Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12261
• Subject: NM_001286514.2
• Aligned Length: 1269
• Identities: 1093
• Gaps: 164

Alignment

Query    1  MDSLEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEAVYKVKEELLKTDVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIKDKEEVNGI  74
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Sbjct    1  MDSLEEPQKKVFKARKTMRVSDRQQLEAVYKVKEELLKTDVKLLNGNHENGDLDPTSPLENMDYIKDKEEVNGI  74

Query   75  EEICFDPEGSKAEWKETPCILSVNVKNKQDDDLNCEPLSPHNITPEPVSKLPAEPVSGDPAPGDLDAGDPASGV  148
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Sbjct   75  EEICFDPEGSKAEWKETPCILSVNVKNKQDDDLNCEPLSPHNITPEPVSKLPAEPVSGDPAPGDLDAGDPASGV  148

Query  149  LASGDSTSGDPTSSEPSSSDAASGDATSGDAPSGDVSPGDATSGDATADDLSSGDPTSSDPIPGEPVPVEPISG  222
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Sbjct  149  LASGDSTSGDPTSSEPSSSDAASGDATSGDAPSGDVSPGDATSGDATADDLSSGDPTSSDPIPGEPVPVEPISG  222

Query  223  DCAADDIASSEITSVDLASGAPASTDPASDDLASGDLSSSELASDDLATGELASDELTSESTFDRTFEPKSVPV  296
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Sbjct  223  DCAADDIASSEITSVDLASGAPASTDPASDDLASGDLSSSELASDDLATGELASDELTSESTFDRTFEPKSVPV  296

Query  297  CEPVPEIDNIEPSSNKDDDFLEKNGADEKLEQIQSKDSLDEKNKADNNIDANEETLETDDTTICSDRPPENEKK  370
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Sbjct  297  CEPVPEIDNIEPSSNKDDDFLEKNGADEKLEQIQSKDSLDEKNKADNNIDANEETLETDDTTICSDRPPENEKK  370

Query  371  VEEDIITELALGEDAISSSMEIDQGEKNEDETSADLVETINENVIEDNKSENILENTDSMETDEIIPILEKLAP  444
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Sbjct  371  VEEDIITELALGEDAISSSMEIDQGEKNEDETSADLVETINENVIEDNKSENILENTDSMETDEIIPILEKLAP  444

Query  445  SEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMESSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISGEKDESEVISQNETCS  518
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Sbjct  445  SEDELTCFSKTSLLPIDETNPDLEEKMESSFGSPSKQESSESLPKEAFLVLSDEEDISGEKDESEVISQNETCS  518

Query  519  PEVESNEKDNRPEEEEQVIHEDDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNVQSKRRRYMEEEYEAEFQVKITAKGDINQ  592
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Sbjct  519  PEVESNEKDNKPEEEEQVIHEDDERPSEKNEFSRRKRSKSEDMDNVQSKRRRYMEEEYEAEFQVKITAKGDINQ  592

Query  593  KLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFEAAKEDLKKRHEHP  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  KLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKTVLTELQAKIARLTKRFEAAKEDLKKRHEHP  666

Query  667  PNPPVSPGKTVNDVNSNNNMSYRNAGTVRQMLESKRNVSESAPPSFQTPVNTVSSTNLVTPPAVVSSQPKLQTP  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  PNPPVSPGKTVNDVNSNNNMSYRNAGTVRQMLESKRNVSESAPPSFQTPVNTVSSTNLVTPPAVVSSQPKLQTP  740

Query  741  VTSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVTNQPSGNVE  814
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Sbjct  741  VTSGSLTATSVLPAPNTATVVATTQVPSGNPQPTISLQPLPVILHVPVAVSSQPQLLQSHPGTLVTNQPSGNVE  814

Query  815  FISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNPTASAAPLGTTLAVQAVPTAHSIVQATRTSL  888
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Sbjct  815  FISVQSPPTVSGLTKNPVSLPSLPNPTKPNNVPSVPSPSIQRNPTASAAPLGTTLAVQAVPTAHSIVQATRTSL  888

Query  889  PTVGPSGLYSPSTNRGPIQMKIPISAFSTSSAAEQNSNTTPRIENQTNKTIDASVSKKAADSTSQCGKATGSDS  962
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Sbjct  889  PTVGPSGLYSPSTNRGPIQMKIPISAFSTSSAAEQNSNTTPRIENQTNKTIDASVSKKAADSTSQCGKATGSDS  962

Query  963  SGVIDLTMDDEESGASQDPKKLNHTPVSTMSSSQPVSRPLQPIQPAPPLQPSGVPTSGPSQTTIHLLPTAPTTV  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  SGVIDLTMDDEESGASQDPKKLNHTPVSTMSSSQPVSRPLQPIQPAPPLQPSGVPTSGPSQTTIHLLPTAPTTV  1036

Query 1037  NVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSKRFFLYMAPRYM-----  1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..........|.     
Sbjct 1037  NVTHRPVTQVTTRLPVPRAPANHQVVYTTLPAPPAQAPLRGTVMQAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTTTYVVNNGL  1110

Query 1106  --------------------------------------------------------------------------  1105
                                                                                      
Sbjct 1111  TLGSTGPQLTVHHRPPQVHTEPPRPVHPAPLPEAPQPQRLPPEAASTSLPQKPHLKLARVQSQNGIVLSWSVLE  1184

Query 1106  --------------------------------------------------------------------------  1105
                                                                                      
Sbjct 1185  VDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATVPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSKYYFAVRAKDIYGRFGPFCDPQ  1258

Query 1106  -----------  1105
                       
Sbjct 1259  STDVISSTQSS  1269