Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12439
• Subject: NM_001282934.1
• Aligned Length: 1198
• Identities: 1139
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  -------------------------------------MAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDS  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MPRRRPPASGAAQFPERIATRSPDPIPLCTFQRQVSEMAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDS  74

Query   38  FVLSRARSSLPPNLEIRRLEDGAEGVFAITQLVKRTQFGPFESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNE  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  FVLSRARSSLPPNLEIRRLEDGAEGVFAITQLVKRTQFGPFESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNE  148

Query  112  DDCNWMMLVRPAAEAEHQNLTAYQHGSDVYFTTSRDIPPGTELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQAGSGVHAAGTPE  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  DDCNWMMLVRPAAEAEHQNLTAYQHGSDVYFTTSRDIPPGTELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQAGSGVHAAGTPE  222

Query  186  NSAPVESEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLGHLEQAKSLPPGSQSEAAAPEKEQDTPRGEPPAVPESENVAT  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  NSAPVESEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLGHLEQAKSLPPGSQSEAAAPEKEQDTPRGEPPAVPESENVAT  296

Query  260  KEQKKKPRRGRKPKVSKAEQPLVIVEDKEPTEQVAEIITEVPPDEPVSATPDERIMELVLGKLATTTTDTSSVP  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  KEQKKKPRRGRKPKVSKAEQPLVIVEDKEPTEQVAEIITEVPPDEPVSATPDERIMELVLGKLATTTTDTSSVP  370

Query  334  KFTHHQNNTITLKRSLILSSRHGIRRKVIKQLGEHKRVYQCNICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKL  407
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  KFTHHQNNTITLKRSLILSSRHGIRRKLIKQLGEHKRVYQCNICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKL  444

Query  408  FSRKESLKQHVSYKHSRNEVDGEYRYRCGTCEKTFRIESALEFHNCRT--------------------DDKTFQ  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||
Sbjct  445  FSRKESLKQHVSYKHSRNEVDGEYRYRCGTCEKTFRIESALEFHNCRTGLIAHPGEGGPGGSRLRDLPDDKTFQ  518

Query  462  CEMCFRFFSTNSNLSKHKKKHGDKKFACEVCSKMFYRKDVMLDHQRRHLEGVRRVKREDLEAGGENLVRYKKEP  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CEMCFRFFSTNSNLSKHKKKHGDKKFACEVCSKMFYRKDVMLDHQRRHLEGVRRVKREDLEAGGENLVRYKKEP  592

Query  536  SGCPVCGKVFSCRSNMNKHLLTHGDKKYTCEICGRKFFRVDVLRDHIHVHFKDIALMDDHQREEFIGKIGISSE  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  SGCPVCGKVFSCRSNMNKHLLTHGDKKYTCEICGRKFFRVDVLRDHIHVHFKDIALMDDHQREEFIGKIGISSE  666

Query  610  ENDDNSDESADSEPHKYSCKRCQLTFGRGKEYLKHIMEVHKEKGYGCSICNRRFALKATYHAHMVIHRENLPDP  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ENDDNSDESADSEPHKYSCKRCQLTFGRGKEYLKHIMEVHKEKGYGCSICNRRFALKATYHAHMVIHRENLPDP  740

Query  684  NVQKYIHPCEICGRIFNSIGNLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNVREYLCAECGKGMKT  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  NVQKYIHPCEICGRIFNSIGNLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNVREYLCAECGKGMKT  814

Query  758  KHALRHHMKLHKGIKEYECKECHRRFAQKVNMLKHCKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTMETHKLIHTVGKQWT  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  KHALRHHMKLHKGIKEYECKECHRRFAQKVNMLKHCKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTMETHKLIHTVGKQWT  888

Query  832  CSVCDKKYVTEYMLQKHVQLTHDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDDLDHLPETTTIDAS  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CSVCDKKYVTEYMLQKHVQLTHDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDDLDHLPETTTIDAS  962

Query  906  SIGIVQPELTLEQEDLAEGKHGKAAKRSHKRKQKPEEEAGAPVPEDATFSEYSEKETEFTGSVGDETNSAVQSI  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  SIGIVQPELTLEQEDLAEGKHGKAAKRSHKRKQKPEEEAGAPVPEDATFSEYSEKETEFTGSVGDETNSAVQSI  1036

Query  980  QQVVVTLGDPNVTTPSSSVGLTNITVTPITTAAATQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSILTVTFDTVSGSAM  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  QQVVVTLGDPNVTTPSSSVGLTNITVTPITTAAATQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSILTVTFDTVSGSAM  1110

Query 1054  LHNRQNDVQIHPQPEASNPQSVAHFINLTTLVNSITPLGSQLSDQHPLTWRAVPQTDVLPPPQPQAPPQQAAQP  1127
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1111  LHNRQNDVQIHPQPEASNPQSVAHFINLTTLVNSITPLGSQLSDQHPLTWRAVPQTDVLPPSQPQAPPQQAAQP  1184

Query 1128  QVQAEQQQQQMYSY  1141
            ||||||||||||||
Sbjct 1185  QVQAEQQQQQMYSY  1198