Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12439
Subject:
XM_006522870.3
Aligned Length:
3440
Identities:
2921
Gaps:
28

Alignment

Query    1  ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG  74
            ||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct    1  ATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTG  74

Query   75  TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA  148
            |||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|
Sbjct   75  TCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTTGTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTA  148

Query  149  ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG  222
            ||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct  149  ACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGTGTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAA  222

Query  223  TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA  296
            ||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  TTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGAAAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAA  296

Query  297  GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG  370
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..
Sbjct  297  GGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCAC  370

Query  371  CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC  444
            .||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.
Sbjct  371  TGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATT  444

Query  445  CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA  518
            ||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  CCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCA  518

Query  519  GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG  592
            ||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||
Sbjct  519  GGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGG  592

Query  593  CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA  666
            .||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||.|||
Sbjct  593  TGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAA  666

Query  667  GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGG  737
            |||||||||||.|||.||||..|||| .|||  |||   ||||||.|.||||||||||..||..|||||.||..
Sbjct  667  GCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGAT  737

Query  738  GGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCC  797
            |||.||.||..|||...||||||||.|||              |||  |.|||||||||.|..|||||||||||
Sbjct  738  GGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCC  809

Query  798  TCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAG  871
            ||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||..|||
Sbjct  810  TCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAG  883

Query  872  AGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATG  945
            ||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  884  AGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATG  957

Query  946  GAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAA  1019
            |||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|.
Sbjct  958  GAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAG  1031

Query 1020  TAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGC  1093
            .|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...||||
Sbjct 1032  CAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGC  1105

Query 1094  TCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGG  1167
            |.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1106  TGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGG  1179

Query 1168  CACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCT  1241
            ||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1180  CACGTGCGCTCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCT  1253

Query 1242  AAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTG  1315
            |||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||..||||
Sbjct 1254  AAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTG  1327

Query 1316  AGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAG  1389
            .||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  GGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAG  1401

Query 1390  ATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGC  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1402  ATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGC  1475

Query 1464  CTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAG  1537
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.|
Sbjct 1476  CTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTG  1549

Query 1538  TGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGG  1611
            |||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1550  TGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGA  1623

Query 1612  TGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAA  1685
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1624  TGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAA  1697

Query 1686  GTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCA  1759
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698  GTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCA  1771

Query 1760  AGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAAC  1833
            |||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1772  AGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAAT  1845

Query 1834  GATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGG  1907
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 1846  GATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGG  1919

Query 1908  CCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACC  1981
            |||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.|||
Sbjct 1920  CCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACC  1993

Query 1982  GGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTG  2055
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1994  GACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTG  2067

Query 2056  CAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCT  2129
            |||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 2068  CAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACT  2141

Query 2130  CATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGG  2203
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2142  CATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAG  2215

Query 2204  AGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCAC  2277
            ||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2216  AGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCAT  2289

Query 2278  GCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGC  2351
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||
Sbjct 2290  GCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGC  2363

Query 2352  GCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGA  2425
            .|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364  ACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGA  2437

Query 2426  AGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCC  2499
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2438  AGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCC  2511

Query 2500  GTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGC  2573
            |||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 2512  GTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGC  2585

Query 2574  GCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACC  2647
            .|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||
Sbjct 2586  ACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACC  2659

Query 2648  CCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATT  2721
            |||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2660  CCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATC  2733

Query 2722  GGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCG  2795
            |||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2734  GGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCG  2807

Query 2796  AAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAAT  2869
            .||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||
Sbjct 2808  CAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAAT  2881

Query 2870  ACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAG  2943
            ||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 2882  ACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAG  2955

Query 2944  GTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGAC  3017
            ||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 2956  GTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGAC  3029

Query 3018  CCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTG  3091
            |||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||.|||||
Sbjct 3030  CCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTG  3103

Query 3092  AACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCAC  3165
            |.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 3104  ATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCAC  3177

Query 3166  AACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAA  3239
            |||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 3178  AACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAA  3251

Query 3240  CCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGG  3313
            |||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 3252  CCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAG  3325

Query 3314  CAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTG  3387
            |||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.||||||||||..||.||||||||.
Sbjct 3326  CAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTA  3399

Query 3388  CAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
            |      ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3400  C------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3429