Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12439
• Subject: XM_006724039.2
• Aligned Length: 3594
• Identities: 3286
• Gaps: 303

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCCGCCGCCGCCCCCCGGCTTCCGGTGCTGCGCAGTTTCCGGAGCGGATCGCAACCCGGAGTCCGGATCC  74

Query    1  -------------------------------------ATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCT  37
                                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCCCGCTCTGCACATTCCAAAGGCAGGTGTCAGAGATGGCTGAAGATGGGAGCGAAGAGATCATGTTCATCT  148

Query   38  GGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCC  111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTGTGAAGACTGCAGCCAGTACCACGACTCCGAATGTCCCGAGCTGGGCCCAGTGGTCATGGTCAAAGACTCC  222

Query  112  TTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGG  185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGTGTTAAGCAGGGCAAGGTCATCCCTTCCTCCCAACTTGGAGATCAGACGACTGGAAGATGGAGCCGAGGG  296

Query  186  GGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGG  259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGTTCGCCATCACTCAGCTCGTCAAGCGGACACAGTTCGGTCCCTTTGAGTCCAGGAGGGTCGCCAAATGGG  370

Query  260  AAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAG  333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAAGGAGTCTGCATTTCCCCTGAAGGTGTTCCAGAAGGACGGGCACCCCGTGTGCTTCGACACCTCCAACGAG  444

Query  334  GATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCA  407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGACTGCAACTGGATGATGCTGGTGCGGCCAGCGGCGGAGGCCGAGCACCAGAACCTGACGGCCTACCAGCA  518

Query  408  CGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCT  481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGCAGCGACGTGTACTTCACCACCTCCAGAGACATCCCCCCGGGTACCGAGCTGCGCGTGTGGTATGCGGCCT  592

Query  482  TCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAA  555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTATGCCAAGAAGATGGACAAGCCCATGCTGAAGCAGGCCGGCTCTGGCGTCCACGCTGCAGGCACCCCAGAA  666

Query  556  AACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAACCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCA  629
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACAGCGCCCCCGTGGAGTCGGAGCCCAGCCAGTGGGCGTGTAAAGTGTGTTCTGCCACCTTCCTGGAGCTGCA  740

Query  630  GCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAG  703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTCCTCAATGAACATCTGTTGGGCCACTTAGAACAAGCCAAAAGCCTTCCTCCAGGCAGCCAAAGCGAGGCAG  814

Query  704  CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACC  777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCTCCCGAGAAGGAGCAGGACACACCCCGGGGGGAACCCCCTGCAGTGCCCGAGAGCGAGAATGTTGCCACC  888

Query  778  AAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGT  851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGAACAGAAGAAAAAGCCTCGAAGGGGGAGAAAACCCAAAGTGTCCAAAGCTGAGCAGCCTCTAGTCATCGT  962

Query  852  GGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAA  925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAGACAAGGAACCCACAGAGCAAGTGGCAGAGATCATTACCGAGGTCCCTCCGGATGAGCCTGTGAGTGCAA  1036

Query  926  CGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCA  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGCCAGATGAGCGGATCATGGAGCTGGTTCTGGGGAAGCTGGCCACCACCACCACTGACACCAGCTCGGTTCCA  1110

Query 1000  AAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCG  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAGTTCACCCATCATCAGAATAACACCATCACGCTCAAGAGGAGCTTAATTCTCTCAAGCAGACACGGCATCCG  1184

Query 1074  GCGCAAGGTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGA  1147
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCGCAAGCTCATCAAACAGCTCGGGGAGCACAAGCGGGTTTACCAGTGCAATATCTGCAGCAAGATCTTCCAGA  1258

Query 1148  ACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTG  1221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGCAGCAACCTGAGCAGGCACGTGCGCTCGCATGGTGACAAGCTGTTTAAGTGCGAAGAGTGTGCAAAATTG  1332

Query 1222  TTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAG  1295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTCAGCCGCAAAGAGAGCCTAAAGCAGCACGTTTCCTACAAGCACAGCAGGAACGAGGTGGACGGCGAGTACAG  1406

Query 1296  GTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGA------  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 1407  GTACCGCTGCGGCACTTGTGAGAAGACCTTCCGCATCGAGAGCGCGCTGGAGTTCCACAACTGCAGGACAGGAC  1480

Query 1364  ------------------------------------------------------CAGATGACAAGACGTTCCAA  1383
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCATAGCACACCCTGGAGAGGGGGGGCCCGGCGGCAGTCGGCTTAGAGACCTACCAGATGACAAGACGTTCCAA  1554

Query 1384  TGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAA  1457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTGAGATGTGTTTCAGATTCTTCTCCACCAACAGCAACCTCTCCAAGCACAAGAAGAAGCACGGCGACAAGAA  1628

Query 1458  GTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGG  1531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTTTGCCTGTGAGGTCTGCAGCAAGATGTTCTACCGCAAGGACGTCATGCTGGACCACCAGCGCCGGCACCTGG  1702

Query 1532  AAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCT  1605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGGAGTGCGGCGAGTGAAGCGAGAGGACCTGGAGGCCGGTGGGGAGAACCTGGTCCGTTACAAGAAGGAGCCT  1776

Query 1606  TCCGGGTGCCCGGTGTGTGGCAAGGTGTTCTCCTGCCGGAGCAATATGAACAAGCACCTGCTCACCCACGGCGA  1679
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct 1777  TCCGGGTGCCCGGTGTGTGG------------------------------------------------------  1796

Query 1680  CAAGAAGTACACCTGCGAGATCTGCGGGCGCAAGTTCTTCCGCGTGGATGTGCTCAGGGACCACATCCATGTCC  1753
                                                                                      
Sbjct 1797  --------------------------------------------------------------------------  1796

Query 1754  ACTTCAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAA  1827
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1797  ----CAAGGACATCGCGTTGATGGATGACCACCAGAGGGAAGAGTTTATCGGCAAGATCGGGATCTCCTCGGAA  1866

Query 1828  GAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCAC  1901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  GAAAACGATGACAATTCTGACGAGAGCGCAGACTCGGAGCCTCACAAGTACAGCTGCAAGCGGTGCCAGCTCAC  1940

Query 1902  CTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCT  1975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941  CTTCGGCCGGGGGAAGGAGTACCTGAAGCACATCATGGAGGTGCACAAGGAGAAGGGCTATGGCTGCAGCATCT  2014

Query 1976  GCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCC  2049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015  GCAACCGGCGCTTTGCACTGAAGGCCACCTACCACGCCCACATGGTCATCCACCGTGAAAACCTGCCGGACCCC  2088

Query 2050  AACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCA  2123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089  AACGTGCAGAAGTACATCCACCCCTGCGAGATCTGCGGGCGGATCTTCAACAGCATCGGGAACCTGGAGCGCCA  2162

Query 2124  CAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGC  2197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163  CAAGCTCATCCACACAGGTGTGAAGAGCCACGCCTGCGAGCAGTGTGGGAAGTCCTTTGCCAGGAAGGACATGC  2236

Query 2198  TGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAACGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACC  2271
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237  TGAAGGAGCACATGCGTGTGCACGACAATGTCCGCGAGTACCTGTGTGCCGAGTGTGGGAAAGGCATGAAGACC  2310

Query 2272  AAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAG  2345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311  AAGCACGCGCTGCGCCACCACATGAAGCTGCACAAGGGCATCAAGGAGTACGAGTGCAAGGAGTGCCACCGCAG  2384

Query 2346  GTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGT  2419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385  GTTCGCGCAGAAGGTCAACATGCTCAAGCACTGCAAGCGGCACACGGGGATTAAAGATTTCATGTGTGAATTGT  2458

Query 2420  GTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACG  2493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459  GTGGGAAGACATTCAGCGAGAGGAACACCATGGAGACCCACAAGCTCATCCACACAGTGGGCAAGCAGTGGACG  2532

Query 2494  TGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGT  2567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533  TGCTCCGTGTGCGACAAGAAGTACGTGACCGAGTACATGCTGCAGAAGCACGTTCAGCTCACACACGACAAGGT  2606

Query 2568  GGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCA  2641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2607  GGAGGCGCAGAGCTGCCAGCTGTGCGGGACCAAGGTGTCCACCAGGGCCTCCATGAGCCGACACATGCGGCGCA  2680

Query 2642  AGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCC  2715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2681  AGCACCCCGAGGTGCTCGCGGTGAGGATCGATGACCTGGACCACCTCCCGGAGACCACCACCATCGACGCCTCC  2754

Query 2716  TCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGC  2789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755  TCCATTGGCATCGTCCAGCCTGAGCTGACTCTGGAGCAGGAGGATTTGGCCGAAGGGAAGCACGGGAAAGCTGC  2828

Query 2790  CAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCA  2863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829  CAAGCGAAGTCACAAGAGAAAGCAGAAGCCAGAAGAGGAGGCGGGTGCTCCGGTGCCCGAGGACGCCACCTTCA  2902

Query 2864  GCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATT  2937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2903  GCGAATACTCAGAGAAAGAGACGGAGTTCACAGGCAGTGTAGGCGACGAGACCAATTCCGCAGTACAGAGCATT  2976

Query 2938  CAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTGACCAACATCAC  3011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2977  CAGCAGGTAGTGGTGACCCTGGGTGACCCAAATGTGACCACACCATCGAGCTCAGTCGGCTTAACCAACATCAC  3050

Query 3012  CGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCA  3085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051  CGTGACCCCCATCACCACTGCGGCCGCGACTCAGTTTACCAATCTCCAGCCGGTGGCCGTGGGGCACCTTACCA  3124

Query 3086  CCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATG  3159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3125  CCCCTGAACGCCAGTTACAGCTGGACAACTCAATCCTGACCGTGACCTTTGATACCGTCAGCGGCTCTGCCATG  3198

Query 3160  TTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTT  3233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3199  TTGCACAACCGCCAAAATGACGTCCAGATCCACCCCCAGCCGGAAGCCTCGAACCCACAGTCTGTGGCCCATTT  3272

Query 3234  CATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGT  3307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3273  CATCAACCTGACGACCCTGGTCAACTCCATCACGCCCCTGGGGAGCCAGCTTAGTGACCAGCACCCGCTCACGT  3346

Query 3308  GGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCCCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCC  3381
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3347  GGCGGGCAGTGCCCCAGACTGACGTCTTGCCACCCTCGCAGCCGCAGGCACCCCCACAGCAGGCGGCCCAGCCC  3420

Query 3382  CAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3421  CAGGTGCAGGCGGAGCAGCAGCAGCAGCAGATGTACAGCTAC  3462