGCGAGGCCATCCCCAAGGATCACCGCTGCTGTATGCCTTACACACCCATCTGCATTGCCAAAGCCGT  962

Query  963  GAAGAATTCAGCTGAGTCAGAAGGCATGAGGCGGGCTCACATTAAAGATGCTGTTGCTCTCTGTGAACTCTTTA  1036
            ||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  963  GAAGAACTCCGCTGAGTCGGACGGCATGAGGCGGGCTCACATTAAAGATGCCGTTGCCCTCTGCGAACTCTTCA  1036

Query 1037  ACTGGCTGGAGAAAGAGGTTCCCAAAGGTGGTGTGACAGAGATCTCAGCTGCTGACAAAGCTGAGGAGTTTCGC  1110
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1037  ACTGGCTGGAGCAAGAGGTTCCCAAAGGTGGCGTTACGGAGATCTCTGCGGCTGACAAGGCCGAGGAATTTCGA  1110

Query 1111  AGGCAACAGGCAGACTTTGTGGACCTGAGCTTCCCAACAATTTCCAGTACGGGACCCAACGGCGCCATCATTCA  1184
            |||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1111  AGGCAGCAGGCTGACTTTGTGGATCTGAGCTTCCCAACGATTTCCAGCACGGGACCCAACGGCGCCATCATCCA  1184

Query 1185  CTACGCGCCAGTCCCTGAGACGAATAGGACCTTGTCCCTGGATGAGGTGTACCTTATTGACTCGGGTGCTCAAT  1258
            ||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1185  CTACGCGCCAGTCCCTGAGACGAACAGGACCCTGTCCCTGGACGAGGTTTACCTCATTGACTCCGGTGCTCAGT  1258

Query 1259  ACAAGGATGGCACCACAGATGTGACGCGGACAATGCATTTTGGGACCCCTACAGCCTACGAGAAGGAATGCTTC  1332
            ||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAAGGATGGAACCACGGACGTCACCCGGACCATGCACTTTGGGACCCCCACTGCCTATGAGAAGGAATGCTTC  1332

Query 1333  ACATATGTCCTCAAGGGCCACATAGCTGTGAGTGCAGCCGTTTTCCCGACTGGAACCAAAGGTCACCTTCTTGA  1406
            |||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1333  ACATACGTACTGAAAGGCCACATAGCTGTGAGCGCAGCTGTTTTCCCGACGGGAACCAAAGGCCACCTTCTGGA  1406

Query 1407  CTCCTTTGCCCGTTCAGCTTTATGGGATTCAGGCCTAGATTACTTGCACGGGACTGGACATGGTGTTGGGTCTT  1480
            ||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||.||||.||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 1407  CTCCTTTGCCCGGTCAGCCTTGTGGGATTCTGGTCTGGATTACCTGCATGGAACAGGACATGGCGTTGGGTCCT  1480

Query 1481  TTTTGAATGTCCATGAGGGTCCTTGCGGCATCAGTTACAAAACATTCTCTGATGAGCCCTTGGAGGCAGGCATG  1554
            ||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481  TTTTGAATGTTCACGAGGGGCCCTGTGGCATCAGTTATAAAACATTCTCCGATGAGCCCTTGGAAGCGGGCATG  1554

Query 1555  ATTGTCACTGATGAGCCCGGGTACTATGAAGATGGGGCTTTTGGAATTCGCATTGAGAATGTTGTCCTTGTGGT  1628
            ||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1555  ATCGTCACTGATGAGCCAGGGTATTACGAAGACGGGGCGTTTGGGATCCGCATTGAGAATGTTGTTCTGGTGGT  1628

Query 1629  TCCTGTGAAGACCAAGTATAATTTTAATAACCGGGGAAGCCTGACCTTTGAACCTCTAACATTGGTTCCAATTC  1702
            .||.|..||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1629  CCCAGCAAAAACCAAGTATAATTTCAACAACCGAGGAAGCCTGACCTTTGAACCTCTAACTTTGGTTCCCATCC  1702

Query 1703  AGACCAAAATGATAGATGTGGATTCTCTTACAGACAAAGAGTGCGACTGGCTCAACAATTACCACCTGACCTGC  1776
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||..|||||||.|||||||
Sbjct 1703  AGACCAAAATGATAGATGTGAATGCTCTTACAGATAAAGAGTGTGACTGGCTCAACAGCTACCACCAGACCTGC  1776

Query 1777  AGGGATGTGATTGGGAAGGAATTGCAGAAACAGGGCCGCCAGGAAGCTCTCGAGTGGCTCATCAGAGAGACGCA  1850
            |||||.|||.||||||||||..||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1777  AGGGACGTGGTTGGGAAGGAGCTGCAGAGCCAGGGCCGCCAGGAAGCTCTCGAGTGGCTCATCAGAGAGACAGA  1850

Query 1851  ACCCATCTCCAAACAGCAT  1869
            .||..||||||..||||||
Sbjct 1851  GCCTGTCTCCAGGCAGCAT  1869