Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12261
- Subject:
- XM_011520756.3
- Aligned Length:
- 3343
- Identities:
- 2873
- Gaps:
- 464
Alignment
Query 1 ------------------------ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCATCAGGACCAGAGATTCAGAATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC 74
Query 51 GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA 124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA 148
Query 125 AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA 198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA 222
Query 199 GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC 296
Query 273 ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA 346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA 370
Query 347 ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT 444
Query 421 GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC 518
Query 495 CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA 568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA 592
Query 569 CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG 642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG 666
Query 643 GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT 716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT 740
Query 717 GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC 790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC 814
Query 791 TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC 888
Query 865 TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA 938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA 962
Query 939 TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA 1036
Query 1013 AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT 1086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT 1110
Query 1087 CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC 1184
Query 1161 TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG 1234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG 1258
Query 1235 AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT 1332
Query 1309 CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA 1382
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA 1406
Query 1383 TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA 1456
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA 1480
Query 1457 GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT 1530
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT 1554
Query 1531 ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTC---CAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGA 1601
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1555 ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGA 1628
Query 1602 GCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAG 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAG 1702
Query 1676 AAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAG 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAG 1776
Query 1750 ATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGC 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGC 1850
Query 1824 GCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGA 1897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGA 1924
Query 1898 GGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAA 1971
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAA 1998
Query 1972 GATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAG 2045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAG 2072
Query 2046 CAATAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGA 2119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CAATAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGA 2146
Query 2120 GTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTC 2193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTC 2220
Query 2194 AGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAA 2267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAA 2294
Query 2268 TACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGC 2341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGC 2368
Query 2342 CAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTG 2415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTG 2442
Query 2416 ACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAA 2489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAA 2516
Query 2490 TCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTC 2563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTC 2590
Query 2564 AAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCT 2637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 AAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCT 2664
Query 2638 ATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGG 2711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGG 2738
Query 2712 TCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCC 2785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCC 2812
Query 2786 CAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAG 2859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 CAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAG 2886
Query 2860 TGTGGAAAAGCCACTG-GCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTT 2932
||||||||.||...|| ||.|
Sbjct 2887 TGTGGAAATGCTTGTGAGCTG----------------------------------------------------- 2907
Query 2933 CACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTG 3006
Sbjct 2908 -------------------------------------------------------------------------- 2907
Query 3007 CAACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACA 3080
Sbjct 2908 -------------------------------------------------------------------------- 2907
Query 3081 CTTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTG 3154
Sbjct 2908 -------------------------------------------------------------------------- 2907
Query 3155 TACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGA 3228
Sbjct 2908 -------------------------------------------------------------------------- 2907
Query 3229 GGAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTAAGAGATTTTTCTTGTATATGGC 3302
Sbjct 2908 -------------------------------------------------------------------------- 2907
Query 3303 CCCAAGATACATG 3315
Sbjct 2908 ------------- 2907