Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12439
• Subject: NM_022115.4
• Aligned Length: 1507
• Identities: 1139
• Gaps: 366

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MPRRRPPASGAAQFPERIATRSPDPIPLCTFQRQPRAAPVQPPCRLFFVTFAGCGHRWRSESKPGWISRSRSGI  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ALRAARPPGSSPPRPAAPRPPPPGGVVAEAPGDVVIPRPRVQPMRVARGGPWTPNPAFREAESWSQIGNQRVSE  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  QLLETSLGNEVSDTEPLSPASAGLRRNPALPPGPFAQNFSWGNQENLPPALGKIANGGGTGAGKAECGYETESH  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  LLEPHEIPLNVNTHKFSDCEFPYEFCTVCFSPFKLLGMSGVEGVWNQHSRSASMHTFLNHSATGIREAGCRKDM  296

Query    1  ----MAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDSFVLSRA---------------------------  43
                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  297  PVSEMAEDGSEEIMFIWCEDCSQYHDSECPELGPVVMVKDSFVLSRARSWPASGHVHTQAGQGMRGYEDRDRAD  370

Query   44  ---------------------------------------RSSLPPNLEIRRLEDGAEGVFAITQLVKRTQFGPF  78
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  PQQLPEAVPAGLVRRLSGQQLPCRSTLTWGRLCHLVAQGRSSLPPNLEIRRLEDGAEGVFAITQLVKRTQFGPF  444

Query   79  ESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNEDDCNWMMLVRPAAEAEHQNLTAYQHGSDVYFTTSRDIPPGT  152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ESRRVAKWEKESAFPLKVFQKDGHPVCFDTSNEDDCNWMMLVRPAAEAEHQNLTAYQHGSDVYFTTSRDIPPGT  518

Query  153  ELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQAGSGVHAAGTPENSAPVESEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLGHLEQAKSL  226
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ELRVWYAAFYAKKMDKPMLKQAGSGVHAAGTPENSAPVESEPSQWACKVCSATFLELQLLNEHLLGHLEQAKSL  592

Query  227  PPGSQSEAAAPEKEQDTPRGEPPAVPESENVATKEQKKKPRRGRKPKVSKAEQPLVIVEDKEPTEQVAEIITEV  300
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  PPGSQSEAAAPEKEQDTPRGEPPAVPESENVATKEQKKKPRRGRKPKVSKAEQPLVIVEDKEPTEQVAEIITEV  666

Query  301  PPDEPVSATPDERIMELVLGKLATTTTDTSSVPKFTHHQNNTITLKRSLILSSRHGIRRKVIKQLGEHKRVYQC  374
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  667  PPDEPVSATPDERIMELVLGKLATTTTDTSSVPKFTHHQNNTITLKRSLILSSRHGIRRKLIKQLGEHKRVYQC  740

Query  375  NICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKLFSRKESLKQHVSYKHSRNEVDGEYRYRCGTCEKTFRIESAL  448
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  NICSKIFQNSSNLSRHVRSHGDKLFKCEECAKLFSRKESLKQHVSYKHSRNEVDGEYRYRCGTCEKTFRIESAL  814

Query  449  EFHNCRTDDKTFQCEMCFRFFSTNSNLSKHKKKHGDKKFACEVCSKMFYRKDVMLDHQRRHLEGVRRVKREDLE  522
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  EFHNCRTDDKTFQCEMCFRFFSTNSNLSKHKKKHGDKKFACEVCSKMFYRKDVMLDHQRRHLEGVRRVKREDLE  888

Query  523  AGGENLVRYKKEPSGCPVCGKVFSCRSNMNKHLLTHGDKKYTCEICGRKFFRVDVLRDHIHVHFKDIALMDDHQ  596
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGENLVRYKKEPSGCPVCGKVFSCRSNMNKHLLTHGDKKYTCEICGRKFFRVDVLRDHIHVHFKDIALMDDHQ  962

Query  597  REEFIGKIGISSEENDDNSDESADSEPHKYSCKRCQLTFGRGKEYLKHIMEVHKEKGYGCSICNRRFALKATYH  670
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  REEFIGKIGISSEENDDNSDESADSEPHKYSCKRCQLTFGRGKEYLKHIMEVHKEKGYGCSICNRRFALKATYH  1036

Query  671  AHMVIHRENLPDPNVQKYIHPCEICGRIFNSIGNLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNVR  744
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AHMVIHRENLPDPNVQKYIHPCEICGRIFNSIGNLERHKLIHTGVKSHACEQCGKSFARKDMLKEHMRVHDNVR  1110

Query  745  EYLCAECGKGMKTKHALRHHMKLHKGIKEYECKECHRRFAQKVNMLKHCKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTME  818
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  EYLCAECGKGMKTKHALRHHMKLHKGIKEYECKECHRRFAQKVNMLKHCKRHTGIKDFMCELCGKTFSERNTME  1184

Query  819  THKLIHTVGKQWTCSVCDKKYVTEYMLQKHVQLTHDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDD  892
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  THKLIHTVGKQWTCSVCDKKYVTEYMLQKHVQLTHDKVEAQSCQLCGTKVSTRASMSRHMRRKHPEVLAVRIDD  1258

Query  893  LDHLPETTTIDASSIGIVQPELTLEQEDLAEGKHGKAAKRSHKRKQKPEEEAGAPVPEDATFSEYSEKETEFTG  966
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  LDHLPETTTIDASSIGIVQPELTLEQEDLAEGKHGKAAKRSHKRKQKPEEEAGAPVPEDATFSEYSEKETEFTG  1332

Query  967  SVGDETNSAVQSIQQVVVTLGDPNVTTPSSSVGLTNITVTPITTAAATQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSI  1040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  SVGDETNSAVQSIQQVVVTLGDPNVTTPSSSVGLTNITVTPITTAAATQFTNLQPVAVGHLTTPERQLQLDNSI  1406

Query 1041  LTVTFDTVSGSAMLHNRQNDVQIHPQPEASNPQSVAHFINLTTLVNSITPLGSQLSDQHPLTWRAVPQTDVLPP  1114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  LTVTFDTVSGSAMLHNRQNDVQIHPQPEASNPQSVAHFINLTTLVNSITPLGSQLSDQHPLTWRAVPQTDVLPP  1480

Query 1115  PQPQAPPQQAAQPQVQAEQQQQQMYSY  1141
            .||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  SQPQAPPQQAAQPQVQAEQQQQQMYSY  1507