Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12439
- Subject:
- XM_006522870.3
- Aligned Length:
- 3440
- Identities:
- 2921
- Gaps:
- 28
Alignment
Query 1 ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATG 74
||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1 ATGGCTGAAGATGGTAGTGAGGAGATCATGTTTATCTGGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCATGACTCGGAGTG 74
Query 75 TCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCCTTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCA 148
|||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.||..|.|
Sbjct 75 TCCTGAACTGGGACCTGTGGTCATGGTCAAGGACTCCTTTGTGCTGAGCAGGGCAAGGTCCTCCCTCCCCTCTA 148
Query 149 ACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGGGGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAG 222
||.||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||.||..|.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 149 ACCTGGAGATCAGGCGCCTGGATGACGGGGCTGAAGGCGTGTTTGCAGTGACCCAGCTAGTCAAGCGCACACAA 222
Query 223 TTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGGAAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAA 296
||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 223 TTTGGTCCGTTTGAGTCCAGGAGAGTCGCCAAGTGGGAGAAAGAGTCGGCATTTCCTCTGAAGGTATTTCAGAA 296
Query 297 GGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGG 370
|||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||..
Sbjct 297 GGACGGGCATCCTGTGTGCTTCGACACTTCCAATGAGGATGACTGCAACTGGATGATGCTAGTGCGACCAGCAC 370
Query 371 CGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCACGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATC 444
.||||.|.|.|||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..|||||.
Sbjct 371 TGGAGCCTGGGCACCAGAACCTGACAGCCTACCAACATGGCAGTGACGTGTATTTCACCACCTCAAAGGACATT 444
Query 445 CCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCTTCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCA 518
||..|.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 CCTGCAGGCACTGAACTGCGTGTGTGGTATGCTGCCTTTTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTAAAGCA 518
Query 519 GGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAAAACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGG 592
||||.||||..|.||.||.||||||||||||||.||...|||.|.|.|.|||||..|.||.|...||||.||||
Sbjct 519 GGCCTGCTCCAGTGTTCAGGCTGCAGGCACCCCTGAGCCCAGTGTCTCTGTGGAACCTGAGCGTGGCCAATGGG 592
Query 593 CGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCAGCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAA 666
.||||||.|||||.||...|||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||..|.||.|||
Sbjct 593 TGTGTAAGGTGTGCTCCAACACCTTCCTGGAGCTTCAGCTCCTGAACGAGCATCTCTTGGGCCATCTGGAGCAA 666
Query 667 GCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCA-AAGC--GAGGCAGCAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGG 737
|||||||||||.|||.||||..|||| .||| ||| ||||||.|.||||||||||..||..|||||.||..
Sbjct 667 GCCAAAAGCCTCCCTGCAGGTGGCCAGCAGCATGAG---GCAGCTTCTGAGAAGGAGCCTGATGCACCCAGGAT 737
Query 738 GGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGA--------------ATGTTGCCACCAAAGAACAGAAGAAAAAGCC 797
|||.||.||..|||...||||||||.||| ||| |.|||||||||.|..|||||||||||
Sbjct 738 GGAGCCTCCCACAGCAGCCGAGAGCAAGAGCATCCAGAGTGTCATG--GTCACCAAAGAGCCAAAGAAAAAGCC 809
Query 798 TCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGTGGAAGACAAGGAACCCACAG 871
||||||.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||.|||||..|..||||||||||.||..|||
Sbjct 810 TCGAAGAGGGAGGAAACCCAAAGCATCCAAGGTTGAGCAGCCTCTGGTCATTATCAAAGACAAGGAGCCTTCAG 883
Query 872 AGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAACGCCAGATGAGCGGATCATG 945
||||.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 884 AGCATGTGGCAGAGATCATAACTGAGATCCCCCCAGATGAGCCTGTGAGTGCAACACCAGATGAACGGATCATG 957
Query 946 GAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCAAAGTTCACCCATCATCAGAA 1019
|||.|.||..||||||||||||||.||.||||.|.|||..|||||||.||.|||||||||.|.|||||||..|.
Sbjct 958 GAGTTAGTCTTGGGGAAGCTGGCCGCCCCCACAAATGAAGCCAGCTCAGTGCCAAAGTTCCCACATCATCCAAG 1031
Query 1020 TAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCGGCGCAAGGTCATCAAACAGC 1093
.|.||||||..|.|||||||||.||||..||||.||.||||||||.|||.|||||||.|||.||.||...||||
Sbjct 1032 CAGCACCATTGCCCTCAAGAGGGGCTTGGTTCTGTCCAGCAGACATGGCGTCCGGCGGAAGCTCGTCCGTCAGC 1105
Query 1094 TCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCAGG 1167
|.||.|||||.||.||..|..|.|||||....|.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1106 TGGGTGAGCATAAACGCATCCATCAGTGTGGCACCTGCAGCAAGGTCTTCCAGAACAGCAGCAACCTGAGCCGG 1179
Query 1168 CACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTGTTCAGCCGCAAAGAGAGCCT 1241
||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||.|.|||.||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1180 CACGTGCGCTCGCACGGGGACAAGCTGTTTAAATGTGAGGAATGTTCGAAACTGTTCAGCCGTAAGGAAAGTCT 1253
Query 1242 AAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAGGTACCGCTGCGGCACTTGTG 1315
|||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||..||||
Sbjct 1254 AAAGCAGCATGTTTCCTACAAGCACAGCCGGAATGAGGTGGACGGTGAGTACCGCTACCGCTGTGGCAGCTGTG 1327
Query 1316 AGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAG 1389
.||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 GGAAGACATTCCGAATGGAGAGTGCACTGGAGTTCCACAACTGTAGGACAGATGACAAGACGTTCCAATGTGAG 1401
Query 1390 ATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAAGTTTGC 1463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1402 ATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCTAAGCACAAGAAGAAACATGGGGACAAGAAGTTTGC 1475
Query 1464 CTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGGAAGGAG 1537
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.|||.||||.||.|
Sbjct 1476 CTGTGAGGTCTGCAGTAAGATGTTCTACCGCAAGGATGTTATGCTGGACCACCAGAGGCGACACTTGGATGGTG 1549
Query 1538 TGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCTTCCGGG 1611
|||||||.||||||.||||.|||.||||||||.|.|||||.|.||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1550 TGCGGCGGGTGAAGAGAGAAGACTTGGAGGCCAGCGGGGAAAGCCTGGTTCGTTACAAGAAGGAACCTTCTGGA 1623
Query 1612 TGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGACAAGAA 1685
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1624 TGCCCAGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGTCGGAGCAACATGAACAAGCACCTGCTGACCCACGGTGACAAGAA 1697
Query 1686 GTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCA 1759
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 GTACACCTGCGAGATCTGTGGGCGCAAGTTCTTCCGAGTGGACGTACTCAGGGACCACATCCATGTCCACTTCA 1771
Query 1760 AGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAAGAAAAC 1833
|||||||||||.|.|||||||||||||||.||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1772 AGGACATCGCGCTAATGGATGACCACCAGCGGGAGGAGTTCATTGGCAAAATTGGGATCTCCTCAGAGGAGAAT 1845
Query 1834 GATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCACCTTCGG 1907
||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 1846 GATGACAACTCTGATGAGAGCGCAGACTCTGAGCCACACAAGTACAGCTGCAAGAGGTGCCAGCTCACTTTCGG 1919
Query 1908 CCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCTGCAACC 1981
|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.|||
Sbjct 1920 CCGTGGGAAGGAATACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCCACGGCTGCAGCATCTGCCACC 1993
Query 1982 GGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCCAACGTG 2055
|.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1994 GACGCTTCGCACTCAAGGCCACCTACCATGCCCACATGGTCATCCACCGGGAGAACCTGCCTGACCCCAACGTG 2067
Query 2056 CAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCACAAGCT 2129
|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.||
Sbjct 2068 CAGAAGTACATTCACCCCTGTGAGATCTGTGGGAGGATATTCAACAGCATTGGGAACTTGGAGCGCCACAAACT 2141
Query 2130 CATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAGG 2203
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2142 CATCCACACAGGTGTGAAAAGCCACGCCTGTGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGCTGAAAG 2215
Query 2204 AGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACCAAGCAC 2277
||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2216 AGCACATGCGTGTGCATGACAACATCCGGGAGTACCTGTGCGCCGAGTGTGGGAAAGGTATGAAGACCAAGCAT 2289
Query 2278 GCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAGGTTCGC 2351
||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.|||.||
Sbjct 2290 GCACTGCGCCACCATATGAAGCTGCACAAAGGCATCAAGGAGTATGAGTGCAAGGAATGTCACCGCAAGTTTGC 2363
Query 2352 GCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGTGTGGGA 2425
.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 ACAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTACAAACGGCACACAGGAATTAAAGACTTCATGTGTGAATTGTGTGGGA 2437
Query 2426 AGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACGTGCTCC 2499
||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2438 AGACATTCAGTGAGAGGAACACAATGGAGACACACAAGCTCATCCACACAGTAGGCAAGCAGTGGACTTGTTCC 2511
Query 2500 GTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGTGGAGGC 2573
|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 2512 GTGTGTGACAAGAAGTACGTCACAGAGTACATGCTTCAGAAACACGTCCAGCTCACTCATGACAAGGTGGAAGC 2585
Query 2574 GCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCAAGCACC 2647
.|||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||
Sbjct 2586 ACAGAGTTGCCAACTATGTGGCACCAAAGTGTCAACCCGGGCCTCCATGAGCAGACATATGCGACGCAAGCACC 2659
Query 2648 CCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCCTCCATT 2721
|||||||.|||||.||..||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2660 CCGAGGTCCTCGCTGTTCGGATTGACGATCTGGACCACCTCCCCGAGACCACCACCATCGATGCATCTTCCATC 2733
Query 2722 GGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGCCAAGCG 2795
|||||.||||||||||.||||...|||||||||||.||..||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2734 GGCATTGTCCAGCCTGCGCTGGGCCTGGAGCAGGAAGAACTGGCAGAAGGTAAGCATGGAAAGGCTGCCAAGCG 2807
Query 2796 AAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCAGCGAAT 2869
.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||..||||||||||.||||
Sbjct 2808 CAGCCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAGGAAGAGGCAGGGGCTCCAGTGCCTGAGGATACCACCTTCAGTGAAT 2881
Query 2870 ACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATTCAGCAG 2943
||.|.||.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 2882 ACCCCGAAAAGGAGCCAGAGTTCACAGGCAGTGTGGGTGACGAGACAAATTCTGCTGTACAGAGTATCCAACAG 2955
Query 2944 GTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCACCGTGAC 3017
||.|||||||||||.||.|||||.||||||||..|.|||||.||||||||.||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 2956 GTGGTGGTGACCCTAGGGGACCCCAATGTGACTGCTCCATCAAGCTCAGTTGGTCTAACCAACATCACCGTGAC 3029
Query 3018 CCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCACCCCTG 3091
|||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||.|.|||||.|||||.||.||.||.|||||||.|||||
Sbjct 3030 CCCCATCACCACTGCAGCTGGAACTCAGTTTACCAATTTACAGCCAGTGGCTGTTGGACATCTTACCAACCCTG 3103
Query 3092 AACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATGTTGCAC 3165
|.||||||.|||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 3104 ATCGCCAGCTACAGCTAGATAACTCCATCCTGACTGTGACCTTTGATACTGTCAGTGGCTCCGCCATGTTGCAC 3177
Query 3166 AACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTTCATCAA 3239
|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 3178 AACCGGCAAAATGATGTCCAGATCCACCCACAGCCAGAAGCCACAAACCCTCAGTCAGTGGCCCACTTTATCAA 3251
Query 3240 CCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGTGGCGGG 3313
|||.||.||.|||||.|||||||||||.|||.||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 3252 CCTTACCACACTGGTAAACTCCATCACACCCTTGGGGAACCAACTCAGTGAGCAGCACCCACTCACCTGGCGAG 3325
Query 3314 CAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCCCAGGTG 3387
|||||||||||||.||.||..|||..||.||.|||.|.|..|||.||||.||||||||||..||.||||||||.
Sbjct 3326 CAGTGCCCCAGACAGATGTGCTGCAGCCGCCACAGGCCCCTGCAGCCCCGCAGCAGGCGGTGCAACCCCAGGTA 3399
Query 3388 CAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3423
| ||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 3400 C------AGAATGAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC 3429