Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12299
• Subject: XM_006500022.3
• Aligned Length: 1017
• Identities: 840
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGAGTTCCGTCCGGAGATGTGCACAGAGGCTGCCCAGCAGGGACTCCTGCAGTGGCTGTTGAAGAGGCT  74

Query    1  ----------ATGCCTTTTGATGCCAACAAACTGTATTGCAGTGAAGTGCTGGCCATATTGCTCCAGGACAATG  64
                      |||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||..|.|||||||||||||
Sbjct   75  GAAGGCCAAGATGCCCTTCGATGCCAACAAGCTGTACTGTAGTGAAGTGCTGGCCATCCTCCTCCAGGACAATG  148

Query   65  ATGAAAACAGGGAATTGCTTGGGGAGCTGGATGGAATCGATGTGCTTCTTCAGCAGTTATCCGTGTTTAAAAGA  138
            |.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGAAAACAGGGAATTGCTGGGAGAGCTGGATGGCATTGACGTGCTTCTTCAGCAGTTATCCGTATTTAAAAGA  222

Query  139  CACAATCCCAGCACGGCTGAGGAGCAGGAGATGATGGAGAATCTGTTTGATTCCCTCTGCTCCTGTCTAATGCT  212
            |||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|||||..|||||||
Sbjct  223  CACAACCCCAGCACCGCTGAGGAGCAGGAAATGATGGAGAACCTGTTCGATGCGCTCTGTTCCTGCTTAATGCT  296

Query  213  TAGTTCCAATCGTGAGCGCTTCCTGAAGGGCGAGGGTCTTCAGCTGATGAATCTCATGCTCAGGGAAAAGAAGA  286
            .||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||.
Sbjct  297  CAGCTCCAATCGAGAGCGCTTCCTGAAGGGCGAGGGGCTGCAGCTCATGAACCTCATGCTCAGGGAGAAGAAGG  370

Query  287  TCTCCCGGAGCAGTGCCCTGAAAGTGCTGGACCATGCCATGATTGGCCCCGAAGGCACAGACAACTGCCATAAG  360
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TCTCCCGGAGCAGCGCCCTGAAGGTGCTGGACCATGCCATGATTGGGCCTGAAGGCACAGACAACTGCCACAAG  444

Query  361  TTTGTTGACATTCTTGGCTTACGAACCATCTTTCCCCTCTTTATGAAATCTCCCAGGAAGATCAAGAAAGTGGG  434
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||..||||.||||||||.|||||
Sbjct  445  TTTGTTGACATTCTTGGCTTACGGACCATCTTTCCACTCTTCATGAAGTCTCCTCGGAAAATCAAGAAGGTGGG  518

Query  435  AACCACTGAGAAGGAACATGAAGAGCATGTCTGTTCGATCCTGGCTTCCCTCCTGCGGAACCTGAGAGGGCAGC  508
            ||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  AACCACAGAGAAGGAGCATGAAGAGCATGTCTGTTCGATCCTGGCTTCCCTCCTGCGCAACCTGAGAGGGCAGC  592

Query  509  AGCGGACCCGGCTTCTGAATAAATTCACTGAAAATGACAGTGAGAAGGTTGACAGACTAATGGAGTTGCATTTT  582
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  593  AGCGGACCCGGCTTCTGAATAAATTTACGGAGAACGACAGTGAGAAGGTTGACAGACTAATGGAGCTGCATTTT  666

Query  583  AAATATCTGGGTGCAATGCAGGTGGCGGACAAGAAGATTGAAGGGGAAAAACACGACATGGTCCGGCGAGGAGA  656
            ||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct  667  AAATATCTCAGCGCAATGCAGGTGGCCGACAAGAAGATTGAAGGGGAGAAACATGACATAGTGCGGCGTGGGGA  740

Query  657  GATCATCGACAATGACACCGAGGAGGAGTTCTACCTCCGGCGCCTGGATGCGGGGCTCTTTGTTCTCCAGCACA  730
            ||||||.||||||||||..|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|.||.|||||||
Sbjct  741  GATCATAGACAATGACATGGAGGACGAGTTCTACCTGCGGCGCCTGGATGCCGGGCTCTTCATCCTACAGCACA  814

Query  731  TCTGCTACATCATGGCCGAGATCTGCAATGCCAATGTCCCCCAGATTCGCCAGAGGGTTCACCAGATCCTAAAC  804
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  TCTGTTACATCATGGCGGAGATCTGCAATGCCAATGTCCCCCAGATTCGCCAGCGGGTTCACCAGATCCTGAAC  888

Query  805  ATGCGAGGAAGCTCCATCAAAATTGTCAGGCATATCATCAAGGAGTATGCAGAGAACATCGGGGACGGCCGGAG  878
            |||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct  889  ATGCGTGGCAGCTCCATCAAGATCGTCAGGCACATCATCAAGGAGTACGCAGAGAACATTGGAGATGGCCGGAG  962

Query  879  CCCGGAGTTCCGGGAGAACGAGCAAAAGCGCATCCTGGGCTTGCTGGAGAACTTC  933
            |||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct  963  CCCTGAGTTCCGGGAGACCGAGCAGAAGCGCATCCTGGCCTTGTTGGAGAACTTC  1017